New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2382550 | 46 (1.150) | 5 (0.130) | 5/248 | NT | 10.1% | intergenic (+25/‑163) | rbn/elaD | ribonuclease BN/protease ElaD |
? | NC_000913 | = 2382557 | 46 (1.230) | intergenic (+32/‑156) | rbn/elaD | ribonuclease BN/protease ElaD |
CGTCAGCTCGCGCTATGATGACAAAGGTTGTCAGCACCTGTTACGTGAATGCAGGTCAATTTTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATAAGTTGCCTCTTTTCATCTTGATTCAGCAC > NC_000913/2382417‑2382688 | cGTCAGCTCGCGCTATGATGACAAAGGTTGTCAGCACCTGTTACGTGAATGCAGGTCAATTTTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTgc > 2:664432‑M2/1‑141 (MQ=255) gTCAGCTCGCGCTATGATGACAAAGGTTGTCAGAACCTGTTACGTGAATGCAGGTCAATTTTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTgcc > 1:23940‑M2/1‑140 (MQ=255) cTCGCGCTATGATGACAAAGGTTGTCAGCACCTGTTACGTGAATGCAGGTCAATTTTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTgccctgtt < 2:59116‑M2/143‑9 (MQ=255) gcgcTATGATGACAAAGGTTGTCAGCACCTGTTACGTCAATGCAGGCCAATTTTCACGAAGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGCCGAAACTCgccctctcaac < 2:148450‑M2/143‑12 (MQ=255) tgaCAAAGGTTGTCAGCGCCTGTTACGTGAATGCAGGTCAATTGTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCcgc < 1:352886/143‑1 (MQ=255) gaCAAAGGTTGTCAGCACCTGTTACGTGAATGCAGGTCAATTTTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCcgcg < 1:560917/143‑1 (MQ=255) gTTGTCAGCACCTGTTACGTGAATGCAGGTCAATTTTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACata < 1:253555/143‑1 (MQ=255) tCAGCACCTGTTACGTGAATGCAGGTCAATTTTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATc > 1:586233/1‑143 (MQ=255) cAGCACCTGTTACGTGAATGCAGGTCAATTTTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATCTATca > 2:36897/1‑142 (MQ=255) cACCTGTTACGTGAAGGCAGGTCAATTTTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATccacc < 1:13918/143‑1 (MQ=255) tGTTACGTGAATGCAGGTCAATTTTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCcaca < 1:638337/143‑1 (MQ=255) tACGTGAATGCAGGTCAATTTTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAg < 1:323528/143‑1 (MQ=255) cGTGAATGCAGGTCAATTTTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGc < 2:700410/143‑1 (MQ=255) gCAGGTCAATTTTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGa < 2:104942/143‑1 (MQ=255) gCAGGTCAATTTTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGATTGTTATTAAAAACAGGGCGAGACTTGCCGTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGa > 1:379080/1‑143 (MQ=255) ttttCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGAGTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCGTATTATTAAAAACAGGGCGACACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGCttttt > 2:477881/1‑143 (MQ=255) gagtCCCGGGAACGGAACTGGCGAATGAGTTCACCGTGTTTAACGTTTGACTCTGCTTATTATGAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGAttttt < 1:261989/140‑1 (MQ=255) gttCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATAGATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTg < 2:778178/142‑1 (MQ=255) ccGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACCGGCAGATTGAGCGATCTTTGctat > 1:564773/1‑143 (MQ=255) cGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTgccctgtttttaataataagcagagttaaacgttaaacacggtgcaatcattcgccagttcagtcgc < 2:125365‑M2/143‑68 (MQ=255) cGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTGTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGAtatt < 1:435896/143‑1 (MQ=255) aCTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTc < 1:236815/143‑1 (MQ=255) tGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTATGATATTTATTCAt > 1:226876/1‑143 (MQ=255) cGAATGATTTCACCGTGATTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCACCACAGGCATATTGAGCGATGTTCGATATTGATTCCGCTCCTTAc > 2:648824/1‑143 (MQ=255) aaTGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCGTATTATTAAAAACGGGGCGAAGCTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATCTATCCACCCCCACATGCTTATTGAGCGATTTTTGGTATTTTTTCATCTCCTTACGc > 2:560484/1‑143 (MQ=255) tCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTatat > 2:749596/1‑143 (MQ=255) cACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACGTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATAtt < 2:20894/143‑1 (MQ=255) aCCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTGAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTc > 2:412231/1‑143 (MQ=255) aCCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTGGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTc > 1:230855/1‑143 (MQ=255) cGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCag > 1:126090/1‑143 (MQ=255) gtgtTTAACGTTTCACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCaga < 2:187758/143‑1 (MQ=255) gcgtttaacgtttaacTCTGCTTAGTATTAAAGACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCaga < 1:317410/141‑1 (MQ=255) tgtTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCagag < 1:787717/143‑1 (MQ=255) tttaacgtttaacTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTgccctgtttttaataataagcagagttaaacgttaaacacggtgaaatcattcgccagttcagtcgccgggaaaattgacatgcattcacgtaacaggt < 2:262285‑M2/143‑100 (MQ=255) ttaacgtttaacTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCaa > 1:638268/1‑143 (MQ=255) acgtttaacTCTGCTTTTTATCAAACACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATaa < 2:374168/143‑1 (MQ=255) acgtttaacTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATaa < 1:506503/143‑1 (MQ=255) acgtttaacTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATaa < 1:59116/143‑1 (MQ=255) acTCTGCTTATTAGTAACAACAGGGCGAAACTTGACCTGTGATCGCAACCCGCGCTATATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATAAGTTGCct < 2:49800/143‑1 (MQ=255) ctctGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATAAGTTGCctc > 2:333598/1‑143 (MQ=255) ctctGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATAAGTTGCctc > 1:756557/1‑143 (MQ=255) tctGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTGTATTCAGAGCAATAAGTTGCctct > 2:415613/1‑143 (MQ=255) ctGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATAAGTTGCCTCtt < 1:172340/143‑1 (MQ=255) tGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCCTCTCCTGACGCACTATACTCGGGGCAATAAGTTGCCTCttt > 1:65411/1‑143 (MQ=255) ttattactaCACACAGGGCGAAACTTGTCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATAAGTTGCCTCTTTTCa < 1:177478/143‑1 (MQ=255) tattattaAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATAAGTTGCCTCTTTTCAt < 2:167836/143‑1 (MQ=255) ttaAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATAAGTTGCCTCTTTTCATCttaa > 2:295292/1‑141 (MQ=255) ttaAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATAAGTTGCCTCTTTTCATCTTGa > 1:584367/1‑143 (MQ=255) ttaAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATGGAGCGAGTTTTGATATTGATTCATCTCCTTACGCACTATATGCAGAGCAATAAGTTGCCTCTTTTCTTCTTGa > 2:331375/1‑143 (MQ=255) taAAAACAGGGCGAAACTTgccctgtttttaataataagcagagttaaacgttaaacacggtgaaatcattcgccagttcagtcgccgggaaaattgacctgcattcacgtaacaggtgctgacaacctttgt > 1:44591‑M2/1‑19 (MQ=255) taAAAACAGGGCGAAACTTgccctgtttttaataataagcagagttaaacgttaaacacggtgaaatcattcgccagttcagtcgccgggaaaattgacctgcattcacgtaacaggtgctgacaacctttgt < 2:44591‑M2/133‑115 (MQ=255) taAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCTATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATAAGTTGCCTCTTTTCTTCTTGAt > 1:494860/1‑143 (MQ=255) aaCAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATAAGTTGCCTCTTTTCATCTTGATTCAg < 2:16582/143‑1 (MQ=255) cAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATAAGTTGCCTCTTTTCATCTTGATTCAGca > 2:149031/1‑143 (MQ=255) aGGGCGAAACTTgccctgtttttaataataagcagagttaaacgttaaacacggtgaaatcattcgccagttcagtcgccgggaaaattgacctgcattcacgtaacaggtgctgacaacctttgtcatcatagcgcgagctg < 2:290898‑M2/143‑132 (MQ=255) | CGTCAGCTCGCGCTATGATGACAAAGGTTGTCAGCACCTGTTACGTGAATGCAGGTCAATTTTCCCGGCGACTGAACTGGCGAATGATTTCACCGTGTTTAACGTTTAACTCTGCTTATTATTAAAAACAGGGCGAAACTTGCCCTGTTATCGCAACCCGCGCTACATATATCCACCCACACAGGCATATTGAGCGATTTTTGATATTTATTCATCTCCTTACGCACTATATTCAGAGCAATAAGTTGCCTCTTTTCATCTTGATTCAGCAC > NC_000913/2382417‑2382688 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |