Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,286,116 | C→G | 7.0% | G419A (GGC→GCC) | acs ← | acetyl‑CoA synthetase (AMP‑forming) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,286,116 | 0 | C | G | 7.0% | 142.4 / 2.7 | 50 | G419A (GGC→GCC) | acs | acetyl‑CoA synthetase (AMP‑forming) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (22/24); new base G (2/2); total (24/26) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 |
AGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGAT > NC_000913/4285981‑4286258 | aGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGCTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGCACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCCGCGGGGTGCCCACGGAACCGCCGGGTTc > 2:638460/1‑143 (MQ=255) aGGCTACCTTCGGTGGCACCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAAAACGAACGTGTTGCCGAACCGGCTTTAAGCTAGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTc > 1:999203/1‑143 (MQ=255) gccTACCTTCGGTGGCCCCCTCCCGTGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCg < 2:387921/141‑1 (MQ=255) gCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGGGTTCCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGCGGTCATGAAACCGCCgggggcgg > 2:881165/1‑137 (MQ=255) cTAGCTTCGGGGGCGCCCTCCAGCGGGTTACCTGCGTTGTCGACCAGCGCCGGATGCACGCCGAAGATCGGTTTTGTCGCCTAACCTGCTTTCAGCTCGTTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAATCGCCGGTTTCGGt < 2:610914/143‑1 (MQ=255) tCGGTGGCCCCCTCCGGCGGGTTAGCTTCGTTATCGCCCAGCTCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGcca < 2:1065836/143‑1 (MQ=255) gggtcccTCCAGCGGGTCACCTTCGTTATCGGCCAGCGCCGGTGGCGCGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAgg < 1:891694/139‑1 (MQ=255) ccccTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGAGCATGAAACCGCCGGGTTCGGTCTGCCACCAgcaat > 1:873306/1‑139 (MQ=255) cccTCCAGCGGGTGACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATc < 2:750104/143‑1 (MQ=255) gCGGGGTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGaccacc < 1:753111/143‑1 (MQ=255) gTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGAc > 1:716987/1‑143 (MQ=255) gtagcTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGGAGACAGGCGGAGGGTTCCCCGAACCGGCTTTCAGCGCGGTAGCGCCATGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACa < 2:797137/139‑1 (MQ=255) cTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGACCCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGGGGGCATGAAACCGCCCGTTTCCCTCCGCCACCAGGAACCGACCACCgggcgtcgc > 2:880985/1‑136 (MQ=255) tCGTTATCCACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTtctc < 1:457572/143‑1 (MQ=255) ctcagtcAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGACCGGACGGGTTGCCGAACCGGCGTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGc < 2:1031314/137‑1 (MQ=255) gACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCGCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGCAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGCCACGACCACCGGAGATTCGTCGTGGCCGa > 2:478511/1‑143 (MQ=255) cAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGAttt > 1:984561/1‑143 (MQ=255) ccGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTCCTCGTAGCCGCTTGTTTTc > 2:261331/1‑143 (MQ=255) ccGGCTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTc < 1:707936/143‑1 (MQ=255) acGGTTGCGCGCCGAAGAACGGACGTGTGGCCGAACCGGCTGTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTc < 2:213290/142‑1 (MQ=255) ggTGGCACGCGGAAGAGCGGACGGGTTGCCGAACGGGCTTTCAGCTGGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGGTCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCa < 2:879339/143‑1 (MQ=255) gCACGCCGAAGAACGGACGGGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTAc < 1:1003884/143‑1 (MQ=255) cACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTAcc > 1:412849/1‑143 (MQ=255) cACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTCTCGGTCTGCCACCAGGGATCGACCACCGGACAGTTCTCGCTGCCGGTGGTTTTCCAGTGcc > 2:293408/1‑143 (MQ=255) cGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGCTTTTTTTCCAGTACCACTcc > 1:359017/1‑143 (MQ=255) aagaaCGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTGCAGCGCGATAGCGCCGGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCa < 1:490045/143‑1 (MQ=255) gaaCGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTCGCCGATATTTTTCCAGTACCACTcacccg > 2:1071429/1‑138 (MQ=255) gACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTcc < 1:725993/143‑1 (MQ=255) aCGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGTTTCCg > 1:643142/1‑143 (MQ=255) tgtTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACCTTTCTCGTTGCCGATCTTTTTCCAATCCTACTCCCAAGCTTCCGGGt > 1:700267/1‑143 (MQ=255) ttGCCGCAGCGGCTTCCAGCGCGGTAGCGCCGGGCAGCGGGGTGATCATGACACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCTGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTa < 2:360622/143‑1 (MQ=255) gCCGAAGCGGCGTTCGGCTCGGTAGCGCCAGGCAGGTGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGCTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAAt < 2:851147/143‑1 (MQ=255) gCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGACACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCGGGTATCGACCACCGGACCTTTCTCGCTGGCGCTTTTTTGCCAGGACCGCCCCCGCGCTCCCgggctcgc > 2:976036/1‑138 (MQ=255) gCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAAt < 1:741907/143‑1 (MQ=255) gCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCACGTATCGACCACCGGACATTTCTCGATCCCGATGTCTTTCCACCAACGCCCCCACCCTACCGGGGTagt > 2:373127/1‑141 (MQ=255) aCCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCt > 1:291173/1‑143 (MQ=255) ccGGCTTTCAGCGCGGTTGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCACGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTc < 1:1120653/143‑1 (MQ=255) tttCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGCTAATTGGCCCGgccc > 1:951175/1‑142 (MQ=255) aGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTACTTGGCTCGCCCCCGGa > 1:1036631/1‑143 (MQ=255) gTAGCGCCAGGCGGCGGGGTGATCGTGAGACCGGCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTGCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACGCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCgag < 2:221632/143‑1 (MQ=255) tgcgcCTGGCAGCGGGCTGGTCATGAAAGCGCCGGTTTCGGTCGGCGACCAGGTGTCGACCACCGGACATTGCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGaa < 2:294710/142‑1 (MQ=255) ggcgcCAGGCGGCGCGGTGAGCATGCGGCCTCCGGTTTCGGTGTGCCACCAGGTATCGCCCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCCCGCCCACGGAACCGAGaa < 2:364434/142‑1 (MQ=255) aGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGaa < 1:1044686/143‑1 (MQ=255) cAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCCCGGAACCGAGAATgcgc > 1:709285/1‑143 (MQ=255) aGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCa < 1:526455/143‑1 (MQ=255) ggggTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGcgacga > 1:933432/1‑143 (MQ=255) gaccgAAACCGGCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAGTTGGCTCGCCCCCGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAAcggtcg > 1:666683/5‑143 (MQ=255) ccgAAACCGGCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGc < 1:608283/100‑1 (MQ=255) ccgAAACCGGCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGc > 2:608283/3‑102 (MQ=255) gAACCCGCCGGTTTCGCTCCGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGc < 1:446984/143‑1 (MQ=255) cctccgGTTTCCGTCTGCCACCAGCTATCGCCCCCGAGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTc < 2:999203/140‑1 (MQ=255) cgccgGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGACTGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCg > 1:550512/1‑143 (MQ=255) gccgGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAAACGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGa > 1:601135/1‑143 (MQ=255) ccgGTTTCGGTTTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTGGCCGATTTTTTTACAGTACCACTCCCGCGCTCGCGGGGTGGTTGGCTGGCCGCCGGTACCGCGGATGCGCGGGGGCGCACGGCGGCGGCCTTCggg > 2:814035/1‑141 (MQ=255) ccgGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGCTCTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTACCCGGTTCATTGGCTCCCCCCCGCTACCGCCAATGCCCAGCCACGACCGCTCCGCGCCTCCgcc > 2:1022778/1‑141 (MQ=255) ccgGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGCGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCgcc > 1:141105/1‑141 (MQ=255) | AGGCTACCTTCGGTGGCCCCCTCCAGCGGGTTACCTTCGTTATCGACCAGCGCCGGTTGCACGCCGAAGAACGGACGTGTTGCCGAACCGGCTTTCAGCTCGGTAGCGCCAGGCAGCGGGGTGATCATGAAACCGCCGGTTTCGGTCTGCCACCAGGTATCGACCACCGGACATTTCTCGTTGCCGATTTTTTTCCAGTACCACTCCCACGCTTCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGAT > NC_000913/4285981‑4286258 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |