Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,606,480 | G→C | 5.1% | M127I (ATG→ATC) | lsrF → | 3‑hydroxy‑2,4‑pentadione 5‑phosphate thiolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,606,480 | 0 | G | C | 5.1% | 441.0 / 9.5 | 129 | M127I (ATG→ATC) | lsrF | 3‑hydroxy‑2,4‑pentadione 5‑phosphate thiolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (68/54); new base C (2/5); total (70/59) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.45e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
TGTTTGAACATGCCGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGCCGACCATGGCCGTGACTGGCGTG > NC_000913/1606332‑1606627 | tGTTTGAACATGCCGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGGGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCgatgg < 2:1500828/150‑1 (MQ=255) gTTTGAACATGCCGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCgatgga > 1:18339/1‑150 (MQ=255) gTTTGAACATGCCGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCgatgga < 1:2293960/150‑1 (MQ=255) tGAACATGCCGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGa > 1:2277934/1‑150 (MQ=255) tGAACATGCCGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGa > 2:751528/1‑150 (MQ=255) aCATGCCGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCTATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTCATCCATCGATAACGc < 1:382445/150‑1 (MQ=255) aCATGCCGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGc > 1:1014114/1‑150 (MQ=255) tGCCGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGt > 2:1340939/1‑150 (MQ=255) gCCGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTCATCCATCGATAACGccacg < 1:1795905/150‑4 (MQ=255) ccGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTCATCCATCGATAACGccacgg < 1:1439163/150‑5 (MQ=255) ccGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTCATCCATCGATAACGccacgg < 1:2426407/150‑5 (MQ=255) cGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTgcg > 2:1178993/1‑150 (MQ=255) cGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTgcg < 1:457929/150‑1 (MQ=255) cGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTCATCCATCGATAACGccacggc < 1:166574/150‑6 (MQ=255) aTGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGcc < 2:1580508/150‑1 (MQ=255) tgcaTTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCt < 1:2188287/147‑1 (MQ=255) gTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTg < 1:379540/150‑1 (MQ=255) tATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGGCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTATATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGa > 1:1797628/1‑150 (MQ=255) 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tgtgTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGtt > 2:2127908/1‑150 (MQ=255) gtgtACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTg > 1:1464897/1‑150 (MQ=255) gtgtACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTg > 2:568637/1‑150 (MQ=255) tgtACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTgc > 2:1197239/1‑150 (MQ=255) gtACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTgcg > 2:1379039/1‑150 (MQ=255) tACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTTTCGTAATTATGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCTCCTTAACAGTTtcgc < 2:1150971/150‑1 (MQ=255) aCGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGcgcg > 2:2073939/1‑150 (MQ=255) cgcgcgGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCgg > 1:1502004/1‑150 (MQ=255) cgcgACATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTg < 1:891999/150‑1 (MQ=255) cgGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTggc > 2:22498/1‑150 (MQ=255) 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cAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTta < 2:1951650/150‑1 (MQ=255) cAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTta > 1:1824655/1‑150 (MQ=255) cAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTta > 2:2478536/1‑150 (MQ=255) gCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTtata > 2:1886822/1‑150 (MQ=255) gCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGGGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTtata < 2:860078/150‑1 (MQ=255) 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tCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAg > 1:329000/1‑150 (MQ=255) ccccTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCg < 2:2382543/150‑1 (MQ=255) ccccTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCg > 1:1215985/1‑150 (MQ=255) cTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAat > 2:1927801/1‑150 (MQ=255) gCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAatat < 1:2478536/150‑1 (MQ=255) 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ggCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGaa > 1:1024428/1‑150 (MQ=255) gCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGaaa < 1:1055271/150‑1 (MQ=255) cGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAg < 2:426718/150‑1 (MQ=255) ggAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGt > 2:1636641/1‑150 (MQ=255) gAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAAAAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGCTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTg > 1:561925/1‑150 (MQ=255) aTTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTggg > 2:1589159/1‑150 (MQ=255) aaGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAAt > 1:491549/1‑150 (MQ=255) aaGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAAt > 1:805532/1‑150 (MQ=255) gTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGc < 1:16658/150‑1 (MQ=255) gTAATGAAGCCGGGGCGGTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGTCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGc < 2:1560766/150‑1 (MQ=255) cgcacggCGTCATCCATCGATAACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGCCGACCATg > 1:1949730/6‑150 (MQ=255) cGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGCCGACCATGGc < 2:1464897/150‑1 (MQ=255) gTGGCGTTATCGATGGATGACGCCCTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGATCATCAGTCGATCAAAAATATTATTAAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGCCGACCATGGcc > 2:83376/1‑150 (MQ=255) gTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGCCGACCATGGCCGTGAc > 2:636361/1‑150 (MQ=255) ttATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGCCGACCATGGCCGTGACt > 1:739753/1‑150 (MQ=255) tATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGCCGACCATGGCCGTGACTg > 2:297828/1‑150 (MQ=255) gatggatgACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGCCGACCATGGCCGTGACTGGCGt > 1:1906193/1‑150 (MQ=255) gatggatgACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGCCGACCATGGCCGTGACTGGCGt > 2:464512/1‑150 (MQ=255) gatggatgACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGCCGACCATGGCCGTGACTGGCGt > 2:473314/1‑150 (MQ=255) gatggatgACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGCCGACCATGGCCGTGACTGGCGt > 1:1189037/1‑150 (MQ=255) atggatgACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGCCGACCATGGCCGTGACTGGCGTg < 2:1502004/150‑1 (MQ=255) atggatgACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGCCGACCATGGCCGTGACTGGCGTg < 1:2332611/150‑1 (MQ=255) | TGTTTGAACATGCCGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGGGCGTCAGGTGCGAACTCTATTCTGGCGGAATTAAGTAATGAAGCCGTGGCGTTATCGATGGATGACGCCGTGCGCCTGAACAGTTGCGCGGTGGCGGCGCAGGTTTATATCGGCAGCGAATATGAACATCAGTCGATCAAAAATATTATTCAGCTGGTTGATGCCGGAATGAAAGTGGGAATGCCGACCATGGCCGTGACTGGCGTG > NC_000913/1606332‑1606627 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |