| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,735,209 | G→A | 6.0% | V259I (GTT→ATT) ‡ | mepH → | peptidoglycan DD‑endopeptidase MepH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,735,209 | 0 | G | A | 6.0% | 418.3 / 10.3 | 134 | V259I (GTT→ATT) ‡ | mepH | peptidoglycan DD‑endopeptidase MepH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (67/58); new base A (6/2); total (74/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.57e-01 | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GCGACCTGGTCTTTTTCCGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTA > NC_000913/1735060‑1735358 | gCGACCTGGTCTTTTTCCGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATg < 1:353166/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCTTTTTCCGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTgg < 2:2334840/150‑1 (MQ=255) tGGTCTTTTTCCGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTGTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGgcg > 2:1534702/1‑150 (MQ=255) ggTCTTTTTCCGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGgcgc > 1:1058931/1‑150 (MQ=255) ggTCTTTTTCCGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGgcgc < 2:313654/150‑1 (MQ=255) tCTTTTTCCGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCtc > 1:443633/1‑150 (MQ=255) cTTTTTCCGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCAACATAGTGGCGCtgc < 1:2158396/150‑3 (MQ=255) tttttCCGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCtcgt > 2:2419467/1‑150 (MQ=255) tttttCCGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCAACATAGTGGCGCtgcc < 1:759590/150‑4 (MQ=255) ttttCCGTACTCAGGGACTCGGCACAGCCGATCATGTCGTCGTGTATGTCGCCAACGGCAAATTTATTGAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCtcgtc < 1:1197650/150‑1 (MQ=255) tttCCGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCtcgtcg > 1:721673/1‑150 (MQ=255) ttCCGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCATTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCgg < 2:1048278/150‑1 (MQ=255) ttCCGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCgg < 2:2255934/150‑1 (MQ=255) tCCGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCggg > 2:1260774/1‑150 (MQ=255) cGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTa > 2:1109248/1‑150 (MQ=255) gTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTaa > 2:2193946/1‑150 (MQ=255) aCTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATg < 2:1423140/150‑1 (MQ=255) aCTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATg > 2:1996976/1‑150 (MQ=255) aCTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATg < 1:1232289/150‑1 (MQ=255) tCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGAc > 1:1216486/1‑150 (MQ=255) cAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGTCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGAcc > 2:452183/1‑150 (MQ=255) cAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCTGGTAATGAcc < 2:2058055/150‑1 (MQ=255) gACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCaa < 2:1185922/150‑1 (MQ=255) aCGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCaaa > 1:1890002/1‑150 (MQ=255) gCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAacac > 1:117498/1‑150 (MQ=255) aGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCg > 2:2439888/1‑150 (MQ=255) ggcgtgcATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGc > 2:216433/7‑150 (MQ=255) gCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGc < 1:2479092/150‑1 (MQ=255) aTCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTaaa < 2:2268241/150‑1 (MQ=255) tCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTaaaa > 1:523067/1‑150 (MQ=255) tGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACtt > 2:1982315/1‑150 (MQ=255) tGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACtt > 1:1657943/1‑150 (MQ=255) gTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACttt > 2:1857703/1‑150 (MQ=255) cGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTAc < 2:2425517/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTAc < 2:2185639/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTATGTCGGAAAATGCAAATTTATTCAGTCACAGCGCACAGGTCAGGAAATTGAAATCACTTCTCTCATTGAAGACTACTTTCAGCGCCACTATGTTGGCGCTGGTTGGTTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTAcc < 1:1505980/150‑1 (MQ=255) ggCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTAcc > 2:1098767/1‑150 (MQ=255) gtgtATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCtg > 1:961569/1‑150 (MQ=255) tATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCtgttg < 1:1885765/150‑1 (MQ=255) tATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTAAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCtgttg > 1:1824888/1‑150 (MQ=255) gTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGCCCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTa > 1:2104762/1‑150 (MQ=255) gcaacggcaaATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCTCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGc < 2:1406010/150‑1 (MQ=255) ggcaaATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAg < 2:1090047/150‑1 (MQ=255) gcaaATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAgg > 2:1069003/1‑150 (MQ=255) caaATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAggg > 1:2200722/1‑150 (MQ=255) caaATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAggg < 1:2082374/150‑1 (MQ=255) caaATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAggg < 2:1058931/150‑1 (MQ=255) aTTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTaa > 1:1062599/1‑150 (MQ=255) cACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCtttt < 1:1190604/150‑1 (MQ=255) aCCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTg < 1:807039/150‑1 (MQ=255) cgcgCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGtc < 2:2267129/150‑1 (MQ=255) cgcgCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGtc < 2:1287285/150‑1 (MQ=255) cgcgCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGtc > 2:618141/1‑150 (MQ=255) cgcACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGtctc < 1:593543/150‑1 (MQ=255) cgcACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGtctc > 1:2213972/1‑150 (MQ=255) gTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCtttt < 1:1787606/150‑1 (MQ=255) gTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCtttt < 2:1747979/150‑1 (MQ=255) gTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCtttt > 2:1245769/1‑150 (MQ=255) cAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTaa > 1:1081017/1‑150 (MQ=255) ggAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAAtt > 2:2480883/1‑150 (MQ=255) ggAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTAATCTTTTGTATCAACTTTTAAtt > 2:2103328/1‑150 (MQ=255) aaaTTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGACACTATGTTGTCCCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTAGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGCGTAAGTTCATCTTTTCTCTCACCTTTTAATTTg > 1:1385555/1‑150 (MQ=255) aaTTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGc < 1:1534702/150‑1 (MQ=255) aaTTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGACTCACCTTTTAATTTGc > 2:1320279/1‑150 (MQ=255) aaaTCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTAccc < 2:1824888/150‑1 (MQ=255) aaaTCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTAccc < 1:1369975/150‑1 (MQ=255) aaTCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCt > 1:1989364/1‑150 (MQ=255) aaTCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTATCACCTTTTAATTTGCTACCCt > 1:799183/1‑150 (MQ=255) aCTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCATGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATcc < 1:1645556/150‑1 (MQ=255) cTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCa > 2:1639634/1‑150 (MQ=255) cAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGCCCCCAAAAACCCTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGcac > 1:1332183/1‑150 (MQ=255) cAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGcac > 1:2046964/1‑150 (MQ=255) gTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACaa > 1:967380/1‑150 (MQ=255) tGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAAt < 1:1808824/150‑1 (MQ=255) gAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATa > 2:45778/1‑150 (MQ=255) gAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCCATCCATACGCACAATa > 2:1717547/1‑150 (MQ=255) aGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAg < 2:117498/150‑1 (MQ=255) gACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAgg > 2:2054732/1‑150 (MQ=255) actactGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGc > 1:1379942/1‑150 (MQ=255) actactGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGc < 1:2193946/150‑1 (MQ=255) ccgacgaGCGCCAACATAGTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTAt > 1:1762485/7‑150 (MQ=255) ctGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTAtt > 2:237443/1‑150 (MQ=255) cgacgaGCGCCAACATAGTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTAtt > 2:455818/6‑150 (MQ=255) tGGCAGCGCGACTATGTTGGCTCGCGGCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTTCCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGGTATTg < 2:701736/150‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGt > 2:666001/1‑150 (MQ=255) acgaGCGCCAACATAGTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGt > 2:421401/4‑150 (MQ=255) gCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTa < 2:523067/150‑1 (MQ=255) cgaGCGCCAACATAGTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTa > 2:69421/3‑150 (MQ=255) cgaGCGCCAACATAGTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTa > 2:1490518/3‑150 (MQ=255) aGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACg < 1:2152951/150‑1 (MQ=255) aGCGCCAACATAGTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACg > 1:1543771/1‑150 (MQ=255) gcgcCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGt > 1:699329/1‑150 (MQ=255) gcgcCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGAAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGt < 2:1890002/150‑1 (MQ=255) cgcCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTa > 2:256448/1‑150 (MQ=255) ccACTATCTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGATACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAAATTGCTACCCTATCCAAACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATg > 2:23110/1‑150 (MQ=255) tGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAAtt > 1:2075262/1‑150 (MQ=255) tGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAAtt > 2:1074361/1‑150 (MQ=255) tGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAAtt < 1:1260774/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATta > 1:1324019/1‑150 (MQ=255) gTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATta > 1:2001596/1‑150 (MQ=255) | GCGACCTGGTCTTTTTCCGTACTCAGGGACGCGGCACAGCCGATCATGTCGGCGTGTATGTCGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTA > NC_000913/1735060‑1735358 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |