Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 137,022 | G→C | 6.4% | intergenic (‑105/‑61) | yacC ← / → cueO | putative lipoprotein YacC/cuprous oxidase/multicopper oxidase with role in copper homeostasis |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 137,022 | 0 | G | C | 6.4% | 606.1 / 21.9 | 184 | intergenic (‑105/‑61) | yacC/cueO | putative lipoprotein YacC/cuprous oxidase/multicopper oxidase with role in copper homeostasis |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (89/82); new base C (7/5); total (96/88) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.70e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.78e-01 |
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
GCCATCAGGCTGCCGAATAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCCGCGCAGTATTTGCGGCAGA > NC_000913/136874‑137171 | gCCATCAGGCTGCCGAATAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAgg > 1:97578/1‑150 (MQ=255) ccATCAGTCTGCCGAATAACACTGTTCTGAATAACTTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTATATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAggg < 1:2441802/150‑1 (MQ=255) ccATCAGGCTGCCGAATAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAggg > 1:2044245/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |