Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 127,604 | 0 | A | T | 5.5% | 480.5 / 11.6 | 155 | intergenic (+17/‑308) | aceF/lpd | pyruvate dehydrogenase, E2 subunit/lipoamide dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (84/62); new base T (4/5); total (88/67) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.02e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |