| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,033,595 | C→A | 100% | P151T (CCT→ACT) | trkH → | K(+) transporter TrkH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,033,595 | 0 | C | A | 100.0% | 146.8 / ‑6.7 | 58 | P151T (CCT→ACT) | trkH | K(+) transporter TrkH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (31/26); total (31/27) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TCTTTCTCTGGCCTGACCACTACGGGAGCCACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGCCTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACGGCGAAAACCCTGTGGTTGATTTATGTCTTGCTGACCGTCGCCT > NC_000913/4033457‑4033730 | tCTTTCTCTGGCCTGACCACTACGGGAGCCACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGCTCCTGACTAt > 2:1004276/1‑143 (MQ=255)tCTTTCTCTGGCCTGACCACTACGGGAGCCACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTAt > 1:697561/1‑143 (MQ=255) ttCTCTGGCCTGACCACTACGGGAGCCACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAGTGGTTTGGCGGGATGGGGACCACCCTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTACCCt > 1:1075576/1‑143 (MQ=255) ctGGCCTGCCCACTACGGGAGCCACTACGCTGGTGGGGCTGCATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGc < 1:476070/143‑1 (MQ=255) tGGCCTGACCACTACGGGGGCCACTACGCTGGTGGGGCTGGGTTCGCGCGCTCACGCCATTCTATTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGCGGGGGATCACGGTGTTGGGGGATGCGAGACTGACTAgcggcggcg > 2:222255/1‑143 (MQ=255) tGACCACTACGGGAGCCACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCgtgggt > 2:804105/1‑143 (MQ=255) ccACTACGGGAGCCACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCGCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTGGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGtgggtggg < 1:202247/143‑1 (MQ=255) cACTACGGGAGCCACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGCTGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTACCCACGGCgtgggccgga > 2:499301/1‑138 (MQ=255) aCTACGGGAGCCACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCCGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATCCTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGAt > 1:13433/1‑143 (MQ=255) tgcGGGAGCCACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCGCACGCCGTCCTCTGTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGc < 2:424800/141‑1 (MQ=255) tACGGGAGCCACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGCGGGATGc > 1:741934/1‑143 (MQ=255) ccgcaGCCACTACGCGGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCGCGCCATCCTCGTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGAAACTGACTAGCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAg < 2:304875/139‑1 (MQ=255) cGGGAGCCACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTTCGATACTGACTCTCCTCGGCGTGGGTGGCATGCAg > 1:711058/1‑143 (MQ=255) aGCCACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCACTGGTTTTGCGGGATGGGGATGATGGTGTTGGCGGTTTCGATACTGACTATGCTCGGCGTAGGAGAGATGCAGctct > 1:756460/1‑143 (MQ=255) ccACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCGTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTAt > 1:482170/1‑143 (MQ=255) cACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGCTCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACCGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGCTGCAGCCCtctc > 2:180009/1‑143 (MQ=255) cACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGACAGATGCTGCAATGGTTCGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGGGGGATGGCGCTCTacc > 2:557974/1‑141 (MQ=255) aCTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCCCTACcg > 1:375993/1‑143 (MQ=255) tACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATcgcg > 1:382481/1‑143 (MQ=255) gtggGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAAt > 1:146239/1‑143 (MQ=255) gggCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATgcc < 1:180009/143‑1 (MQ=255) ggCTGGATTCGCTCCCTCCCGCCATCCTCTTTGTTCGTCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATgccc < 2:671199/143‑1 (MQ=255) tGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGCTGGGGATCCTCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTCTCCTCGGCGCGGGTGGGATGCAGCGCTACCGCGCAGAAATgcccggc > 2:506860/1‑143 (MQ=255) tGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCGCGGCGTGGGGGGGATGCCGCTCGATCGACCAGAACTgcccggc > 2:844210/1‑143 (MQ=255) aTTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATgcccggcccg > 1:962976/1‑143 (MQ=255) tCCCTCACGCCATCCTCGTTGATCGCCAGATGCGGCAAGGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGaaa < 1:463005/143‑1 (MQ=255) tCCCTCACGCCATCCTCGTTCATCGCCAGATGCTGCAATGGTTGGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGaaa < 1:13425/143‑1 (MQ=255) cTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAACTGCCCGGCCCGCTGAAAGAt > 2:200407/1‑143 (MQ=255) cTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGAt < 1:804105/143‑1 (MQ=255) tCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGAGGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATACCAAAATg > 1:282882/1‑143 (MQ=255) tCCGCTTTTAGCGCCCGATGCGGCAATGGTGTGGCGGGACGGGGATCATCGTGTGGGCGGTTGCGATACTCACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATg < 1:629771/143‑1 (MQ=255) tctTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCACTGAAAGATAACAAAATgcgc < 1:61437/143‑1 (MQ=255) cAGGTGCGGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTAGCCGCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGc < 1:364668/143‑1 (MQ=255) cgATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCg < 1:121369/142‑1 (MQ=255) aGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCg < 2:146239/143‑1 (MQ=255) gctgcAATGGTGTGGCGGGATGGGGATCATCGAGTTGGCGGTTGCGATCATGCTTACCCCCTTCGTGGTTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGaaa < 1:492095/143‑1 (MQ=255) gcggcAATGTGTGGGCGGGATGGGGAGCGTCGTGGTGGCGGGTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGGGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGaaa < 1:942499/140‑1 (MQ=255) tgcAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCACGGCCCGCTCAAAGATGTTAAAACGCGCCCGCGAATTGCGGAAACg > 1:395432/1‑143 (MQ=255) gcggtGGTTGGGCGGGATGGGGTTCAGCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACgg < 2:794416/139‑1 (MQ=255) cAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACGGc > 1:999733/1‑143 (MQ=255) ggggttGGTGGGGTGCGGACCATCGTGGTGGCGGTTGCTATGCTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGGAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCTGGCCCGCTGAGAGATAACAAAATGCGCCCGCGCATTGCGGAAACGGCGaa < 2:1014806/139‑1 (MQ=255) gttGGCGGGATGGGGCTCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACGGCGAAAAc < 1:864564/142‑1 (MQ=255) ggCGGGAGGGGGGTGATCGTGTGGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACGGCGAAAACCCt < 1:557974/143‑1 (MQ=255) ggATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCCGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACACAATGCGCCCGCGCATTGCGGCCACGGCGCCAGCCCTGCgg > 1:34094/1‑143 (MQ=255) ggtGGGGGTCGTCGCGTTGGCCGTTGCTATACTGACTCCCCTCGGCTTGGCTGGGATGAAGCTCTGCAGCGCTCATGCCCCCGCACCGCTGAAAGATAACAAAATGCCTCCGCGAATTGCGGAAGCGGCGAAAATCCTGTGGt < 2:126631/141‑1 (MQ=255) tcatcGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGGCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACGGCGAAAACCCTGTGGTTGATTTAt > 1:416951/1‑143 (MQ=255) tcatcGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACGGCGAAAACCCTGTGGTTGATTTAt < 1:181582/143‑1 (MQ=255) tcatcGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGAGAAATACGGAAATGGCGAAAACCCTGTGGTTGATTTAt > 1:34323/1‑143 (MQ=255) tcatcGTGTTGGCGGGTGCGCTACTGACTATCCTCGGCGTGGGTCGGATGCAGCTCTCTCGCGCAGAAATTCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGGTCGCGAATTGCGGAAACGGCGAAAACCCTGTGGTTGATTTAt < 2:400161/143‑1 (MQ=255) gcatcGTGTTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACGGCGAAAACCCTGTGGTTGATTTAt < 1:895162/142‑1 (MQ=255) tgtTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCACGGCCCCCTGAAAGATAACAAAATGCGCCAGCGAAGTGCGGAAACGGCGAAAACCCTGAGGCTGAATTATGTCTTg > 2:182268/1‑143 (MQ=255) tgtTGGCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTAGCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACGGCGAAAACCCTGTGGTTGATTTATGTCTTg < 2:31076/143‑1 (MQ=255) ggCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACGGCGAAAACCCTGTGGTTGATTTATGTCTTGCTGa < 1:245544/143‑1 (MQ=255) gccGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGAGGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACGGCGAAAACCCTGTGGTTGATTTATGTCTTGCTGa < 1:132153/141‑1 (MQ=255) gCGGTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACGGCGAAAACCCTGTGGTTGGTTTATGTCTTGCTGAc > 1:786956/1‑143 (MQ=255) gTTGCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACGGCGAAAACCCTGTGGTTGATTTATGTCTTGCTGcccct > 1:1056564/1‑141 (MQ=255) gCGATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACGGCGAAAACCCTGTGGTTGATTTATGTCTTGATGACCGTCGc > 1:947674/1‑143 (MQ=255) gATACTGACTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACGGCGAAAACCCTGTGGTTGCTTTATGTCTTGCTGACCTTCGCCt > 1:139414/1‑143 (MQ=255) | TCTTTCTCTGGCCTGACCACTACGGGAGCCACTACGCTGGTGGGGCTGGATTCGCTCCCTCACGCCATCCTCTTTTATCGCCAGATGCTGCAATGGTTTGGCGGGATGGGGATCATCGTGTTGGCGGTTGCGATACTGCCTATCCTCGGCGTGGGTGGGATGCAGCTCTATCGCGCAGAAATGCCCGGCCCGCTGAAAGATAACAAAATGCGCCCGCGAATTGCGGAAACGGCGAAAACCCTGTGGTTGATTTATGTCTTGCTGACCGTCGCCT > NC_000913/4033457‑4033730 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |