| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 568559 = | 1684 (60.480) | 42 (1.580) | 15/252 | NT | 2.6% | coding (245/333 nt) | emrE | multidrug/betaine/choline efflux transporter EmrE |
| ? | NC_000913 | 568576 = | 1590 (59.850) | coding (262/333 nt) | emrE | multidrug/betaine/choline efflux transporter EmrE | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 2016 total aligned reads displayed.
GGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCC > NC_000913/568417‑568701 | gTAGAATTAGTTGTTTTTGGGCATCATTCTGGTGATTAGATCGGACGCTGGCTTGTATTCCTACAGGGATTGCTTGTGCTATTTGGTTAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGTTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACgg < 2:402074/143‑1 (MQ=255) gTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACgg > 1:538313/1‑143 (MQ=255) gTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACgg > 1:419179/1‑143 (MQ=255) aagcataaaacgaggctcatataaatataagagcctccatattttagtcgtttagaaacaaattattttaatgtggtgtgcttcgtgacaataaattaataatcaacacaccggcacaaatcaacatcatgcctataatGGCt > 1:146846‑M1/140‑143 (MQ=255) gcataaaacgaggctcatataaatataagagcctccatattttagtcgtttagaaacaaattattttactgtggtgtgcttcgtgacaataaattaataatcaacacaccggcacaaatcaacatcatgcctataatGGCTgg < 1:316297‑M1/6‑1 (MQ=255) aaTTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTCTGTGGTCAGGAAACGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTgg > 1:399117/1‑143 (MQ=255) attattTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGa < 1:54586/143‑1 (MQ=255) ttattTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGAc < 1:136885/143‑1 (MQ=255) ttattTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGAc < 2:440042/143‑1 (MQ=255) tattTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGAcc < 2:292624/143‑1 (MQ=255) ttGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACCGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTgc < 2:428802/143‑1 (MQ=255) aacgaggagcagataaatataagagcttccatattttagtcgtttatatataaattattttaatgtggtgtgcttcgtgacaatatattaataatcaacactccggcacaaatcaacatcatgcctataatGGCTGGACCTgc > 2:88514‑M1/132‑143 (MQ=255) tGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAGCGGCTGGACCTgcc > 1:497451/1‑143 (MQ=255) aTTGGGCCTCCTTATGGGTATTAGCTCTGACGCTGGCTTATGTTCCTACAGGGATGGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTgccagcc < 2:105281/143‑1 (MQ=255) tgtgCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCAt < 1:296638/143‑1 (MQ=255) atccatcatTCTGGTTATTAGCTCGGACGCTGGCTTATATTCCTAGAGGGATTGTTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGTGGATTTTTCGGCCAACGGCGGGACCTGCCAGCCGtt < 2:234747/140‑1 (MQ=255) tgCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATta < 1:63552/143‑1 (MQ=255) tgCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGCACCTGCCAGCCAttc > 2:184318/1‑142 (MQ=255) gatcatTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTACTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATtata < 1:283/142‑1 (MQ=255) catcttTCTGTTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATtata < 1:430741/143‑1 (MQ=255) tcatTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAgg > 2:131519/1‑143 (MQ=255) tcatTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAgg > 1:36440/1‑143 (MQ=255) tcatTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCAGGACCTGCCAGCCATTATAgg < 1:33761/143‑1 (MQ=255) catTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATCCCCACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGc < 1:487266/143‑1 (MQ=255) aaatataagagccgtcatattttagtcgtttagaaacaaattattttaatgtggtgtgcttcgtgacaataaattaataatcaacacaccggcacaaatcaacatcatgcctataacGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGc > 2:543045‑M1/118‑143 (MQ=255) ttCTGGTTATTAGCGCAGACGCTGGGTTATATTCCTATAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTAATGTCATGGAGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCat < 2:282937/143‑1 (MQ=255) cTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCatga < 1:274723/143‑1 (MQ=255) tGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGATATTGTCCTGATTTGCTTACTGTCTTGGGGGTCTTTCTGCCCACGGCTGGCCCTGCCAGCCTTTGTAGGcatcat > 2:113439/1‑143 (MQ=255) ttattaGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGtt > 1:195540/1‑143 (MQ=255) tcctaGCTCAGACGCGGGTGTACATGCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTTGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACCGCCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTg < 1:37652/140‑1 (MQ=255) attaGTTCTGACGGTGGCTTCTCGTCCTACAGGGATTGCTTCTGCTATCTGCTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCTAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGa < 2:171675/143‑1 (MQ=255) taGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGGTTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGCCTGGACCTGCCAGCCCTTATAGGCATGATGTTGAtt > 2:504858/1‑143 (MQ=255) taGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGATATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCACTATAGGCATGATGTTGAtt > 2:121457/1‑143 (MQ=255) gaGCTCAGACGCTGGCTTAGATTCCTACAGGGATGGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGGCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGTCATTATAGGCATGATGTTGAtt < 2:248045/142‑1 (MQ=255) gCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTCGATTtg > 2:26323/1‑143 (MQ=255) cTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTtgt < 2:273661/143‑1 (MQ=255) gcAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATGGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTtgtg < 1:221634/142‑1 (MQ=255) tattttagtcgtttagaaacaaattattttaatgtggtgtgcttcgtgacaataaattaataatcaacacaccggcacaaatcaacatcatgcctataatGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGc > 1:47015‑M1/101‑143 (MQ=255) cTGGCTTATATGCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGgtgt < 1:529238/143‑1 (MQ=255) tGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTCTAGGCAGGATGTTGATTTGTGCCGgtgtg > 2:355150/1‑143 (MQ=255) gCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGtt < 1:329088/143‑1 (MQ=255) gCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATGATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGtt > 1:1081/1‑143 (MQ=255) tatTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGTTCAGGAGTCGGTTTTGTGGTTAAAACCACACTGTCATAGAGATTTTTCGGCCAAGGGCTGGACCTGCTAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGatta < 2:532270/143‑1 (MQ=255) tcctccGGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGTTATGGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTGTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGAttatta < 2:448255/143‑1 (MQ=255) cgtcAGTGATTGCTTTTGCTATCTGGTGGGGAGCCGGTATTGTCCTGATTAGCTTCCCGCCATGGGGCTTTTTCGGCCACCGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAAt < 2:195882/140‑1 (MQ=255) cTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATACGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAAt > 2:513789/1‑143 (MQ=255) gggATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTAtt < 1:442088/143‑1 (MQ=255) ggATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTAGTGTCCGGAAAAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGTACCGGCCACCCATCATAGGCATGACGTTGAATTGGGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTg > 2:138892/1‑143 (MQ=255) gATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGt < 1:117043/143‑1 (MQ=255) ttGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGTTTATTAATTTATTGTCa > 2:76787/1‑143 (MQ=255) ttGCTTATCCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGTTTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCa < 2:334365/143‑1 (MQ=255) ttGCTGATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTACCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCGGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCa < 2:364209/143‑1 (MQ=255) ggCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCAc < 1:305227/142‑1 (MQ=255) gCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACg < 1:238677/143‑1 (MQ=255) cTTGTGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATCTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCActa < 2:42155/143‑3 (MQ=255) ttATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGaa > 1:386178/1‑143 (MQ=255) ttATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAACTTATTGTCACGaa > 1:507822/1‑143 (MQ=255) tATGCTATCTGGTTTGGAGTCTGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAg < 2:4098/143‑1 (MQ=255) aTGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGc > 1:253883/1‑143 (MQ=255) aTGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGc < 1:355516/143‑1 (MQ=255) tATCGGGTGAGGAGTGGGTATTGGCCTGATTATCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCacac < 1:98790/143‑1 (MQ=255) tCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCAcacca < 2:226444/143‑1 (MQ=255) tggctaGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTGACGGTCATGGGGAGTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACcaca < 2:374060/138‑1 (MQ=255) tCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTa > 1:91133/1‑143 (MQ=255) tCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTa > 1:189687/1‑143 (MQ=255) gTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGTCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCCCACCACATTAAaataa > 1:83719/1‑143 (MQ=255) gTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCCTGATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCCCGAAGCACACCCCATTACaataa > 1:168024/1‑143 (MQ=255) tCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAaataag > 1:24352/1‑142 (MQ=255) ggTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAAttt < 1:265832/143‑1 (MQ=255) ggTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCAAATTCAAATAAttt > 2:67846/1‑143 (MQ=255) tATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGt > 2:320290/1‑143 (MQ=255) tCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTa > 2:16131/1‑143 (MQ=255) tCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTa > 1:46219/1‑143 (MQ=255) tCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTCATTTGTGCCGGAGTGTTGATTAGCAAGCTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTGCTa > 2:387487/1‑143 (MQ=255) cTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTaaa < 1:179259/143‑1 (MQ=255) gATTAGACTACTTTCAGGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGAACTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACg < 2:521253/143‑1 (MQ=255) aGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTGTTAACggcga > 2:57919/1‑139 (MQ=255) gCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTaa < 2:300645/143‑1 (MQ=255) cTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCCTTATAGGCTTGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGACGCTAAGCACACCCCATTAAAATAATTTGTTTCTAACCGCCTaca > 2:215755/1‑141 (MQ=255) cTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTaaa > 1:208629/1‑143 (MQ=255) cTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTaaa > 1:452125/1‑143 (MQ=255) cTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATGATTGATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATACTTTGTTTCCTAACGACTcaa > 2:484377/1‑143 (MQ=255) ttACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTaaaa < 1:128168/143‑1 (MQ=255) gTCATGGGGATTTGTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATgg < 2:342636/143‑1 (MQ=255) tCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATCATTTGTTTCTCAACGACTAAAATATGGa > 1:230545/1‑143 (MQ=255) tCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGa > 1:16187/1‑143 (MQ=255) tCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGa < 1:203134/143‑1 (MQ=255) tCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTATAAACGACTAAAATATGGa > 2:206286/1‑143 (MQ=255) gaTGGGGAGTTTTCGGTCAATGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAg < 2:257247/142‑1 (MQ=255) cATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCCGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGACTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAg < 1:408453/143‑1 (MQ=255) agggggATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCATATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAgg < 1:345793/141‑1 (MQ=255) aTGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTACAATATGGAgg > 2:310387/1‑143 (MQ=255) gATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCtt > 2:495302/1‑143 (MQ=255) ttttCGGCCAACGGCTGGACCTGCTAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACGACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACTACTAAAATATGGAAGCGCttata > 2:15319/1‑143 (MQ=255) ggCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCttatatttat < 1:154173/143‑1 (MQ=255) ccAACGGCTGTACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCttatatttatat < 1:516920/143‑1 (MQ=255) ccAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCttatatttatat < 1:74926/143‑1 (MQ=255) ccAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTAACGAAGCACACCACATTCAAATAACTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGGTCttatatttatat > 1:101326/1‑143 (MQ=255) ccAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGAATTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCttatatttatat > 2:470600/1‑143 (MQ=255) aaCGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGa > 2:457636/1‑143 (MQ=255) | GGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCC > NC_000913/568417‑568701 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |