| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,866,487 | G→C | 6.3% | intergenic (+22/+72) | ygbN → / ← rpoS | putative transporter YgbN/RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,866,487 | 0 | G | C | 6.3% | 191.8 / 4.4 | 75 | intergenic (+22/+72) | ygbN/rpoS | putative transporter YgbN/RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/38); new base C (3/2); total (34/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.40e-01 | |||||||||||
TTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGTTTGCAGGATTTCGCGCAAACGGCGCAGGCCTT > NC_000913/2866347‑2866629 | ttGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTGATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGc > 1:1038854/1‑143 (MQ=255) gACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCg < 1:1004224/143‑1 (MQ=255) ccAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTGATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGa > 1:182555/1‑143 (MQ=255) ccAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGGCCGATGGGCAGCggt > 2:1074272/1‑142 (MQ=255) cAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGAc > 1:750544/1‑143 (MQ=255) cAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGAc > 2:132197/1‑143 (MQ=255) cAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGAc < 1:312145/143‑1 (MQ=255) aaaTATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGAcc > 1:1280/1‑143 (MQ=255) tgtCTGGGGTGTTCGGTAGCAGACGGTCTGAATACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGCATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGCCCCTCGGACCttt < 1:987545/141‑1 (MQ=255) tatCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGCCCATCGGACCttt < 1:966509/143‑1 (MQ=255) tCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCttttc > 2:845779/1‑142 (MQ=255) tCTGGGGTTGGCGTTAGCAGACGGTCCGACAACCTGGACACTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTTCGATGGGCATCGGACCTTTTa < 1:397333/143‑1 (MQ=255) cggggTTGTCGGGAGCAGACGGCCTGAAAAGCTGGACAGTGTTAACGACCATGTGAGGGTATACCGAATTCTTAATGACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTAtt < 1:520184/142‑1 (MQ=255) ttGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTTca < 2:293907/143‑1 (MQ=255) cggACGGTCTGGAAACCTGGACAGGGTTAACGAGCAGTCTCGGGTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGGGCTTATTGCCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGc < 2:682309/141‑1 (MQ=255) aGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGCCGGTCATTTGACCTTAATAAAAGGGTCCGATGGGCATCGCCCCTCTTCTTGTGCACGGAAGAGccc > 2:369833/1‑143 (MQ=255) gACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGGTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCa < 2:804843/143‑1 (MQ=255) cTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCg < 2:606779/143‑1 (MQ=255) tGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTACTTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGc > 2:107654/1‑143 (MQ=255) aaaaCCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTGTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGcct > 2:724809/1‑141 (MQ=255) ccTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTgaga < 2:728970/143‑1 (MQ=255) gACGGTGTTAACGGCCACTCTCGGTTGTACCGGATTCTTAGTTGCCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTgg < 2:879419/143‑1 (MQ=255) aCAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACAGGCTATATTTGAATCGAGTGCGTATGGGCGCTAATGCTACCTTAATAAAAATGACCGATCGGCAGCGGACCTTTTATTTGGCACAGAAAATGCCAGCCTCGCTCGAGACTgcc > 2:986656/1‑141 (MQ=255) tgtTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCttt > 1:1050710/1‑143 (MQ=255) tgtTAACGACCAGTCTCGGTCTTACCCCATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCttt < 1:301746/143‑1 (MQ=255) ttgaCGACCATTCTCGGGGTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTGATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCt < 2:189287/140‑1 (MQ=255) aaCGACCAGTCTCGGATTTCCCCGATTCTTAATTACCTGGTGCGCATGGGCGGTAATTTGTCCATTATAACTTGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGAGCTTTCGTTATGCCATCCTCCCTTGAGACTGGCCTTTCTGa < 2:552783/143‑1 (MQ=255) gaTTCTCGGTTGTGCCGGGTTCGTAATTGCCTCGGGTGGATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAGAGGTCCGATGGGCATCGGGCCTTTTATTGGGCTCAGAAAAGGCCGGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATg < 2:462522/142‑1 (MQ=255) ttCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGcc > 1:940076/1‑142 (MQ=255) tcGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAATGTCCGATGCGCATCGGACCATTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTCCTCACAGATGcctac > 2:285141/1‑143 (MQ=255) gtttgtccGTATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGTTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGcttactta < 2:1087500/137‑1 (MQ=255) aCCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTcgc < 2:1078677/143‑1 (MQ=255) ccGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTcgcg < 2:750544/143‑1 (MQ=255) cGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCgg < 1:676092/143‑1 (MQ=255) cGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTATTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACCTACTCGCgg > 2:581319/1‑143 (MQ=255) gATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGaa > 2:31662/1‑143 (MQ=255) ttCGTAATGACGTGGTGCGTAGGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAACGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACa < 1:2997/143‑1 (MQ=255) cTTCATGACCGGGTGCGTATGGGCGGTAGTTTGACCTTAATAAGAACGTAACCAATGCTGCTGTTGTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAgc < 1:825051/143‑1 (MQ=255) cTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAgc > 1:706103/1‑143 (MQ=255) aaTTACCTGGTGCTTAGGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACCGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCt < 1:1056030/143‑1 (MQ=255) aTTGCCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATACAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCtt < 1:185703/143‑1 (MQ=255) ttACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTc < 1:1038087/143‑1 (MQ=255) ttACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTc > 2:1131641/1‑143 (MQ=255) tgTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAAGAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTGTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGGTTCGATAtt < 2:716879/142‑1 (MQ=255) ggTGTGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAGCAGCGCTTCGATAtt > 1:7470/1‑143 (MQ=255) gTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTc < 2:1050710/143‑1 (MQ=255) ggCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCa < 1:503221/142‑1 (MQ=255) gCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATTCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAg < 2:61649/143‑1 (MQ=255) cgtgggggTGGTAAGTGGACCTTAGTGAGAAGGTCCGATGGGCATCGGACCGTTTATTGGGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGGGACTGGCCTGTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGc < 2:1049761/138‑1 (MQ=255) tGGGCGGTAATTTGCCCTTCGTCAACAGGTCCTATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCt < 2:936171/143‑1 (MQ=255) tggTGATTTGATCTTAAGAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCATAGAAAAGGCCAGCCGCGCGTGAGACTGGCCTTTCGGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGt < 2:499368/142‑1 (MQ=255) cGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATGTTCAGCCCCTGCGt > 2:880028/1‑143 (MQ=255) gTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGttt > 1:799664/1‑143 (MQ=255) gTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTGTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGCCCGATGCTTACTTCCTCGCGGAACAGCGCTTCGTTCTTCAGCCCCTGCGttt > 1:313976/1‑143 (MQ=255) aTTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGTTTGCa < 1:346969/143‑1 (MQ=255) aTTTGACCTTAACAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGCCCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGTTTGCa < 1:343854/143‑1 (MQ=255) ttGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGTACCGTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACGGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGTTTGCAgg > 2:687222/1‑143 (MQ=255) tGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCTGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGTTTGCAGGa < 1:668173/143‑1 (MQ=255) cTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGCTATTCAGCCCCTGCGGTTGCAGGAttcc > 2:323955/1‑141 (MQ=255) 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1:839918/1‑143 (MQ=255) tCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGctta > 1:203862/1‑78 (MQ=255) tCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGctta < 2:203862/78‑1 (MQ=255) tCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGTTTGCAGGATTTCGCGCAAACGgcgc < 1:132197/143‑1 (MQ=255) tCCGATGCCCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAACAGGCCAGACTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGTTTGCAGGATTTCGCGCAAACGgcgc > 2:344585/1‑143 (MQ=255) ccGATGGGCGTCGGCCCTTGTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGTTTGCAGGATTTCGCGCAAACGGCGCa < 1:1074272/143‑1 (MQ=255) gctGGGCAGCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGTTTGCAGGATTTCGCGCAAACGGCGCAgg < 2:408600/141‑1 (MQ=255) gATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCGGACCAGCCGTTTGTAGGATTTCGCGCAACCCGCGCAgg > 1:876997/1‑143 (MQ=255) aTGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGTTTGCAGGATTTCGCGCAAACGGCGCAGGc > 2:925788/1‑143 (MQ=255) aTGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGTTTGCAGGATTTCGCGCAAACGGCGCAGGc > 1:228879/1‑143 (MQ=255) aTGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGTTTGCAGGATTTCGCGCAAACGGCGCAGGc < 1:725480/143‑1 (MQ=255) ggCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGTCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGCTTGCAGGATTTCGCGCCAACGGCGCAGGccct > 2:709184/1‑141 (MQ=255) | TTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACCTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTGCGTTTGCAGGATTTCGCGCAAACGGCGCAGGCCTT > NC_000913/2866347‑2866629 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |