New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 774622 | 36 (0.630) | 5 (0.090) | 3/252 | NT | 14.0% | intergenic (+20/‑130) | ybgE/ybgC | cyd operon protein YbgE/esterase/thioesterase |
? | NC_000913 | = 774648 | 27 (0.490) | intergenic (+46/‑104) | ybgE/ybgC | cyd operon protein YbgE/esterase/thioesterase |
CTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCTGTTTCGATGGCCGGTTCGCGTCTAC > NC_000913/774509‑774790 | ctgtCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTGTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttt < 2:253498/140‑1 (MQ=255) tCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGGTTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGGCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTACGGGCCCATAAAtgttta < 1:487384‑M2/143‑7 (MQ=255) ccGCAGAAGGTTCAATGACGAGTTATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTCCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCACAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCt < 1:31365/143‑1 (MQ=255) gTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAACTTTTTACGCTCCCTTCACt > 1:999188/1‑143 (MQ=255) tttGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGcc > 1:484979/1‑143 (MQ=255) tttGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACCCTCCCTTAACCTGcc > 2:739163/1‑143 (MQ=255) cAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCAt > 1:438419/1‑143 (MQ=255) aggggATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCAtt < 2:150388/141‑1 (MQ=255) ggaaattttGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCCGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCGTTccc > 2:754643/6‑143 (MQ=255) aTTCTTGGCCCATTGCGTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCaa < 1:69335/143‑1 (MQ=255) cccATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAAt > 1:786130/1‑143 (MQ=255) ccGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTCCCCTCATTCACAAACCTCAATCGCGCTCG‑tct > 2:118421/1‑141 (MQ=255) tatTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTTGCCTCTTTCCCAGACCTCAATGTCGCGGG‑TAtagta > 1:446074/1‑143 (MQ=255) ctctcATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAAACAGAATTCTCTTTAGAAACTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATCCTCACGCTCCTTTACCGTACCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTagcagc > 1:704885/2‑143 (MQ=255) aTTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTa < 2:891552/143‑1 (MQ=255) ttGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTGTTAAAGCAGAATTCTCTTTAATTAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCATTCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTaa < 2:178761/143‑1 (MQ=255) gTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTaaaa < 1:1043018/143‑1 (MQ=255) cggacTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTAAAAGc < 1:677240/139‑1 (MQ=255) tGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGGCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCGCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTaa < 2:468844/143‑1 (MQ=255) gATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCTGCGTTTAAAAGCTCTAAc > 1:695772/1‑143 (MQ=255) aTTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGGAGCAGCGTTTAAAAGCGCTAGCt > 1:438567/1‑143 (MQ=255) cttctgcttTTAGATCAGACTTCTCTTTAACAGAGTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCGTAATTTGCCCTCTTTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTAATAGCTCTAACTTttgt < 2:954981/143‑1 (MQ=255) ttcttcttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACttt > 1:1006200/1‑139 (MQ=255) ttcttcttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACttt < 2:1006200/139‑1 (MQ=255) tcttcttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTttgttg < 2:605376/143‑1 (MQ=255) cttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCAtt > 1:833856/1‑143 (MQ=255) ttttAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaataagcccgacaatgagaacaatatcggcaagcaatgggcaaaaaatccctagac < 2:853834‑M2/143‑92 (MQ=255) ttttAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaacaagaaaatcaacccgacaatgagaacaatataggcaaacaatgggcaaaaaataccttgcc < 2:89492‑M2/143‑92 (MQ=255) tttAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagcaatgggcaaaaaatcccttgcca < 1:799969‑M2/143‑93 (MQ=255) aGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTAGCGGGATgg > 2:576760/1‑142 (MQ=255) tctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTAACACGAATCAATCGCTGGAGCAATAATCG‑TGTTGTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGa > 2:500821/1‑143 (MQ=255) tttAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaggaaactcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagcaatgggcaacaaatcccttgccaaagcacctgctgcggaa < 1:409037‑M2/143‑110 (MQ=255) tttAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagcaatgggcaaaaaatccctagccaaagaacatactgcggac < 2:697095‑M2/143‑110 (MQ=255) tttAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTGGTTGCATTACCGGGATGTAAGGTGagt > 1:68368/1‑141 (MQ=255) aaaTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCCGCGCTTACAAGCGCGAACTTGTGTTGCATTACCGGGATGTAACGTGAATACAACg > 1:1071825/1‑143 (MQ=255) aTAAATCTTTATGCTCCCTTGACTTGCCCTCATTCGCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCTGTTTCGATGGCCGGTTCGCGt < 2:66428/143‑1 (MQ=255) aaaTTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGACTACAACGCTGTTTCGATGGCCGGTTCGCGTct < 1:1078835/143‑1 (MQ=255) aaaTTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCTGTTTCGATGGCCGGTTCGCGtgt > 1:133569/1‑141 (MQ=255) aaaTTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCTGTTTCGATGGCCGGTTCGCGTct > 1:136133/1‑143 (MQ=255) aTTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATCGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGCTGTAAAGTGAATACAACGCTGTTGCGATGGCCGGTTCCCATctaa > 2:59090/1‑142 (MQ=255) | CTTTCGTCCGCAGAAGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCG‑TATAGTAGCAGCGTTTAAAAGCTCTAACTTTTGTTGCATTACCGGGATGTAAAGTGAATACAACGCTGTTTCGATGGCCGGTTCGCGTCTAC > NC_000913/774509‑774790 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |