Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,808,682 | C→G | 7.2% | intergenic (+26/+15) | yniA → / ← yniB | putative kinase YniA/uncharacterized protein YniB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,808,682 | 0 | C | G | 7.2% | 490.0 / 20.2 | 150 | intergenic (+26/+15) | yniA/yniB | putative kinase YniA/uncharacterized protein YniB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (62/76); new base G (7/4); total (70/80) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.47e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.39e-01 |
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
TGCCGATTTCCTTGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCAATTTGTTCACG > NC_000913/1808533‑1808828 | ccGATTTCCTTGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGt > 2:25847/1‑150 (MQ=255) ttGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCttt > 2:1543698/1‑150 (MQ=255) ttGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCACGGAGCGGCCatt < 2:1347147/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |