Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,426,178 | A→T | 7.6% | intergenic (+198/‑276) | ydaY → / → ynaA | Rac prophage; putative uncharacterized protein YdaY/Rac prophage; putative prophage tail length tape measure domain‑containing protein YnaA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,426,178 | 0 | A | T | 7.6% | 183.3 / 6.3 | 67 | intergenic (+198/‑276) | ydaY/ynaA | Rac prophage; putative uncharacterized protein YdaY/Rac prophage; putative prophage tail length tape measure domain‑containing protein YnaA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/31); new base T (2/3); total (32/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.70e-01 |
AAGCGAGAAAAACTCAGGTTGCCACCGATACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGA > NC_000913/1426037‑1426316 | aaGCGAGAAAAACTCAGGTTGCCACCGATACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑Ac > 1:97806/1‑143 (MQ=255) cGAGAAAAACTCAGGTTGCCACCGATACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACaga > 1:57280/1‑143 (MQ=255) gagaAAATCTCAGGTTGCCACCGATACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACagag < 1:167602/143‑1 (MQ=255) gagaAAAGCTCAGGTTCCCACCGATACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACagag < 1:436800/143‑1 (MQ=255) agaAAAACTCAGGTTGCCACCGATACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAgaga < 1:139164/143‑1 (MQ=255) gaAAAACTCAGGTTGCCACCGATACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTGAAGGAGTTGTTGTACGCCTATACGGTAATATCCCGTGCCCCACGGTATGCTGGGAAAGCTGAGGTGGCCTTGCCTTAAGCACGG‑ACAGAGAt > 2:569750/1‑143 (MQ=255) atcgcgggTCGCCACCGATACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑TCAGAGATaaag < 2:316496/137‑2 (MQ=255) aaCTCAGCGTGCCACCGATACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTGAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGGAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑TCAGAGATaaag < 1:495486/143‑2 (MQ=255) aCTCAGGTTGCCACCGATACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATg > 1:545806/1‑143 (MQ=255) aCTCAGGGTGCGAGCGATACCGGAACCAGAAATGGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑TCAGAGATaaagg < 2:21693/143‑3 (MQ=255) cTCAGGTTGCCACCGATACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTACGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCACGTGCCCGACGATACGCTGCGTTTGCTTGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGa > 1:506773/1‑143 (MQ=255) cggTGGCCACCGATACCTGAACCTGAAATAGCCCCGGTGCTTCAGTGCTTGCTCGGCGCCTCTTCGACAATAGTCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAata < 2:120458/142‑1 (MQ=255) aGGTTGCCACCGATACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAGTGGCTGGCGTGCGTGTTCCTTTATCTCTG‑ACAGAGCTAGATGAata > 1:153294/1‑143 (MQ=255) gCCACGGATACCGGAACCAGAAATAGCCCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAg < 1:529767/143‑1 (MQ=255) ccACCGAGACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGc < 2:563864/143‑1 (MQ=255) cACCGATACCGGAACCAGAAATCGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGcc < 1:86904/143‑1 (MQ=255) aCCGATACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCa > 1:513878/1‑143 (MQ=255) aCCGATACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCa > 1:217939/1‑143 (MQ=255) gtACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGAAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCGTTTATCTATG‑ACAGAGCTAAATGAAAATTTAGCACCTCa > 2:542889/2‑143 (MQ=255) ggAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGCTAAATGAATATTTAGCCACTCATCCgg > 1:461802/1‑143 (MQ=255) ggAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCAATCATCCgg > 1:284288/1‑143 (MQ=255) acagacagaGTCCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTatt < 1:181113/142‑1 (MQ=255) aGAAATAGGCCCGGTGCTTAAGGAGGTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTattga < 2:505038/143‑1 (MQ=255) aTAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTAttgattga < 1:282673/143‑1 (MQ=255) tAGAGCCGGTGGTTAAGGACGTGTGGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAg < 1:116764/143‑1 (MQ=255) aGACCCGGTGCGTAGGGAGTTGTGGGACGGCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATCGCTGGGGTGCCCGTGGAGAGATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTGGGCCACTCATCCGGTATTGATTGAgc < 2:253886/143‑1 (MQ=255) gACCCGGTGCTTAAGGAGGTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAgcg < 1:100129/143‑1 (MQ=255) ttttAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATGCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAAt < 1:437458/141‑1 (MQ=255) cTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAAtt < 1:519916/143‑1 (MQ=255) gttgttGTGCGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACTTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATGAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAg < 2:384486/143‑1 (MQ=255) gttgtACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGa > 2:78994/1‑143 (MQ=255) ggtgtACGCCTAGTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGTCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGa < 2:50800/141‑1 (MQ=255) ttgtACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGAt > 2:537292/1‑143 (MQ=255) ttgtACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGAGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGAt > 1:433560/1‑143 (MQ=255) ttgtACGCCTATTCGGTAATATCCAGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCGTTGCCTTTGTCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGGATTGAATGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGAt > 2:121740/1‑143 (MQ=255) aggCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCGGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAGATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCttt < 1:495493/141‑1 (MQ=255) cGCCTATTGGGTAATAGCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACATAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTg < 2:144844/143‑1 (MQ=255) gCCTATTCGGTAATATCCCGTGCACAAAGATATACTGGACTGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTATG‑ACAGAGATAAACGAATAGTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAAGTTGACACATTGATCTTAGc > 2:45106/1‑143 (MQ=255) ccTATTCGGTAATATCCCTTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTGTG‑ATAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCa < 2:316123/143‑1 (MQ=255) ttCGGTAACATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGACCGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTGCACA‑AGTGGAAGTAGTATTTTGTCTCTCATCCGGTATTGATTGAGCGCAATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTgg < 2:554045/143‑1 (MQ=255) cGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGAt < 1:8434/143‑1 (MQ=255) aagatCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGAcc < 1:246797/140‑1 (MQ=255) atatCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAAGATTTAGCCACTCATCCGGTATTGCTTGAGCGCGATGAAGTTGACGCAGGTATCGTTGCACAGGATGAccc > 2:561408/1‑142 (MQ=255) atCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGt < 1:72166/143‑1 (MQ=255) atCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGt > 1:177804/1‑143 (MQ=255) ccGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTAtt > 1:455351/1‑143 (MQ=255) ccGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTAtt > 1:270913/1‑143 (MQ=255) tGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTc > 1:329882/1‑143 (MQ=255) ccGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGCTGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGGTGACCCCTATTTTCAgg > 1:133704/1‑143 (MQ=255) aCGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGc > 1:435840/1‑143 (MQ=255) gCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCCgtgtgt > 1:79287/1‑143 (MQ=255) cTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTAGCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAgtgtgtg < 1:233931/143‑1 (MQ=255) gAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAg > 2:233479/1‑143 (MQ=255) ggCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAgttgt < 1:303299/143‑1 (MQ=255) cgggggTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTCGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATCTTCAGGAGCAGTGTGTGTAgtcgata > 2:234593/3‑138 (MQ=255) cTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTa < 1:371130/143‑1 (MQ=255) tGGGGTGCCGTGGCCTTGTTCTCCG‑CCTGTGCTAAATGAGTATTTAGCGTTTCATGCGGTGTTGATTGATAGCGATGAATTTGAAGCAGTGTGTTTTGCACTGGATGCCCCGGATTTTCAGGTGCAGTGTGTGTAGTTGTTaa < 2:203461/143‑1 (MQ=255) ctttgcctttATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGGGCGATGAAGTGGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGtgc > 1:213508/1‑141 (MQ=255) ttgcctttATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTacac > 2:534810/1‑143 (MQ=255) ttcatttATCTCTG‑TCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACAct > 1:186826/5‑143 (MQ=255) cctttATCTCTG‑ACAGCGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACActct < 2:513878/143‑1 (MQ=255) cctttATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACActct < 2:217939/143‑1 (MQ=255) ctttATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTCGTTGTTAATTACGTACACTCTg > 2:197475/1‑143 (MQ=255) atttATCTCTG‑TCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTg > 2:335911/2‑143 (MQ=255) tttATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGt > 1:156197/1‑143 (MQ=255) tagccctG‑ACAGAGATAAATAGATATTTAGCCACGCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTa < 1:165019/138‑1 (MQ=255) tctG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACaga < 2:433560/143‑1 (MQ=255) | AAGCGAGAAAAACTCAGGTTGCCACCGATACCGGAACCAGAAATAGACCCGGTGCTTAAGGAGTTGTTGTACGCCTATTCGGTAATATCCCGTGCCCGACGTTATGCTGGAATGGCTGGGGTGCCTTTGCCTTTATCTCTG‑ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTGATCTTTGCACTGGATGACCAGTATTTTCAGGAGCAGTGTGTGTAGTTGTTAATTACGTACACTCTGTTACAGA > NC_000913/1426037‑1426316 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |