Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,764,694 | 0 | G | C | 8.2% | 473.7 / 24.9 | 146 | intergenic (‑308/+19) | sufA/rydB | iron‑sulfur cluster insertion protein SufA/small regulatory RNA RydB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (65/69); new base C (8/4); total (73/73) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.67e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.98e-01 |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
GAATTAGGTATCTCATTGTTAGATAATGGTTATTATCTAAGGAGCATTAAGGCTGTGATGAAAAAGAAAAAGTTGTATTGAAAATGACTATTTAAGAGATAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCA > NC_000913/1764545‑1764843 | gAATTAGGTATCTCATTGTTAGATAATGGTTATTATCTAAGGAGCATTAAGGCTGTGATGAAAAAGAAAAAGTTGTATTGAAAATGACTATTTAAGAGATAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCg > 1:2434909/1‑150 (MQ=255) ttAGGTATCTCATTGTTAGATAATGGTTATTATCTAAGGAGCATTAAGGCTGTGATGAAAAAGAAAAAGTTGTATTGAAAATGACTATTTAAGAGATAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGaca < 2:1082758/150‑1 (MQ=255) tAGGTATCTCATTGTTAGATAATGGTTATTATCTAAGGAGCATTAAGGCTGTGATGAAAAAGAAAAAGTTGTATTGAAAATGACTATTTAAGAGATAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGacac > 1:225658/1‑150 (MQ=255) 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ccTTAAGCCTGTGTCCCACAGACTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCACCGGCACTATCAGTGTCTTAGCTCTTGAAGCGCCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTattatt > 2:2243026/1‑150 (MQ=255) cTTAAGCCTGTGTCGCACAGACTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTATTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTAttt > 2:1417672/1‑150 (MQ=255) ttAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTAtttt < 2:1927543/150‑1 (MQ=255) tAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTAttttt > 1:410801/1‑150 (MQ=255) tAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTAttttt > 1:1357133/1‑150 (MQ=255) aaGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTg < 2:1491266/150‑1 (MQ=255) aaGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTg < 2:1197258/150‑1 (MQ=255) gTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGaa < 2:237644/150‑1 (MQ=255) tCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAAc < 1:1119441/150‑1 (MQ=255) tgtgCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACaa > 1:2064583/1‑150 (MQ=255) gtgCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCCTCCGGCGCTTATCTCCCGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAACCTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAat > 1:818875/1‑150 (MQ=255) gACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCa < 2:1645342/150‑1 (MQ=255) | GAATTAGGTATCTCATTGTTAGATAATGGTTATTATCTAAGGAGCATTAAGGCTGTGATGAAAAAGAAAAAGTTGTATTGAAAATGACTATTTAAGAGATAGGTAAAAAAGTGCAGCGTTCAGAAATAAGAAAACCCTTAAGTCTGTGCGACACAGGCTTAAGGG‑TTTCTACCCCATCCGGCGCTTATCTCCGGCACTCTCAGTGGCTTAGCTCTTGAAGGGGCGATAAGAATAATCTCATAAAGCTAACCCGCCGTTTTAACACAAACTGCGATTAGTATTATTTTTGAACAATATCA > NC_000913/1764545‑1764843 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |