| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,376,291 | T→C | 7.9% | intergenic (+26/‑26) | efp → / → ecnA | protein chain elongation factor EF‑P/entericidin A lipoprotein, antidote to entericidin B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,376,291 | 0 | T | C | 7.9% | 182.1 / 5.3 | 68 | intergenic (+26/‑26) | efp/ecnA | protein chain elongation factor EF‑P/entericidin A lipoprotein, antidote to entericidin B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/27); new base C (2/4); total (36/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.24e-01 | |||||||||||
GGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGC‑GAAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCATCTCTCGCGCT > NC_000913/4376149‑4376433 | ggCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCt < 1:920100/143‑1 (MQ=255) gcgacccGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTGCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCGCTGGGGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTg < 2:38585/138‑1 (MQ=255) aaaCCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCa > 1:766188/1‑143 (MQ=255) aaCCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCAAAACGAACATAGCTGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCAGCCTGCAGGCCGCAc < 1:230886/143‑1 (MQ=255) ccGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCAGCCTGCAGGCCGCACCa < 1:485904/143‑1 (MQ=255) ccGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCAGCCTGCAGGCCGCACCa < 1:485929/143‑1 (MQ=255) ccGGCTACCCTGTCTACTGGCGCGGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCAGCCTGCAGGCCGCACCa < 2:384019/143‑1 (MQ=255) gCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCa < 1:23786/143‑1 (MQ=255) gCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCa < 1:720093/143‑1 (MQ=255) cTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTAtt < 2:255014/143‑1 (MQ=255) tGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTACTGCGGTTGTGGTGAGGCCTGCCGGCTGCACCATCACATATTc > 2:612640/1‑143 (MQ=255) tCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGGTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCAGCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAg < 1:240672/143‑1 (MQ=255) tACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCGGCTTTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGt < 2:398326/143‑1 (MQ=255) ggggCGCGGTGGTTGAGGATCCGCTGTTGGTACAAATCGGCGAAGTCAGCAAAGTGGATACCCGCTCTCGCGAACCCGTCTGGCGCTTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCa < 2:406880/141‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCa < 1:915938/143‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGCGAATCCGTCTCTCGCGGGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCGCTTGTTCAGGTCa > 1:500040/1‑143 (MQ=255) gcTGTGGTTAAGGTTCCGCTGTTTGGACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAgat < 2:594941/143‑1 (MQ=255) cTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTAGTGGTGCGGCCTGTAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAgatg < 1:966003/143‑1 (MQ=255) gTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑aa > 1:939717/1‑143 (MQ=255) gTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑aa < 1:767756/143‑1 (MQ=255) gTTAAAGTTCCGCTGCTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGAACTGCGGTTGTGGTTAGGCATGCCAGCTGCACCTTCTCTTATTCCTGTCCGCGATGATG‑aa > 2:357053/1‑143 (MQ=255) ttAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGATGAATCATCACTTTTTCAGGGCAGAGATGATG‑gaa > 1:686273/1‑143 (MQ=255) tAAAGTTCCGCTGTTTGTACTAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAAc < 2:591377/143‑1 (MQ=255) tAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAAc > 1:674446/1‑143 (MQ=255) ttCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCtt > 1:82268/1‑143 (MQ=255) tCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGCCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTa < 1:287418/143‑1 (MQ=255) cGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATc > 1:203918/1‑143 (MQ=255) cGCTGCTTGTACAAATCGGCGAAGGCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATc < 1:409426/143‑1 (MQ=255) tGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCCGCACCATCTGATACTCGGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGtt > 2:445689/1‑143 (MQ=255) gTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGGTGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGt > 1:46753/1‑143 (MQ=255) tACAAATCGGCGAAGTCATCAAGGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGtt < 2:837829/143‑1 (MQ=255) aaTCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCag < 1:438936/110‑1 (MQ=255) aaTCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCag > 2:438936/1‑110 (MQ=255) aTCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTttgct < 2:82268/143‑1 (MQ=255) ggCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTttgcttgc < 1:24330/143‑1 (MQ=255) aaGTCATCAAGGTGGGTACGCGCTCTGGGGAGTCCGTCGCTCGCGGGAAGTAATGCGGTGGTGGTGCGGCCTGTAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATA‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGc < 2:454744/143‑1 (MQ=255) aaGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTc > 2:203534/1‑143 (MQ=255) aaGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTc < 2:461124/143‑1 (MQ=255) aGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCa < 2:939717/143‑1 (MQ=255) gctgccggCTCTAGTGAATGCGTCGCTCGCGTGGAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACggg < 2:155249/136‑1 (MQ=255) gATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCCGCACGCTGCTCACggg > 1:652499/1‑143 (MQ=255) gATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACggg > 1:375090/1‑143 (MQ=255) aTACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑CAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGc > 1:737680/1‑143 (MQ=255) aTACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGACCGCTGCTCACGGGc > 1:736559/1‑143 (MQ=255) cccGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGt < 2:320742/143‑1 (MQ=255) cGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTaa > 1:979177/1‑143 (MQ=255) ctctGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AACCGCCCTATCGTCCTTCTCTTGCTTGCCAGCACGCTGCCCCCGGCCTGTAacc > 2:829222/1‑142 (MQ=255) ggTGATTACGTCGCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGc < 2:963085/143‑1 (MQ=255) tGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGGTGATG‑AAACGCCTTATCGATCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCGCCCGGGCTGTAACACCGCTc > 2:420117/1‑143 (MQ=255) gAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTcg > 1:929132/1‑143 (MQ=255) aCGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGt > 1:24530/1‑143 (MQ=255) cGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGtt < 2:300283/143‑1 (MQ=255) tctcGTGTGATGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCGGCACCATCACCTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCgg < 1:313299/143‑1 (MQ=255) tctcGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCAGCGTGCGTTAAGCAAGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCgg < 1:1006197/143‑1 (MQ=255) gcgTGACGTAATGCGGTCGTGGTCCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGCGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGC‑Gaa < 1:612640/143‑1 (MQ=255) cgTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGT‑GAAg > 1:475218/1‑143 (MQ=255) gTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTCACTCCGCTCGCTGTTTCGGC‑GAAGa > 1:54143/1‑143 (MQ=255) aaTGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGC‑GAAGACATCaaa > 1:523313/1‑143 (MQ=255) gCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTCCTCACGGGTTGTAACACCGCTCGCCGTTTTGAC‑GAAGACATCACACAt > 1:549566/1‑143 (MQ=255) gtgatggtgCAGCCTGCAGGCCGCACCATCACTTATTAAGGTCAGAGAT‑ATGTAAACGCATTATCGTTCATGATTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGC‑GTCGACATCACACAtcta > 2:217496/5‑142 (MQ=255) gtggtgCGGCCTGTAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGC‑GAACACATCAAACATCTCGGc > 2:399742/1‑143 (MQ=255) tggtgCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGC‑GAAGACATCAAACATCTCGGCa > 1:526145/1‑143 (MQ=255) gtgCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGC‑GAAGACATCACACCTCCCGGCAAc > 1:1012807/1‑143 (MQ=255) tgCGGCCTGCAGGCTGCACCATCCCTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCGCGCGGTTTCGGC‑GAAGACCTGAAACATCTCGGCCAcc > 2:198924/1‑142 (MQ=255) ggCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGC‑GAAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCa > 1:159073/1‑143 (MQ=255) tGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGC‑GAAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCAtgtc > 2:887026/1‑143 (MQ=255) cAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCACCAAAGAAACAGGC‑TATGGCATCAAACATCTCGGCAACTCCAtctccc > 2:446672/1‑141 (MQ=255) cAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCAAGCTGCTGCTGGTCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGC‑GAAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCAtctctc > 2:880516/1‑143 (MQ=255) gCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCACAAGA‑ACCAAACACCTCGGCCACTCAACCTCTcgcg > 2:208087/1‑143 (MQ=255) tGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGC‑GTAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCATCTCTCGCGCt > 1:157714/1‑143 (MQ=255) | GGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATG‑AAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGC‑GAAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCATCTCTCGCGCT > NC_000913/4376149‑4376433 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |