Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,376,291 | T→C | 6.8% | intergenic (+26/‑26) | efp → / → ecnA | protein chain elongation factor EF‑P/entericidin A lipoprotein, antidote to entericidin B |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,376,291 | 0 | T | C | 6.8% | 189.0 / 2.8 | 70 | intergenic (+26/‑26) | efp/ecnA | protein chain elongation factor EF‑P/entericidin A lipoprotein, antidote to entericidin B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/29); new base C (2/3); total (38/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.54e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.01e-01 |
GCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCATCTCTCGCG > NC_000913/4376150‑4376431 | gCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTg > 1:4211/1‑143 (MQ=255) gCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGATTAAAGTTCCGCAGTTTGTACAAATCGGCGAAGTAAACAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCGCTCGCATGAAGTAAGGCGGTTGTCGTGCGGACTGCAGGCTg > 1:303794/1‑143 (MQ=255) cataCCGGCTCGCCCGTCGTCTGGCGCGGTGGTTGGAGTTCCGCTGTGTGTACAATTCGGCGAAGTCATCAATGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCAGCCTGCAGGCCGc < 2:861571/140‑1 (MQ=255) aCCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGcccc > 1:809078/1‑143 (MQ=255) aCCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGGGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCAGCCTGCAGGCCGCAcc < 1:259692/143‑1 (MQ=255) aCCGGCTACCCTGTATACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCCGGCTGCAcc > 2:406328/1‑143 (MQ=255) gCTGCCCGGTCTACTGGCGCTGTGGTTACAGTGCCGCTGTTTGTGCAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCa < 2:501856/143‑1 (MQ=255) cTACCCTGTCTACTGGCGCTATGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCAc < 1:657640/143‑1 (MQ=255) tACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACt > 2:443271/1‑143 (MQ=255) aCCCGGCCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACtt < 1:483861/143‑1 (MQ=255) tGTCTCCTGCCGCTCTGGTTACAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTc < 2:474287/143‑1 (MQ=255) tGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTCAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTc < 2:104132/143‑1 (MQ=255) tACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGt < 1:737264/143‑1 (MQ=255) tACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCGGGTGAATACGTCTCTCGGGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCGCCATCACTTATTCAGGt > 1:799117/1‑143 (MQ=255) cTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCa > 2:368545/1‑143 (MQ=255) tGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCag < 1:105306/143‑1 (MQ=255) ggCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCaga < 1:106963/143‑1 (MQ=255) ggCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCaga < 1:422787/143‑1 (MQ=255) gtgGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACGAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAgatgat < 2:441173/143‑1 (MQ=255) gtgGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCGGAgatgat > 2:375435/1‑143 (MQ=255) tgGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGatgatg > 2:839402/1‑143 (MQ=255) ttCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGCTGACACGCCtt > 2:795282/1‑143 (MQ=255) ttCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCtt > 1:803775/1‑143 (MQ=255) ttCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACCTATCCAGCCCAGAGATGACAAAACAccct > 2:890625/1‑141 (MQ=255) ttCCGCTGTTTGTACAAATCGGAGAAGTCATAAAAGTGGATAAGTGCGCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTGATTCAGGTCAGAGGTGATGAAACGCCtt > 2:191982/1‑143 (MQ=255) cGCTGTCTGTACAACTCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATc < 2:475032/143‑1 (MQ=255) tGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAGAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTCAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGtt < 2:720484/143‑1 (MQ=255) aTCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGGTGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTttgct < 1:443271/143‑1 (MQ=255) aTCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTCGTTttgct > 2:440728/1‑143 (MQ=255) tCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTttgctt < 2:213539/143‑1 (MQ=255) ggCGGAGGCATCAAAGTGGGTACCCGCTCTGGGGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTttgcttgc < 1:196956/143‑1 (MQ=255) ggCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGACACGCCTTATCGTTCTTGTCttgcttgc > 1:491127/1‑143 (MQ=255) gCGAGGTCATCGAAGTGGGTACCCGCTCTGGGGAATACGCCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGcc < 2:603750/143‑1 (MQ=255) gCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAAGCCGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGcc < 2:604404/143‑1 (MQ=255) gAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTCAAGTAACGCGGTTGTGGTGCAGCCTGCAGGCTGCACCATCACCTATTACGGTCAGAGATGATGAAACGGCATATCGTTCCTGTTTTGCTTACCAg > 2:485737/1‑143 (MQ=255) gtcgATACCCGCTTGGGTGAAACCGTCTGTCGCGTGAAGCACTGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGCGATGATGAAACGCCTTATCGCTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCAc < 1:171701/140‑1 (MQ=255) gTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTccc > 2:273994/1‑141 (MQ=255) tGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACg > 1:308632/1‑143 (MQ=255) cccGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGt < 2:214207/143‑1 (MQ=255) cGCTCTGTTGCGTTCGTCTCTCGCTTGACGTAACGCGGTTGTGGTGCGGGCTGCAGGCTGCTCCATCACTTATTCTGGTCAGAGATGATGACCCGCCTTATCCAACTCAACGTGTTTGGTAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTaa < 2:733335/143‑1 (MQ=255) tctGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGCTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAacac < 1:844449/143‑1 (MQ=255) gAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTcg > 2:300569/1‑143 (MQ=255) gtACGTCTCTCGCGTGAAGGAAGGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGCTGAATCGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTcgcg < 1:282327/142‑1 (MQ=255) ctctcGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCg < 1:368545/143‑1 (MQ=255) tctcGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCgg > 1:785845/1‑143 (MQ=255) tctcGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGGAACACCGCTCGCGGTGTCgg > 1:311694/1‑143 (MQ=255) tAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGATTCGGCGAAGACATCaa > 1:115571/1‑143 (MQ=255) tAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAAAGCCTTATCGTTGTTGTTTTGCTTGCCAGAATGCTACTTGCGG‑GCTGTAAAACAGGTCGCGGGTTCGGCGAAGACATCaa > 2:98873/1‑143 (MQ=255) aggCGGTTGGGGCGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAAc < 1:760991/141‑1 (MQ=255) cGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATccaccctc > 2:810671/1‑136 (MQ=255) ggTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCAAGATGCTCACGG‑GCGGTAACACCGCTCGCGGTTTAAGCGCAGAAATCACACAttt > 2:270227/1‑141 (MQ=255) gTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACAtctc > 1:741091/1‑143 (MQ=255) gTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTGCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGCCACACCGCTCGCGGGTGCGGCGACGTCATCAAACAgctc > 2:659803/1‑143 (MQ=255) tgtgGTGCGGCCTGCAGGCTGCTCTATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTGGCTGGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACATCTCgg < 1:19721/143‑1 (MQ=255) ggtggtgCGGCCTGTAGGCTGGACTATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATAGTTATTGTTGTTCTTTCCTGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACATCTCgg < 2:315842/142‑1 (MQ=255) tggtgCGGCCTGCAGGCTGCACCATCCCTTATTCAGGTCAGAGCTGATGAACCGCCTTATCGCTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACCCCGCTCGCGGTTTCGCCCAAGACCTCACACCTCTCGCCa > 2:774301/1‑143 (MQ=255) ggtgCAGCCTGCAGGCCGCACCATCACTTAGTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACATCTCGGCaa > 2:18002/1‑143 (MQ=255) gtgCAGCCTGCAGGCCGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAg > 2:466842/1‑79 (MQ=39) gtgCAGCCTGCAGGCCGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAg < 1:466842/79‑1 (MQ=39) tgCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTCACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGAACTACAAAATATCGGCAACt > 2:714692/1‑143 (MQ=255) cGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGGTGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCCGC‑CGCGGAGAAGTAACACCGCTCGCGCTGCCGGCACAGCCATCAGACCACACGGCacccca > 2:534353/1‑138 (MQ=255) gCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGAATCGGCGAAGACATCAAGAATAACCGCAACTcaac > 2:61717/1‑140 (MQ=255) ccTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCCCACAG‑GCTGCAACACCGCTCGCGATTTCGGCGAAAACATCAAACATCTCGGCAACTCCAtc > 1:748266/1‑143 (MQ=255) gCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCAtctct > 1:534221/1‑143 (MQ=255) cAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCAtctctc > 2:6380/1‑143 (MQ=255) aGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCATCTCTcg < 1:774235/143‑1 (MQ=255) aGGCTGCACCATCACTTATTCAGGCCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCATCTCTcg < 1:189531/143‑1 (MQ=255) ggCTGCACCATCACTTATACAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCATCTCTcgc < 1:839402/143‑1 (MQ=255) gCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGCTGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCACGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCCAACATCTCCGCAAATCCATCTCTcgcg > 2:826324/1‑143 (MQ=255) gCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGAACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACATCACGGCAACTCCATCCcgcgcg > 2:228860/1‑143 (MQ=255) | GCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGG‑GCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCATCTCTCGCG > NC_000913/4376150‑4376431 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |