| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,978,503 | Δ776 bp | insB‑5–insA‑5 | insB‑5, insA‑5 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1978503 | 1979278 | 776 | 86 [0] | [0] 87 | insB‑5–insA‑5 | insB‑5,insA‑5 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1978502 | 0 (0.000) | 83 (1.450) | 63/266 | 0.0 | 100% | intergenic (‑305/+16) | flhD/insB‑5 | DNA‑binding transcriptional dual regulator FlhD/IS1 protein InsB |
| ? | NC_000913 | 1979279 = | 0 (0.000) | intergenic (‑64/‑474) | insA‑5/uspC | IS1 protein InsA/universal stress protein C | |||||
GAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1978356‑1978502‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTA > NC_000913/1979279‑1979420 GAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAAATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATA > 1:929419/1‑143 GGTCTTTAGACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTA < 2:95123/143‑1 GTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCCATTACTTAACATACATGTAT > 2:246367/1‑143 CTTTACTCTCATTTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCACCTGTACTCGTCACTACACGCACATACAAAGGAGGGAGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAA < 2:108669/143‑1 CTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAGTGTATAA > 2:157755/1‑143 TTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGCTTTTCAATAATGCCTGAT‑GCAGATCCCCCAAACCACTCAATTACTTCACATAAATGCATAAG > 2:408206/1‑143 TTACAGTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGT < 2:328578/143‑1 TACACTTATCTAAGATTTTGCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTC < 2:827770/143‑1 TACACTGATCTAAGATTTTTCCAAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACTCAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTC < 1:725907/143‑1 CACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAT > 1:970178/1‑143 ACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATA < 2:626208/143‑1 ACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATA > 1:789957/1‑143 ACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCAGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAACGTCTAAGTCATA > 2:719478/1‑143 TTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACT > 1:621983/1‑143 TTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACT > 1:180647/1‑143 TTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGA‑TTACAAAAAAAATTGATAATGGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACT > 1:1111975/1‑143 TATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTT < 1:179868/143‑1 tcgAAGATGTTTCCTGAAGCGACGCAGCTGTACTCGTCACTACGGGCACATACAGCGGAGGGGGGCTGCGCTTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTT < 2:9620/140‑1 TAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGT > 1:310155/1‑143 TAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGT > 2:646886/1‑143 TAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGT > 1:176315/1‑143 GATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTT < 1:91724/143‑1 GATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAATCATACTTTTGgatt > 1:372209/1‑139 GATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGAACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGCCATACTTTTGTTTT > 2:978542/1‑143 TTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGG < 2:870406/143‑1 TTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATTAATGTATAAGACAAACTTCTGCTTctttcc > 1:248834/1‑137 CTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTAT > 2:305366/1‑143 CTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTAT > 2:19603/1‑143 CTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTAT > 1:1038820/1‑143 CTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTCTGTTTTGGGTGTAT > 2:310420/1‑143 TAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATT > 1:853990/1‑143 cgcccCAACTGTCCTCGCCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGCCTGCGATTTTCAATAATGCGTAAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAAT < 2:562007/138‑1 CGACGCACCTGTAGTCGTCGCTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAAT < 2:963069/143‑1 ACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTAAATCT > 2:379614/1‑143 CAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATACGTCATCCTTCTCAATTGGGTGTATATCAATCTGTT > 2:226025/1‑143 CAACTGTACGCGGCACTACACGAACATACAACGGCGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAATCACTCTATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTT < 1:232384/143‑1 AACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTA > 1:386917/1‑143 AACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTA > 2:998081/1‑143 AACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATATCAATCTGTTA > 2:142867/1‑143 TGTACTCGTCACTCAACGCACATACAACGGAGGGGGGCTACGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAA < 2:1050013/143‑1 CGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATCTCAATCTGTTACAAAGTTTT > 1:749124/1‑143 GTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTT > 1:817389/1‑143 GTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTT > 2:372576/1‑143 CACTACACGCACATACAACGGCGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAGTTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACGCTTGTTTTGGGTTTATTTCCATCTGTTAAAGAGTTTTTCt > 2:210672/1‑142 CACGGACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACG < 2:643708/143‑1 CACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCACTCTGTTAACAAGTTGTTCGCTACt > 1:194321/1‑142 CACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAACAAGTTTTTCGCTACG > 2:113538/1‑143 ACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGC > 1:678558/1‑143 GCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTA > 1:638391/1‑143 GCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTAATACTTTTGTTTCGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAACTTTTTCGCTACGATA > 2:654593/1‑143 CACAGACAACGGAGGGGCGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTGTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAG < 2:246847/143‑1 ACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGC > 1:435511/1‑143 cagACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGAGCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCA < 2:756794/140‑1 CATGCAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTGAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTGGCTACGCTAGCA < 2:192077/143‑1 TACAACGGGGTGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAG < 2:19834/143‑1 TACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATACTGCGTGAT‑ACAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAACGCATACTTTTGTTTTGGGTATATTTCAATCTGGTAAAAAGATTTTGTGTAGGCTAGCAAG > 2:694103/1‑143 TACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAG < 1:276358/143‑1 CGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAA < 1:978772/143‑1 GGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAA > 2:173432/1‑143 GGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTAATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCTCTACGCTAGCAAGAAAAAATGACAC > 2:858480/1‑143 CTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTACATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTATGCTAGCAAGCAAAAGTGAAACccg > 1:442286/1‑140 CGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAAT > 1:118962/1‑143 TTTGCAATAATGCGTGAT‑GAAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAAT < 2:278176/143‑1 AATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAA < 2:853990/143‑1 AATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAA > 2:61049/1‑143 AATGCGTGAT‑GCACATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCCGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGG < 1:175840/143‑1 GCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGTGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGAT > 2:561926/1‑143 AT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGC < 2:621983/143‑1 ATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAG < 1:1095777/143‑1 TCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGTTGTTGCGCcctgt > 1:387543/1‑138 ACAAAACACTCATTTAGTTAAGAGCAATGTATAAGGCATACTTTTGTTTTGGGTGGATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAA < 2:87429/143‑1 aAAAACGTTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAA < 2:243551/142‑1 AAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCACACCGTTTAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGCTGTTGCGCACAGCCAAAAc > 2:446769/1‑142 AAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATA > 1:51640/1‑143 AAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAAT > 2:657352/1‑99 AAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAAT < 1:657352/99‑1 AACACTCGATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTCGGTGTATTTCAATCTCTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAA < 1:560304/143‑1 ACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAAC > 2:671600/1‑143 CACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATCGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACa > 2:941697/1‑142 AATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCG > 1:987421/1‑143 AATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCG > 1:980904/1‑143 CTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAAT < 1:174959/143‑1 AACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAAT > 1:64550/1‑143 ACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATGTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGAAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGGCAAAATAACTCACCGTAAATAATC < 2:678143/143‑1 TAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATC < 1:19603/143‑1 GTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAACCAGCAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATACCTCCCCGTAAATAATCATCTGCTA < 1:305366/143‑1 GTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTA < 1:310420/143‑1 GAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGAT‑GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1978356‑1978502‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTA > NC_000913/1979279‑1979420 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |