Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,426,418 | T→G | 6.7% | intergenic (+438/‑36) | ydaY → / → ynaA | Rac prophage; putative uncharacterized protein YdaY/Rac prophage; putative prophage tail length tape measure domain‑containing protein YnaA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,426,418 | 0 | T | G | 6.7% | 765.0 / 37.8 | 255 | intergenic (+438/‑36) | ydaY/ynaA | Rac prophage; putative uncharacterized protein YdaY/Rac prophage; putative prophage tail length tape measure domain‑containing protein YnaA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (121/117); new base G (11/6); total (132/123) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.21e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.22e-01 |
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
TTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACTATTATGTCGCCTGAAACCCACTTCGCGGTGGGTTTTTTGTTGTCAGGAGTTTTAATAAATGGCAGAGCAAACCTCGCGTCTCGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCATTAGTCAAAATGACGCAGGCTGGGGAAACTGCT > NC_000913/1426269‑1426567 | ttCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACTATTATGTCGCCTGAAACCCACtt > 2:1764903/1‑150 (MQ=255) ttCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACTATTATGTCGCCTGAAACCCACtt > 2:1492414/1‑150 (MQ=255) tCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACTATTATGTCGCCTGAAACCCACTTc > 1:2090095/1‑150 (MQ=255) 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acaaaaaaCCCACCGCGAAGTGGGTTTTTTGTTGTCAGGAGTTTTAATAAATGGCAGCGCAAACCTCGCGTCTCGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAATATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCATTAGTCAAAATGCCGCAgg > 1:1709182/6‑150 (MQ=255) acaaaaaaCCCACCGCGAAGTGGGTTTTTTGTTGTCAGGAGTTTTAATAAATGGCAGAGCAAACCTCGCGTCTCGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAATATAATGCTGACAATATGACATCATCATTAGGCAAAATGAAGCAgg > 1:759598/6‑150 (MQ=255) acaaaaaaCCCACCGCGAAGTGGGTTTTTTGTTGTCAGGAGTTTTAATAAATGGCAGAGCAAACCTCGCGTCTCGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCATTAGTCAAAATGACGCAgg > 2:124633/6‑150 (MQ=255) ccTGAAACCCACTTCGCGGTGGGTTTTTTGTTGTCAGGAGTTTTAATAAATGGCAGAGCAAACCTCGCGTCTCGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCATTAGTCAAAATGACGCAGGc < 1:1658222/150‑1 (MQ=255) cTGAAACCCACTTCGCGGTGGGTTTTTTGTTGTCAGGAGTTTTAATAAATGGCAGAGCAAACCTCGCGTCTCGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAAACTGACCTCCTCATTAGTCAAAATGACGCAGGCt > 2:87230/1‑150 (MQ=255) cTGAAACCCACATCGCTGTTGGTTTTTTGTTGTCAGGAGTTTTAATAAATGGCAGAGCAAACCTCGCGTCTCGCAATAATTATTGATACCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCATTAGTCAAAATGACGCAGGCt < 1:834153/150‑1 (MQ=255) aaaaaaCCCACCGCGAAGTGGGTTTTTTGTTGTCAGGAGTTTTAATAAATGGCAGAGCAAACCTCGCGTCTCGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCATTAGTCAAAATGACGCAGGCt > 1:922074/4‑150 (MQ=255) aaaCCCACTTCGCGGTGGGTTTTTTGTTGTCAGGAGTTTTAATAAATGGCAGAGCAAACCTCGCGTCTCGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCATTAGTCAAAATGACGCAGGCTggg > 1:308173/1‑150 (MQ=255) aCTTCGCGGTGGGTTTTTTGTTGTCAGGAGTTTTAATAAATGGCAGAGCAAACCTCGCGTCTCGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCATTAGTCAAAATGACGCAGGCTGGGGAAAct < 2:1898464/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGTGGGTTTTTTGTTGTCAGGAGTTTTAATAAATGGCAGAGCAAACCTCGCGTCTCGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCATTAGTCAAAATGACGCAGGCTGGGGAAActgc < 2:671584/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGTGGGTTTTTTGTTGTCAGGAGTTTTAATAAATGGCAGAGCAAACCTCGCGTCTCGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCATTAGTCAAAATGACGCAGGCTGGGGAAActgc < 1:706424/150‑1 (MQ=255) tCGCGGTGGGTTTTTTGTTGTCAGGAGTTTTAATAAATGGCAGAGCAAACCTCGCGTCTCGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCATTAGTCAAAATGACGCAGGCTGGGGAAActgct < 1:1870741/150‑1 (MQ=255) | TTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGAGATGTGATGGTGTCTTTAATTAAATCGATGATGCTCCTGGAGAAAAGCATTGCGTGGCCTCGTAATCGCTATATCTACTATTATGTCGCCTGAAACCCACTTCGCGGTGGGTTTTTTGTTGTCAGGAGTTTTAATAAATGGCAGAGCAAACCTCGCGTCTCGCAATAATTATTGATAGCACTGGAGCGAAAAATAATGCTGACAATCTGACCTCCTCATTAGTCAAAATGACGCAGGCTGGGGAAACTGCT > NC_000913/1426269‑1426567 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |