| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1437016 = | 59 (1.030) | 15 (0.260) | 14/262 | NT | 22.8% | intergenic (‑123/‑105) | ompN/micC | outer membrane porin N/small regulatory RNA MicC |
| ? | NC_000913 | = 1550731 | 43 (0.760) | coding (271/885 nt) | fdnH | formate dehydrogenase N subunit beta | |||||
CCAGTACTTTGCTTTTCATTGAATAAATCCTTTAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTT > NC_000913/1436875‑1437158 | ccAGTACTTTGCTTTTCATTGAATAAATCCTTTAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATc < 1:859130/143‑1 (MQ=255) cAGTACTTTGCTTTTCATTGAATAAATCCTTTAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCa > 2:71056/1‑143 (MQ=255) gtcgggtggcgtgttcggagtggaacgacatccgtgatgaagtggggcactgcgtcggggtttacgataaccccgccgatctgagcgccaagtcctggacggtgatgcgctttagcgaaaccgaacagaacggcaagcTCaaa > 1:488593‑M1/139‑143 (MQ=255) gtGCTTTTCACTGAATAAATCCTTTGGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATGTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAAtt < 2:579404/142‑1 (MQ=255) ttttCATTGAATAAATCCTTTAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCctc > 1:691476/1‑143 (MQ=255) tttCATTGAATAAGTCCTTTAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCctct < 2:642728/143‑1 (MQ=255) cATTGAATAAATCCTTTAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGaa < 2:266185/143‑1 (MQ=255) cATTGAATAAATCCTTTAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGaa < 1:443101/143‑1 (MQ=255) aTTGAATAAATCTTTTAGTTATTTTATTTGTCTTGTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGaaa < 2:584420/143‑1 (MQ=255) aTTGAATAAATCCTTTAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGGGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAATACCTTAATAAAAAAATTCctctcaga > 2:482809/1‑139 (MQ=255) ttGAATAAATCCTTTAGTTATTTTATTTGACTTTTATTCCCATAGCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAGGGTCATGGAGCCGATAAATATCATTTGTTACTCCGTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGACAt > 2:748261/1‑143 (MQ=255) tGAATAAATCCTTTAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGTAAACATTCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTATTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATg > 2:223594/1‑143 (MQ=255) tGAATAAATCCTTTAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGaaaat > 2:66770/1‑141 (MQ=255) gagtggaacgacatccgtgatgaagtggggcactgcgtcggggtttacgataaccccgccgatctgagcgccaagtcctggacggtgatgcgctttagcgaaaccgaacagaacggcaagcTCAAATAATTCCTCTGAAATGa > 1:603810‑M1/122‑143 (MQ=255) aaTAAATCCTTTAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGat > 1:261259/1‑143 (MQ=255) aaTAAATCCTTTAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGat > 1:827743/1‑143 (MQ=255) aaTAAATCCTTTAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGat > 1:1102694/1‑143 (MQ=255) aTAAATCCTTTAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGTGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCAGATAAATATCATTTGTTACGCCTTACGTAACACCTTAATCAAATAATTACTCTGAAATGata > 2:834875/1‑143 (MQ=255) gaacgacatccgtgatgaagtggggcactgcgtcggggtttacgataaccccgccgatctgagcgccaagtcctggacggtgatgcgctttagcgaaaccgaacagaacggcaagcTCAAATAATTCCTCTGAAATGataata < 2:66002‑M1/27‑1 (MQ=255) gaacgacatccgtgatgaagtggagcactgcgtcggggtttacgataaccccgccgatctgagcgccaagtcctagacggagatgcgctctagcgaaaccgaacacaacggcaagcTCAAATAATTCCCCTCAAATGatcata < 2:852194‑M1/27‑1 (MQ=255) aacgacatccgtgatgaagtggggcactgcgtcggggtttacgataaccccgccgatctgagcgccaagtcctggacggtgatgcgctttagcgaaaccgaacagaacggcaagcTCAAATAATTCCTCTGAAATGAtaataa > 1:977920‑M1/116‑143 (MQ=255) tttAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCTTCGGCAACGAGAACAAGtat > 2:974136/1‑141 (MQ=255) accagtgaggaggcggggcactgcgtgggggtttacgagaaccgcgccgatctgagggccaagtcctggacggtgatgcgctttagcgaaaccgaacagaacggcaagcTCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTgg > 2:366598‑M1/110‑143 (MQ=255) aGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGt > 1:1019948/1‑143 (MQ=255) aGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGt > 1:959323/1‑143 (MQ=255) ccgtgatgaagtggggcactgcgtcggggtttacgataaccccgccgatctgagcgccaagtcctggacggtgatgcgctttagcgaaaccgaacagaacggcaagcTCAAATAATTCCTCTGCAATGATAATAAGtctgctg < 2:877779‑M1/36‑4 (MQ=255) tattttatttGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGaa < 1:71056/143‑1 (MQ=255) tttGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATACTAAATGATGAGGTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCg > 1:776113/1‑143 (MQ=255) tcgtcTTTTATGCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGATAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTATGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGa < 2:483422/139‑1 (MQ=255) gggcactgcgtcggggtttacgataaccccgccgatctgagcgccaagtactggacggtgatgcgctttagcgaaaccgaacagaacggcaagcTCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGACTGTATCGAAGa < 2:439537‑M1/49‑1 (MQ=255) ccTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGa > 1:1046091/1‑143 (MQ=255) tATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGataata < 1:507287/143‑1 (MQ=255) ctgcgtcggggtttacgataaccccgccgatctgagcgccaagtcctggacggtgatgcgctttagcgaaaccgaacagaacggcaagcTCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGataata < 1:533863‑M1/54‑1 (MQ=255) caatacgctcgACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATACTACATACAAAATaa < 1:687324‑M1/132‑1 (MQ=255) ggAGTGAAAACATCCTAAGGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATaaaa < 1:176915/143‑1 (MQ=255) ggAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAAGACATACAAAATaaaa > 2:820103/1‑143 (MQ=255) gTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAAtt < 1:43125/143‑1 (MQ=255) tGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCTATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATta < 2:724271/143‑1 (MQ=255) tGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGACGATAATACATCCAAAATACAAATta > 1:959394/1‑143 (MQ=255) aaaaCATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATtata < 2:911938/143‑1 (MQ=255) ccccgccgatctgagcggcaagtcctggacggtgatgcgctgtagcgaaaccgaacagaacggcaagcTCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATAc > 1:506946‑M1/69‑143 (MQ=255) cgccgatctgagcgccgagtcctggacggtgatgcgctttagcgaaaccgaacagaacggcaagcTCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACttt < 2:408260‑M1/78‑1 (MQ=255) gccgatctgagcgccaagtcctggacggtgatgcgctttagcgaaaccgaacagaacggcaagcTCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACtttt > 1:794588‑M1/65‑143 (MQ=255) aTCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACtttt > 2:706742/1‑143 (MQ=255) atAAAGTATAAGTTTAGTTTGACTATAAATATCAGTTTTTACGACTTAAGGAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAAt < 1:623379/142‑1 (MQ=255) tAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAAtt > 2:51960/1‑143 (MQ=255) aaaGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAAttt > 1:591576/1‑143 (MQ=255) ctgagcgccaagtcctggacggtgatgcgctttagcgaaaccgaacagaacggcaagcTCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTg > 2:826661‑M1/59‑143 (MQ=255) aaGGAGAAGTTCAGTTAGCCTATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTg < 2:492566/143‑1 (MQ=255) aaGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTg > 2:211779/1‑143 (MQ=255) aaGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTg < 1:974136/143‑1 (MQ=255) ggAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTCCGCCTTAAGTACAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGCTAATAAGCCTGGTGAATGTCTCGCCCATAATACCTACAAACTAACAATTCTACTTCTAAtctcct > 2:351068/1‑138 (MQ=255) gaAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTATGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCtata < 2:1677/143‑1 (MQ=255) gTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATCATAATTTTAATGTGCTATACga > 2:771897/1‑142 (MQ=255) tcctggacggtgatgcgctttagcgaaaccgaacagaacggcaagcTCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTAtt < 1:540974‑M1/97‑1 (MQ=255) aGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTAtt < 2:1118901/143‑1 (MQ=255) ttAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATCAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAACAATTATACTTTTAATTTGCGAGACGTTATTCt > 2:841150/1‑143 (MQ=255) gCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAAGGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTgcg < 2:422957/143‑1 (MQ=255) cGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGcgcg > 1:333433/1‑143 (MQ=255) ggtgatgcgctttagcgaaaccgaacagaacggcaagcTCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATCCTTTTAATTTGCTCTACGTTAGTCTGCGCgg < 1:456141‑M1/105‑1 (MQ=255) gATAAATATCAGTTGTTACGCCTGAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAAGGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAACTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCgg < 1:36605/143‑1 (MQ=255) gatgcgctttagcgaagccgaacagaacggcaagcTCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAAGGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGtt > 2:18808‑M1/36‑143 (MQ=255) atatCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTtat > 1:144027/1‑143 (MQ=255) tCATTTGATACGCCTTAAGAAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCAGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATg < 1:280238/143‑1 (MQ=255) tttGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCt > 1:456913/1‑143 (MQ=255) ttGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATCAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCtt > 2:522460/1‑143 (MQ=255) ttGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCtt > 1:456655/1‑143 (MQ=255) ttGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCtt > 1:750663/1‑143 (MQ=255) gTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTa < 2:184490/143‑1 (MQ=255) ttACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGACGATAATACATACAAAATCAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGAGGGTTATATGCTTTTAt > 2:223491/1‑143 (MQ=255) ttACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTAt > 1:364784/1‑143 (MQ=255) ttACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTAt > 2:1119647/1‑143 (MQ=255) gCCTTAAGTAAAGCCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTTTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTc < 1:22569/143‑1 (MQ=255) caaCCTTAGTCAATTAATTCCTCTGAAATTATAATAAGTCTTGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGatttta < 2:1043344/142‑1 (MQ=255) aaaCCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCCTTCTCGTCAAAGatttta > 2:440263/1‑143 (MQ=255) aaCCTTAATCAAATAATTCCTCTGACAAGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGCTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGattttat > 1:232917/1‑143 (MQ=255) aaCCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTTTCACAGattttat > 2:992965/1‑143 (MQ=255) aCCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGattttatt < 1:840655/143‑1 (MQ=255) caagcTCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGattttatttt < 2:520128‑M1/138‑1 (MQ=255) cTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGattttatttt > 2:696263/1‑143 (MQ=255) cTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTAATATGCCTTTATTGTCACAGattttatttt > 1:319675/1‑143 (MQ=255) ttAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTGTATTGTCACAGATTTTATTTTc > 1:88052/1‑143 (MQ=255) aagcTCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATGGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTc < 1:1081684‑M1/139‑1 (MQ=255) tAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATACTACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCt < 2:40014/143‑1 (MQ=255) aTCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGt < 1:540099/143‑1 (MQ=255) aTCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGt < 1:1090431/143‑1 (MQ=255) TCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTGTATTTTCTGtt < 1:947802‑M1/143‑1 (MQ=255) TCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGCGAATGTAACGAAGATCATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATGTTCGAGACGTTATTCTGCGCGGGGTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTCTTTTCTGtt < 2:455473‑M1/143‑1 (MQ=255) | CCAGTACTTTGCTTTTCATTGAATAAATCCTTTAGTTATTTTATTTGCCTTTTATCCCCATTTCGGGGAGTGAAAACATCCTAAAGGAGAAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGAATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTT > NC_000913/1436875‑1437158 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |