| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 1,477,613 | 0 | G | C | 5.5% | 553.0 / 16.3 | 163 | intergenic (+163/‑8) | ydbD/ynbA | DUF2773 domain‑containing protein YdbD/putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (79/74); new base C (6/3); total (85/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
TTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAGCGCAAACCGAATTATCAAGGATTGATAATGACGCTCTACCAGATAAAACCGCTCTTTCAGTCGCTGTTAAGGCCGACGATGTTTTGGCTTTATAAGCACCACGTTACAGCGAATCACATCACTCTTGCTGCACTGGCGCTTTCTCTTCTTACCGGATTGCTGTTGATGT > NC_000913/1477468‑1477762 | tttAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAGCGCAAACCGAATTATCAAGGATTg < 1:459294/150‑1 (MQ=255) tAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAGCGCAAACCGAATTATCAAGGATTGAt < 2:1562948/150‑1 (MQ=255) aTCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAGCGCAAACCGAATTATCAAGGATTGATAATGa > 2:378961/1‑150 (MQ=255) 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gtcaTTATCAATCCTTGATAATGACGCTCTACCAGATAAAACCGCTCTTTCAGTCGCTGTTAAGGCCGACGATGTTTTGGCTTTATAAGCACCACGTTACAGCGAATCACATCACTCTTGCTGCACTGGCGCTTTCTCTTCTTACCGGAt > 1:2142631/4‑150 (MQ=255) cGAATTATCAAGGATTGATAATGACGCTCTACCAGATAAAACCGCTCTTTCAGTCGCTGTTAAGGCCGACGATGTTTTGGCTTTATAAGCACCACGTTACAGCGAATCACATCACTCTTGCTGCACTGGCGCTTTCTCTTCTTACCGGAt < 2:2169485/150‑1 (MQ=255) gAATTATCAAGGATTGATAATGACGCTCTACCAGATAAAACCGCTCTTTCAGTCGCTGTTAAGGCCGACGATGTTTTGGCTTTATAAGCACCACGTTACAGCGAATCACATCACTCTTGCTGCACTGGCGCTTTCTCTTCTTACCGGAtt > 2:658640/1‑150 (MQ=255) aTTATCAAGGATTGATAATGACGCTCTACCAGATAAAACCGCTCTTTCAGTCGCTGTTAAGGCCGACGATGTTTTGGCTTTATAAGCACCACGTTACAGCGAATCACATCACTCTTGCTGCACTGGCGCTTTCTCTTCTTACCGGATTGc < 1:211859/150‑1 (MQ=255) aTCAAGGATTGATAATGACGCTCTACCAGATAAAACCGCTCTTTCAGTCGCTGTTAAGGCCGACGATGTTTTGGCTTTATAAGCACCACGTTACAGCGAATCACATCACTCTTGCTGCACTGGCGCTTTCTCTTCTTACCGGATTGCTGt > 2:614662/1‑150 (MQ=255) 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gATTGATAATGACGCTCTACCAGATAAAACCGCTCTTTCAGTCGCTGTTAAGGCCGACGATGTTTTGGCTTTATAAGCACCACGTTACAGCGAATCACATCACTCTTGCTGCACTGGCGCTTTCTCTTCTTACCGGATTGCTGTTGATGt > 1:137287/1‑150 (MQ=255) | TTTAACTATCTGATTAATTGGGGATAATCATTCCTGACAGTGAGTCCCCAATACCTTGATATATTCTGAATTTTTAATGAAACGGCGTGTTGCGATATCTCCGTCAGGGGAATTGATGCACCATAGCGCAAACCGAATTATCAAGGATTGATAATGACGCTCTACCAGATAAAACCGCTCTTTCAGTCGCTGTTAAGGCCGACGATGTTTTGGCTTTATAAGCACCACGTTACAGCGAATCACATCACTCTTGCTGCACTGGCGCTTTCTCTTCTTACCGGATTGCTGTTGATGT > NC_000913/1477468‑1477762 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |