Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,413,968 | A→G | 5.5% | intergenic (‑41/+16) | ralR ← / ← recT | Rac prophage; endodeoxyribonuclease toxin RalR/Rac prophage; recombinase, DNA renaturation |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,413,968 | 0 | A | G | 5.5% | 568.4 / 13.9 | 181 | intergenic (‑41/+16) | ralR/recT | Rac prophage; endodeoxyribonuclease toxin RalR/Rac prophage; recombinase, DNA renaturation |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (71/100); new base G (3/7); total (74/107) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.30e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
TCGGGATTCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGA > NC_000913/1413820‑1414117 | cGGGATTCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTaca < 2:1218965/150‑1 (MQ=255) ggATTCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACAcc < 2:2009083/150‑1 (MQ=255) tCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCa < 2:1644881/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |