Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,513,638 | A→G | 7.8% | V199V (GTA→GTG) | nupC → | nucleoside:H(+) symporter NupC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,513,638 | 0 | A | G | 7.8% | 165.4 / 3.5 | 64 | V199V (GTA→GTG) | nupC | nucleoside:H(+) symporter NupC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/29); new base G (3/2); total (33/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.38e-01 |
AAGATATCCTCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTT > NC_000913/2513505‑2513780 | tatatatTCTCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATg < 2:967616/140‑1 (MQ=255) tCCGCGGCAAAATCTCCGGTGATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGc < 2:296210/143‑1 (MQ=255) tCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCAcc > 1:4224/1‑143 (MQ=255) aaaaTCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTGCTGAACATGTTCAGTAccagcgc < 1:398685/143‑6 (MQ=255) tctcCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTg < 2:551610/143‑1 (MQ=255) tctcCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTg < 1:724288/143‑1 (MQ=255) tctcCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTg < 1:581169/143‑1 (MQ=255) cccGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTACGCGCACACATGACCCTGCCGGTACCGCAATACGTCGCTGCTGCGCTGGTCCCGTACATGTTCAGCACGTTCATCGTGCTg > 2:847170/1‑143 (MQ=255) ccGTAATCCTATGTACTCCATGGCTGCCACCACCATGTCCTCCGCGTCCCTGTCCTACGCTGGTGCACACACGACCACGCTGCAACCCACATACGCCATCGCAAAAGAGAAGCTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGt < 2:400565/143‑1 (MQ=255) cGTAATCGTATGTACACCATTGCTGCAACGGCAATGTCCACCGTATCGATATCCATCGATGGTGAATACATAACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTAGCTGCGCTGGTACTGAACACAGTCAGCACCTTAACAGTGCTGTc > 2:871728/1‑143 (MQ=255) gTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTTAACATGTTCAGCCACTTTATCGTGCTGTCg > 2:180244/1‑143 (MQ=255) tactCGTGTGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGc < 1:498409/140‑1 (MQ=255) aaTCGGATGTACACCATTGCTGCCACGGGAATGTGCACCGAGTCGATGGCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCt < 1:488896/143‑1 (MQ=255) aTCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGGCCATGCTGGAACCGAAATACGCCGTTGCTGCGCGGGTACTGAACAAGATAAGCACCCTTGTCGTGCTGCGGCTg > 2:26369/1‑143 (MQ=255) ggTATGGACGCCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCAGCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGAt < 2:57700/142‑1 (MQ=255) tATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTCGTACGCGGTGACTTACCATGTTCAGCACCTTCATCGTGATGTCGCTGACCa > 1:473740/1‑143 (MQ=255) ttgtcacccAGGGCCGCCACCGCAATGGCCACCGTGTCGATGTCCCTCGTTGGTGCATACATTACCAGGCTGGAACCGAAATATGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCaa < 2:17464/136‑1 (MQ=255) cacCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTCCTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCACTCCtt > 1:421149/1‑143 (MQ=255) ctaTGGCTTCCACGGCAATGTCGCCCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCTTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGTTGTCGCTGATCAATCCTTAc < 2:931958/141‑1 (MQ=255) cATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCGGTCGCCGATCAAGCCTTAcc > 2:772436/1‑143 (MQ=255) gCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCgcgt > 2:148003/1‑143 (MQ=255) ggcACGGCAATGTCCACCGTGACGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTCTCGTGTTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGa < 1:529099/141‑1 (MQ=255) gCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACATCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTGTAGGGCTGTCGCTGATCAATCGTTACCGTGTTgc > 2:540963/1‑142 (MQ=255) aCGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAACTCCGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATCTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGc > 1:255675/1‑143 (MQ=255) aCGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGGCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGc > 1:318626/1‑143 (MQ=255) cGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAAAATGCTCAGCACCGTTATCGTGCTGTCGCTGCTCAATCCTTACCGTGTTGTTGcc > 1:256544/1‑143 (MQ=255) ggCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCa > 2:713968/1‑143 (MQ=255) ccacgTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCACACATGACCATGCTGCAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGt < 2:813944/139‑1 (MQ=255) cAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGt < 1:1090611/143‑1 (MQ=255) gaTGTCCACCGCGTCGATGGCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTg < 2:904630/142‑1 (MQ=255) tGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTgaa < 2:660252/143‑1 (MQ=255) aCCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATAGATGAACAGGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGaaaa < 1:601101/143‑1 (MQ=255) aCCGTGCCGATGTCCATCGTTGGTTCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCCCCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGaaaa < 1:156297/143‑1 (MQ=255) aTGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAGATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACAt > 2:16454/1‑137 (MQ=255) aTGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAGATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACAt < 1:16454/137‑1 (MQ=255) aTGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCGGTGAAGAAAACATCCAGAt > 2:704819/1‑143 (MQ=255) cATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTCGAAGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCa < 1:98551/143‑1 (MQ=255) tCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCACTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAAc < 2:478765/143‑1 (MQ=255) gTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCACAGAAAAAAACATCCAGATCTCCAAccc > 2:185638/1‑142 (MQ=255) ggTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCa > 2:410663/1‑143 (MQ=255) cATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGac > 2:465457/1‑142 (MQ=255) aCATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGt > 1:942068/1‑143 (MQ=255) aCATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGACGGTGTTTAATCCTAACCGTGTTGGTGGTGGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGt > 1:42332/1‑143 (MQ=255) cATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGAGGTCCAACCTGCACGACGGTCAGCGct > 1:393725/1‑143 (MQ=255) aTGCTGGAACCGAGATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGctt < 2:414340/143‑1 (MQ=255) tGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCCCGACGGGCAGAGctcc > 2:428154/1‑141 (MQ=255) tGGATCCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCttcttc < 1:773232/143‑1 (MQ=255) aaCCGACATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTCCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGaa < 1:530464/143‑1 (MQ=255) agtACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTCAACATGCTCAGCATGTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTGACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTg < 2:707590/141‑1 (MQ=255) agtACGTCGTGGCTGCGCTGGTACTGAACATGTGCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCGTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGGCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTg < 1:1087665/141‑1 (MQ=255) aTACGTCGTTGCTGCGGTGGTACTGAACATTTTCGGCACCTTTATCGAGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTgg < 2:975477/143‑1 (MQ=255) gtcgtTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGa < 1:273080/143‑1 (MQ=255) tcgtTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGaa > 2:133545/1‑143 (MQ=255) tgctgcGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAGGGTCCGAGCTTCTTCGGAATGCTGGGTGAATACa > 1:233367/1‑143 (MQ=255) tgcGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTc > 1:495508/1‑143 (MQ=255) gcgcTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGGGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCCGGGCTTCTTCGAAAGGCTGGGTGAATACATTCt > 1:289654/1‑143 (MQ=255) gcgcTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTCATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCt < 2:729882/143‑1 (MQ=255) tGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCGTTACCGTGTAGATGCTAGTGCTGAAAACAGCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCa > 1:829647/1‑143 (MQ=255) tGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATCCATTCTAGCa > 1:440519/1‑143 (MQ=255) tGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGct > 2:315804/1‑142 (MQ=255) ggTGCTGAACATGTTCAGTACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTATTCGAAATGCTGGGTGAATACAGTCTGGcgg > 1:180994/1‑141 (MQ=255) ggTGCTGAACATGTTCAGTACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATACAGATGTCCAACCAGCACTAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAg > 2:978554/1‑143 (MQ=255) ggTGCTGAACATGTTCAGTACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAATGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGACGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACGTGCTGGCAg > 1:1127993/1‑143 (MQ=255) ggTACTGACCATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAg < 2:816663/143‑1 (MQ=255) aCTGAACATGTTCAGCACCTTTAGCGTGCTGTCGCTGATCAAGCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGtt < 2:1050335/143‑1 (MQ=255) | AAGATATCCTCGGCAAAATCTCCCGTAATCGTATGTACACCATGGCTGCCACGGCAATGTCCACCGTGTCGATGTCCATCGTTGGTGCATACATGACCATGCTGGAACCGAAATACGTCGTTGCTGCGCTGGTACTGAACATGTTCAGCACCTTTATCGTGCTGTCGCTGATCAATCCTTACCGTGTTGATGCCAGTGAAGAAAACATCCAGATGTCCAACCTGCACGAAGGTCAGAGCTTCTTCGAAATGCTGGGTGAATACATTCTGGCAGGTT > NC_000913/2513505‑2513780 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |