| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,959,926 | A→T | 5.5% | intergenic (‑113/+86) | ppiC ← / ← yifN | peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C/putative toxin YifN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,959,926 | 0 | A | T | 5.5% | 224.4 / 2.7 | 86 | intergenic (‑113/+86) | ppiC/yifN | peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C/putative toxin YifN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/46); new base T (2/3); total (37/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.09e-01 | |||||||||||
GATATGCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTATGTCT > NC_000913/3959784‑3960066 | gATATGCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGCGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGaaaa > 2:1113314/1‑143 (MQ=255) gCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGGGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGAGGCTGGTACCTATATGGCCAAAGCCCGGAACAGCCgg > 2:436438/1‑143 (MQ=255) gTGCTGCCGCTGTTTGTGCCCTGATCGTGCCTGGAGTAAAGGATTGTCACGCGGCGATTTTAGCATGACCCCCTCATTTTAACGTAATTGTCAGTCCTGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGATTTTCCGGGCt < 1:159494/143‑1 (MQ=255) tgctgctgcTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCtt > 2:938350/1‑143 (MQ=255) gctgctgctGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGAGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGATTTTCCGGGCttt < 1:684250/143‑2 (MQ=255) tgctgctgTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGc < 1:715686/143‑1 (MQ=255) gctgctgTTTGTGCCAGGATCGTGCCGGGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTGAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCa < 1:384072/143‑1 (MQ=255) ctgcttTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAg < 1:354257/143‑1 (MQ=255) ctgctgTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAg < 2:330900/143‑1 (MQ=255) tgctgTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGATTGTTTAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGGTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAgg < 1:274172/143‑1 (MQ=255) tgctgTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTACGCAgg > 2:196946/1‑143 (MQ=255) tttttGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCCTGATCCGCAGATGATAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATCGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCGTCGCAAGTccgt > 2:656565/1‑141 (MQ=255) gggcATGGTCGGGCCTTGTGTGAATAATTGGCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATAGATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAg < 2:1077345/140‑1 (MQ=255) ccATGATCGTGCTTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAggg < 2:995397/143‑1 (MQ=255) ccATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATCGCACAAGCCCGGAAACTCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAgcg > 2:877834/1‑141 (MQ=255) cATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGGACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAgggg > 2:13250/1‑143 (MQ=255) aTGATCGTGCCTTGAGTGAATTATTGTTATGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGga < 1:664850/143‑1 (MQ=255) tGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGGTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGGGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCAGGGGTACGCAGGTCCCTCAAggggga > 2:569851/1‑141 (MQ=255) tGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGGGTGGCTGGTACATATAGGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGCCCCACAAggggtg > 2:970041/1‑141 (MQ=255) ggctCGTTCCTTCGGTGAAGCATTGTCAGGCGGCTATTGTCGCATGATCCGCAGATGCTAACGCAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGTTACATATATGTCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGgag < 2:1072490/140‑1 (MQ=255) tgcGTGCCTTGAGTGAATAATCGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCAGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGaa < 2:702339/141‑1 (MQ=255) aTCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGaa < 1:1044679/143‑1 (MQ=255) cGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGaaaa < 2:603344/143‑1 (MQ=255) cGTGCCTTGAGTGAATAATTGCCGGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGaaaa < 2:820044/143‑1 (MQ=255) cTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGGGAAAACTTAg > 1:300740/1‑143 (MQ=255) gTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTCAGGGcat > 2:1028354/1‑141 (MQ=255) ataatTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTAt < 1:512053/143‑1 (MQ=255) atTGTCAGGCGGCGATTTGAGCATGATCCGCAGATGCTAACGAAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATggg < 1:669807/143‑1 (MQ=255) ggtgcgAGTTCAGCATGAGCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGGCAGGGAGTTGCTGGTACATATATGGAAAAAGCCCGGAACATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGTGCTACAAAg < 2:1093284/140‑1 (MQ=255) gcggcgATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGCGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTGTGGGCTACAAAg > 1:849489/1‑143 (MQ=255) gcggcgATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACGAAg > 1:246934/1‑143 (MQ=255) gcggcgATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAg > 2:944864/1‑143 (MQ=255) cggcgATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGt > 2:1038074/1‑143 (MQ=255) cggcgATTTTAGCATGATCCGCAGATGATAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGAACATATATGGAAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGGGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCGACAAAgg > 2:561618/1‑142 (MQ=255) gATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCAGTAAGAACTACAAAGTCAtc > 1:872659/1‑142 (MQ=255) tttAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATc > 1:362345/1‑143 (MQ=255) gcgaggttCCGCAGAGGCTAGTGTAATGGTCAGGCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGTAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCggg < 2:146451/136‑1 (MQ=255) cgtGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCGGGGAGGGGCTGGTAGATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGa < 2:510015/141‑1 (MQ=255) cATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGa > 2:1069477/1‑143 (MQ=255) aTGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGAt < 2:360224/143‑1 (MQ=255) tGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATg > 1:865840/1‑143 (MQ=255) ggATCCGCAGATGCTACCGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAACGCCCGGAAAATCCGGGCTGCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATg < 1:852921/142‑1 (MQ=255) gtCCGCAGCTGCGAACGTACTCGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACTTATACGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCGTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGt < 1:606381/142‑1 (MQ=255) gcccGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGt < 2:316488/141‑1 (MQ=255) aTCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTGCAGAGTGGTTATCGGGggtggt > 1:177400/1‑143 (MQ=255) aTCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGt > 1:77829/1‑143 (MQ=255) tagagtcTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGTTGGTACATATATGCCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACGTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGttattt < 2:945926/137‑1 (MQ=255) gCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCGCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCATCTATGGGCTACAAAGTCATTAGCGGGGATGGTTATTTTATTg > 2:608180/1‑143 (MQ=255) tAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCGGGGCTTCGCAGGTCCCTCAACGGGAGAAAAATTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGACACCATCGGGGGTGGTTATTTTAATgga > 2:732579/1‑141 (MQ=255) aaCGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCGTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGCCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCa > 2:944463/1‑143 (MQ=255) gTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAATCCTTAGCGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAAtt > 1:946869/1‑143 (MQ=255) tAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAAttt < 2:66409/143‑1 (MQ=255) tAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTGCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAAttt > 2:769246/1‑143 (MQ=255) aagtGTCAGGCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGGCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTa < 1:481884/140‑1 (MQ=255) aTTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTAt > 1:884373/1‑143 (MQ=255) ttGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCACGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGGGCCTGGAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCCACAAAGTCACTATGGGGGATGGTGAATCGATTGTCAAtcactg > 2:742432/1‑138 (MQ=255) tGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGCCAATTTATGa < 1:576707/143‑1 (MQ=255) tcagGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGata < 1:62026/143‑1 (MQ=255) cagGGAGTGGCTGGTACATGTATGGCAAAAGCCCGGAAGATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAGCTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAACTTATGACCGatat < 2:251876/143‑1 (MQ=255) ggAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGc > 1:809334/1‑143 (MQ=255) aGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAGCACTGATGGCCTACACAGGCTGCAAGGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCat < 1:828905/143‑1 (MQ=255) gtgggtggTACATATATGGGAAAGGCCCGGAAATTCCGGCGTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACATAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCatt < 1:1091644/143‑1 (MQ=255) ggggCTGGCACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCatt < 1:1011129/141‑1 (MQ=255) gTGGTTGGTGAATATAGGGCAAAAGCCAGGAAAAGCCGGGCTCCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCatt < 1:84722/143‑1 (MQ=255) ggCTGGTACATGTTGGGCAAAAGCCCGGAACATCCGGGCCTCGTGGGTCCCTCACGGGGAGATCACTTAGGGCTTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGTTTGATTTTGTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCattga < 2:683248/143‑1 (MQ=255) gCTGGTACATATATGGCAAAAGTCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGCTGGTGATTTTATTGTCAATTTATGAGCGCTACGGCattgat > 2:139507/1‑143 (MQ=255) gCTGGTACATAGATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCattgat < 2:892892/143‑1 (MQ=255) tGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGCTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCattgttgt > 1:746134/1‑139 (MQ=255) ggTACATATATGGCAACAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCAttgattga < 1:650162/143‑1 (MQ=255) ggTACATATATGGCAAAAGCCGGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCAttgattga < 1:551970/143‑1 (MQ=255) ggTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATAGGGGATGGTTATTTTATTGTCCATTTATGAGCCATCAGGCAatgattga > 2:779203/1‑143 (MQ=255) ggTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAAGCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCAttgattga < 1:761682/143‑1 (MQ=255) gTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGAc < 1:1069477/143‑1 (MQ=255) tACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAAGCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACt < 1:944864/143‑1 (MQ=255) aCATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGTGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACtt < 1:940706/143‑1 (MQ=255) cATATAGGGCGAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTtg < 2:31459/143‑1 (MQ=255) atatatGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTtga < 2:300740/143‑1 (MQ=255) tatGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGCCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTCATTGTCAATTTATGAGCGCTGTGGCATTGGTTGCCTtggtgt > 1:182645/1‑142 (MQ=255) atGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTAGCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGAc < 1:676831/143‑1 (MQ=255) tGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGAcc > 2:1111614/1‑143 (MQ=255) ggCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCg < 1:1113314/143‑1 (MQ=255) tgcgaaGCCCGGATTTTCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGCCATCATCGGGGAAGGATATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCCGTGATTGACTTGCTGACCga > 2:862465/5‑142 (MQ=255) gagcaggCCCGGAACATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTGAAGGGGAGAAAACTTAGGGCTTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTCATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCCTCCCTTGACTTGATGACCGc < 2:623409/137‑1 (MQ=255) cAAAGGCCCGGAAAATCCGGGCGTCGCAGGTCCCGCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGcc < 1:877834/143‑1 (MQ=255) cAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTGTATTGTCAATTTATGGGCGATATGGCATTGATTGGCTTGATGACCGcc > 1:219761/1‑143 (MQ=255) aGCCCGGATTTTCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAGCTTAGGGGCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATGGGGGATGGTTATTTTATTGTGAAGTTAGGAGCGATATGGCATGCATTGACTTGATGAATGCCctct > 2:1022664/1‑143 (MQ=255) aGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCctct < 1:675257/143‑1 (MQ=255) aaaTCCGGGCCTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTATGTCt < 1:113288/143‑1 (MQ=255) | GATATGCAGTGCTGCTGCTGTTTTTGCCATGATCGTGCCTTGAGTGAATAATTGTCAGGCGGCGATTTTAGCATGATCCGCAGATGCTAACGTAATTGTCAGTCAGGGAGTGGCTGGTACATATATGGCAAAAGCCCGGAAAATCCGGGCTTCGCAGGTCCCTCAAGGGGAGAAAACTTAGGGCCTCTATGGGCTACAAAGTCATTATCGGGGATGGTTATTTTATTGTCAATTTATGAGCGATATGGCATTGATTGACTTGATGACCGCCCTCTGTATGTCT > NC_000913/3959784‑3960066 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |