New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2731065 = | 45 (1.130) | 7 (0.180) | 5/256 | NT | 21.3% | noncoding (93/1542 nt) | rrsG | 16S ribosomal RNA |
? | NC_000913 | = 4208221 | 8 (0.210) | noncoding (75/1542 nt) | rrsE | 16S ribosomal RNA |
ATACCAAGTCTCAAGAGTGAACACGTAATTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAGAAGCTTGCTTCTTTGCTGACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATG > NC_000913/4208081‑4208268 | acaccAAGTCTCAAGAGTGAACAAGTAATTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAACTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACAGGCAAGTCGAACGGTAACAGga > 1:360765‑M2/3‑141 (MQ=255) aTACCAAGTCTCAAGAGTGAACACGTAATTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGTTGAGGCCTATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGga < 1:576925‑M2/143‑3 (MQ=255) aTACCAAGTCTCAAGAGTGAACACGTAATTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTCGAGCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCCAAAGGTAACAGgc < 2:7683‑M2/143‑3 (MQ=255) aTACCAAGTCTCAAGAGTGAACACGTAATTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAACAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGga > 1:419326‑M2/1‑141 (MQ=255) tACCAAGTCTCAAGAGTGAACACGTAATTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGCGTTTGATCATGGCTAAGATTGAATGCTGGCGGGAAGCATACCGAATGGAGGCGGAACGGTAAGAGgaa < 2:509352‑M2/143‑4 (MQ=255) aCCAAGTCTCAAGAGTGAACACGTAATTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGgaag < 2:69102‑M2/143‑5 (MQ=255) cAAGTCTCAAGAGTGAACACGTAATTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCACGTAGAACGGTAACAGggagaa > 2:438660/1‑143 (MQ=9) gtctttagagTTAACACTTAATTCAGTACGAATTTTTATTCTTTGAGCATCACACTTTTCAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAGAAgct < 2:388309/137‑1 (MQ=11) ctcAAGAGGGAACACGTAATGCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAGAAgcttg < 2:666038/143‑1 (MQ=17) agTGAACACGTACTTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAAGTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGgaagcagcaagctgctt > 2:253‑M2/1‑126 (MQ=255) agTGAACACGTAATTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCCAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGgaagcagcaagctgctt > 2:146562‑M2/1‑126 (MQ=255) gTGAACACGTAATTCATTACGAAGTGTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAGAAGCTTGCTTCttt < 2:712318/143‑1 (MQ=17) tGACCACGTAGTTCGTTACGAAGGTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCCAGTCGAACGGTAACAGgaagcagcaagctgcttcc > 2:684253‑M2/1‑124 (MQ=255) aaCACGTAATTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGgaagaagcaagcttcttcctg > 2:81036‑M2/1‑122 (MQ=255) acGTAATTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGgaagcagcaagctgcttcctgtta > 1:108598‑M2/1‑119 (MQ=255) gTAATTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAGAAGCTTGCTTCTTTGCTGACGa < 1:122498/143‑1 (MQ=32) tAATTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAGAGGCTTGCTTGTGTGCTgaggag > 1:336607/1‑143 (MQ=255) tAATTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAGAAGCTTGCTTCTTTGCTGACGAg < 2:743727/143‑1 (MQ=32) agtgcATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAGATGGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTCCCAGGAAGAAGCTTGCTTCTTTGCTGACGAGt < 2:97237/139‑1 (MQ=11) ttCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAGAAGCTTGCTTCTTTGCTGACGAGTgg < 1:318751/143‑1 (MQ=32) gAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCACGTCGAACGGTAACAGGAGGAAGCTTGCTTCATTGCCGACGAGGCGCGGACggg > 2:375530/1‑143 (MQ=11) aTTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGgaagcagcaagctgcttcctgttaccgttcgacttgcatgtgttag > 1:348320‑M2/1‑97 (MQ=255) gtcTTTGAGCATCGAACGTATAACTTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGgaaacagcaagctgtttcctgttaccgttcgacttgcctgtgttcgg > 2:754876‑M2/2‑96 (MQ=255) | ATACCAAGTCTCAAGAGTGAACACGTAATTCATTACGAAGTTTAATTCTTTGAGCATCAAACTTTTAAATTGAAGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAGAAGCTTGCTTCTTTGCTGACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATG > NC_000913/4208081‑4208268 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |