| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,917,909 | T→G | 6.2% | intergenic (+96/+136) | barA → / ← gudD | sensory histidine kinase BarA/D‑glucarate dehydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,917,909 | 0 | T | G | 6.2% | 216.1 / 6.1 | 86 | intergenic (+96/+136) | barA/gudD | sensory histidine kinase BarA/D‑glucarate dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/36); new base G (4/2); total (48/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.87e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.27e-01 | |||||||||||
GAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACG > NC_000913/2917769‑2918050 | gagaTGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCACTCGACGATTTATGACGCGGGTTTCAGATTGGTGACAACGTGGCTGTGCTTATGCCGGATGCGGCGGTAACGCCTTa > 1:190310/1‑143 (MQ=255) ggATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCg < 2:256899/143‑1 (MQ=255) ggATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCgg < 1:439249/143‑1 (MQ=255) ggATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTCTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCgg > 1:113951/1‑143 (MQ=255) taTAATGTCGCGCGCGAAGCCAGC‑AACATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGc < 1:59793/142‑1 (MQ=255) tCGCGCGCGAAGCCAGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACaaa > 2:110237/1‑143 (MQ=255) cgcgcgcgAAGCCAGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGCTGTCTTGGCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACaaaa < 1:94472/143‑1 (MQ=255) accgcgcgAAGCCAGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGCTAACGCCTTATCCGGCCTACaaaa > 2:754427/3‑143 (MQ=255) cgcgcgAAGCCAGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATGCGGACTACAATAcc > 1:412371/1‑143 (MQ=255) cgcgcgAAGCCAGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCGGGGTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAcc > 2:94812/1‑143 (MQ=255) cgcgAAGCCAGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCaa > 2:565140/1‑143 (MQ=255) gcgAAGCCAGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAAt < 1:977767/143‑1 (MQ=255) cgAAGCCAGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTGCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTGGAAAAGCAAtt > 1:1024859/1‑143 (MQ=255) ccAGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTGTGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAATCAATTAAAtt > 1:61428/1‑143 (MQ=255) ccAGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAAtt < 2:1115725/143‑1 (MQ=255) aGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGTTGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCa > 2:334012/1‑143 (MQ=255) aGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCGATTAAATTCa > 1:92608/1‑143 (MQ=255) tc‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCaa < 1:661297/142‑1 (MQ=255) gC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGATTAGCATTCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCaa < 1:533102/143‑1 (MQ=255) gC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTCTCCGGCCTCCCAAACCACTTAAATTCac > 1:1085555/1‑142 (MQ=255) gC‑AAAATTCTCCGTTATTGGATGTCTTGTCGAGTATCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTGCAGATTGGTGATAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAGTTCaa < 2:940501/143‑1 (MQ=37) ggaaaaTTCTCGGGTAATGGGTGTTTTGGCGAGTAGCAATAGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCaa < 2:613321/141‑1 (MQ=255) c‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGAGCAAGTGCCTGTGTCTATGCCGGCTGCGGCGTGAACGCCTGACCCGGCCTACAACACCGACTAGATTCaac > 2:441487/1‑142 (MQ=255) c‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAAt < 2:467871/143‑1 (MQ=255) aaaaTTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATg > 2:655773/1‑143 (MQ=255) aTTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAAt < 1:18337/143‑1 (MQ=255) tctcGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTa > 1:508349/1‑143 (MQ=255) gTAATGGCTGTCTTGGCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAat < 2:437872/143‑1 (MQ=255) gTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTaaaaaac > 2:819465/1‑142 (MQ=255) gTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAat < 1:376392/143‑1 (MQ=255) aTGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAGAAActgat > 1:171968/1‑143 (MQ=255) aTGGATGTCTTGTAGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGACTGGTGCTATAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatgat < 2:394010/143‑1 (MQ=38) gATGTCTTGACGACTGGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTa < 1:149239/143‑1 (MQ=255) tGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTATGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGa < 1:569125/143‑1 (MQ=255) tCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAACAAATGATGTacaat > 2:967704/1‑139 (MQ=255) tCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCATGTGTTTATGCCGGAGGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTGAGTGAATGAAAGAATGATGTAGAcc > 1:558607/1‑143 (MQ=37) tGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGa < 2:89877/143‑1 (MQ=255) gAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTCGACCTGATACa > 1:807085/1‑143 (MQ=255) aGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACAt > 1:624696/1‑143 (MQ=255) tAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAACTGATGTAGACCTGATACATAg > 1:48080/1‑143 (MQ=255) aGCAATCGGCTTTTTATGTCGCTGGTTGCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGc < 2:222430/143‑1 (MQ=255) aGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGc < 2:38711/143‑1 (MQ=255) aTCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCacaa > 1:548065/1‑143 (MQ=255) gCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTCACGCCTTGCCCGGGCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAgg < 1:158497/143‑1 (MQ=255) gCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAgg < 2:866279/143‑1 (MQ=255) cTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAACGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGc > 2:697626/1‑143 (MQ=255) ttATGACGCTAGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTTCAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTAtt > 1:933923/1‑143 (MQ=255) tGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTg > 1:861620/1‑143 (MQ=255) tGACGCTGGGTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTg < 2:424062/143‑1 (MQ=255) aCGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTCAAAATGGATGTAGACTTGAAACATAGCACAACAGGCTATTTTGCg > 1:417838/1‑143 (MQ=37) cggtGGTGTCAGAGTGGTGACAAGGTGCCTGTGTTTATGCCGTATGCGGCGTTAACGCGTTATCCGGCCTAGAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGt < 2:818021/140‑1 (MQ=255) gCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGGTGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGtt > 1:230965/1‑143 (MQ=255) tttCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCa > 2:826504/1‑143 (MQ=255) ttCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCAt < 2:155910/143‑1 (MQ=255) aGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGCATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAg > 2:700080/1‑143 (MQ=255) gATGGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATACGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGt < 2:77782/143‑1 (MQ=255) aTTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGGGGCGGGAACTCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGtc > 1:267898/1‑143 (MQ=255) aTTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACGTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGtc > 1:767243/1‑143 (MQ=255) tGACAAAGTCCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCGGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCaaa < 1:715083/143‑1 (MQ=255) aCAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAAcc > 2:1028113/1‑143 (MQ=255) aCAAAGGGCCTGTGTGTAAGCCGGATGCGGCGATAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAAcc < 1:324146/143‑1 (MQ=255) cAAAGGGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCg < 2:926454/143‑1 (MQ=255) aaGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCgcc > 1:915570/1‑141 (MQ=255) tttgtaggCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATag > 2:882432/8‑143 (MQ=38) tttATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCCTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAACATGCTGTAGACCTGATACATAGCACAACCGGCTATCTTGCGTTTAGCATCAGTCTCCAACCGGATCCCGAtcacc > 2:825720/1‑139 (MQ=37) ttATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTAAAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGc < 1:94812/143‑1 (MQ=255) aTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCg > 2:316048/1‑143 (MQ=255) tgtcGGATGCGGCGTTAGCGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTCCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCgg < 2:402010/140‑1 (MQ=255) gCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggt > 2:645709/1‑143 (MQ=255) gCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggt > 2:893697/1‑143 (MQ=255) ccGGGTGCGGCGTTAACGCCGTAGCCGGCCTACAAACGCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCTATCTGGAGCCggtt < 2:896394/143‑1 (MQ=255) ccGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAAAACTGATACATAGAACAAAAGGCTATTTTGCGTTTAGCATGAGTCTCACACCGGCGGCAGATATAGCCggtg > 1:32380/1‑142 (MQ=255) ggATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGACTAAAGATAGAACCggattt > 1:943883/1‑143 (MQ=39) ggAGGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggtttt < 1:612902/143‑1 (MQ=255) gATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttg < 1:689494/143‑1 (MQ=255) gATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttg < 1:677345/143‑1 (MQ=255) gATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCCACAGGTAGAGCCggccgtg > 2:530033/1‑138 (MQ=255) gcggcgTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCCTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttggtt < 1:1091141/143‑1 (MQ=255) ggcgTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCACTGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttggtttt < 1:967704/143‑1 (MQ=255) gcgTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGCGCCGGTTTTGGTTTTc > 1:788405/1‑143 (MQ=255) ccgTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTc < 1:97911/142‑1 (MQ=255) gTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGCGTCCAGATAGAGCCGGTTTTTGTTTtgtg > 2:572694/1‑143 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTaa > 1:1059216/1‑143 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGATCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTaa > 1:1065987/1‑143 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAATCTAGTTTGCGTCTCGCATCGTTGTCAAGCCGGCTCCCGATAGAGCCGGACTGGGTTTTCTGTcgtca > 1:308921/1‑139 (MQ=255) cTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTGCTGTGttcaag > 1:814344/1‑139 (MQ=255) | GAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGC‑AAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACG > NC_000913/2917769‑2918050 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |