| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 570695 = | 2942 (51.390) | 35 (0.650) | 18/250 | NT | 1.3% | intergenic (+267/‑198) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/DLP12 prophage; periplasmic protein YbcL |
| ? | NC_000913 | 570719 = | 2709 (50.000) | intergenic (+291/‑174) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/DLP12 prophage; periplasmic protein YbcL | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 3408 total aligned reads displayed.
TTGGGGTAGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATA > NC_000913/570553‑570837 | tatttgatattcctttatctcattatgcataaaggcgcaatgttcatgcaaaagcaatcacaattgtacccccaacccaattatttgccacaatatacacaaagcacattgatactatctaaaaactctgctttattattagt > 2:950010‑M1/143‑143 (MQ=255) tttgatattcctttatctcattatgcataaaggcgcaatgttcatgcaaaagcaatcacaattgtacccccaacccaattattttccacaatatacacaaagcacattgatactatataaaaactctgttttattattcgTaa < 1:946951‑M1/3‑1 (MQ=255) ggggTAGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATaa < 2:230297/143‑1 (MQ=255) ggggTAGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATaa < 1:345942/143‑1 (MQ=255) gggTAGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAac > 1:452262/1‑143 (MQ=255) gtagtaAATAAGCTATACAATCTTAATCATTAGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAacac < 2:913686/143‑1 (MQ=255) gatattcctttatctcattatgcataaaggcgcaatgttcatgcaaaagcaatcacaattgtacccccaacccaattatttgccacaatatacacaaagcacattgatactatctaaaaactctgctttattattagTAacac < 1:913617‑M1/6‑1 (MQ=255) taAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGGTAAAAAATAACATCGaa > 1:219561/1‑142 (MQ=255) taAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGATCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGAc > 2:601439/1‑143 (MQ=255) aTGAGCTACACAAACTTTATCATTTGTCAGGTGAGAACTTTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACttt < 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taCAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTCTCGTAGgtg > 2:255010/1‑143 (MQ=255) aaTCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAGCGCAGTGAGTACGTGACGTCTTGGTAAGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTa < 2:1102502/143‑1 (MQ=255) aaTCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATGCTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTa > 1:553175/1‑143 (MQ=255) tAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGAAGTGGTTGAAACGGGAAATGCGTGACAAATTATTATGAGCCAAGTGGTGGATGGCACGTATGGTGAGAGGCAGGCTAAAAAAGAACACCCACTTTCGGAGGTGTAACtaac > 2:682825/1‑142 (MQ=255) aaccATTTGTGCGGTGAGAACTCTCGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaata < 1:327931/140‑1 (MQ=255) aaTCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTTTTATGAGTAAAATAGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaata < 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tttGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATaaa < 1:1035839/143‑1 (MQ=255) tttGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATaaa < 1:854678/143‑1 (MQ=255) tttGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATaaa < 2:517227/143‑1 (MQ=255) ttGGTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGAGTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAg < 2:12794/143‑1 (MQ=255) tAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCaga < 1:260398/143‑1 (MQ=255) tAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATGCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCaga < 1:203155/143‑1 (MQ=255) tGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTAGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGttt > 1:567086/1‑143 (MQ=255) gagaACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTTAAAATAGGTGAGAAAACCTTACGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGtttt > 1:715472/1‑143 (MQ=255) aaCTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAg > 1:648158/1‑143 (MQ=255) aaCTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTAATTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGttattgg > 2:661701/1‑141 (MQ=255) aCTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGa < 1:420372/143‑1 (MQ=255) 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1:53103/143‑1 (MQ=255) gctAGGTTATACAATAACAGCGACTTTCGGAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTg < 2:731647/141‑1 (MQ=255) tAGGTTAAAAAATATCACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATGATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATGATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTgcg < 2:1127338/143‑1 (MQ=255) tAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTgcg > 1:755041/1‑143 (MQ=255) aGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTGTTGCATGAACATTgcgc > 2:417876/1‑143 (MQ=255) gTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCt < 1:510293/143‑1 (MQ=255) 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1:995893/143‑1 (MQ=255) aaTAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCa > 1:1000269/1‑143 (MQ=255) TAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATa > 1:889023‑M1/1‑143 (MQ=255) | TTGGGGTAGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATA > NC_000913/570553‑570837 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |