| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 94 (1.190) | 74/274 | 0.0 | 99.5% | intergenic (+253/‑33) | ychE/insH21 | putative inner membrane protein/IS5 transposase and trans‑activator |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 1 (0.010) | intergenic (+151/‑484) | insH21/oppA | IS5 transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGT > NC_000913/1300556‑1300840 | aattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa < 1:567558‑M2/1‑1 (MQ=255) acagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataattctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataat < 1:8707‑M2/5‑1 (MQ=255) cGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCACCGCTTATTCGCACCTTCCCTAaataaat > 2:123902/1‑141 (MQ=14) agttagttataaggatttccttaactgctgctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgccgaagaataatttaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 1:56341‑M2/7‑1 (MQ=255) ttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAtt < 2:954374‑M2/13‑1 (MQ=255) ttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAtt > 2:504206‑M2/131‑143 (MQ=255) ttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggctcgctgcagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAtt < 2:798129‑M2/13‑1 (MQ=255) tataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTg < 1:426326‑M2/14‑1 (MQ=255) ggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa < 1:401875‑M2/19‑1 (MQ=255) tttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta < 1:1258080‑M2/22‑1 (MQ=255) tttccctaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta < 1:580067‑M2/22‑1 (MQ=255) tccttaactgcttctcctaaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgtctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 2:104614‑M2/24‑1 (MQ=255) ttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctagATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg > 1:480400‑M2/117‑143 (MQ=255) ttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg < 1:751453‑M2/27‑1 (MQ=255) ttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAAATATtgtg > 2:1379161‑M2/117‑143 (MQ=255) taactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGc > 1:1047810‑M2/116‑143 (MQ=255) actgcttctcctccccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAt < 1:1376198‑M2/30‑1 (MQ=255) actgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctacATAATAATCGATTGTTAAATTATTGTGCAt < 1:802833‑M2/30‑1 (MQ=255) actgcttctcctcaccatcatgttattctcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataatttaattgatatcattaactccgctgccgttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAt < 1:750995‑M2/30‑1 (MQ=255) tgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt < 1:788652‑M2/32‑1 (MQ=255) gcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc < 2:1064770‑M2/33‑1 (MQ=255) cctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 1:1295593‑M2/39‑1 (MQ=255) cctcaccatcatgtcattttcgacacatcatcatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 1:471837‑M2/39‑1 (MQ=255) ccccaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaAT‑ATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg < 1:812431‑M2/39‑1 (MQ=255) ctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagcacaaatgtctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 1:673823‑M2/104‑143 (MQ=255) ctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTACTTTATTGTGCATTTCATTACTg > 1:717273‑M2/104‑143 (MQ=255) tcaccatcattttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTgg < 2:570016‑M2/41‑1 (MQ=255) tcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCGCTACTgg > 1:844391‑M2/103‑143 (MQ=255) caccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattacttccactgcctttattagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGa > 2:1272288‑M2/102‑143 (MQ=255) tccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa < 1:595688‑M2/43‑1 (MQ=255) accatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa < 1:504206‑M2/43‑1 (MQ=255) cctcctgttacttccgccacatcatcatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgcgaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt < 1:1401744‑M2/45‑1 (MQ=255) catcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt < 1:423490‑M2/45‑1 (MQ=255) atcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg < 1:210980‑M2/46‑1 (MQ=255) atgttattttcgccacatcatgatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTaa < 1:1428259‑M2/49‑1 (MQ=255) atgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTaa > 1:1370978‑M2/95‑143 (MQ=255) tgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgcaaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt < 1:631248‑M2/50‑1 (MQ=255) gttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattctactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATAGTTAAATTATTGTGCATTTAACAACTGAAACTGTAATc > 2:72405‑M2/93‑143 (MQ=255) gttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATc < 2:1018860‑M2/51‑1 (MQ=255) gttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATc > 2:1241277‑M2/93‑143 (MQ=255) gttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATc > 2:156912‑M2/93‑143 (MQ=255) ttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaCTAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCTTTTCACTACTGGCACTGTAATCa > 1:68746‑M2/92‑143 (MQ=255) tattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAg > 1:124530‑M2/91‑143 (MQ=255) attttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaacgtgctaaATAATAATCAACTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTGCTGGAACTGTAATCAGa > 1:427398‑M2/90‑143 (MQ=255) attttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGa > 1:753453‑M2/90‑143 (MQ=255) tttcgctacatcataatcctgggcttgctgaagaataatttaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGaaa < 1:695899‑M2/56‑1 (MQ=255) tttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtcagggtaagggctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGaaa > 1:749968‑M2/88‑143 (MQ=255) ttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGaaaa < 1:403574‑M2/57‑1 (MQ=255) ttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGaaaa < 1:437278‑M2/57‑1 (MQ=255) gacatcataatcctgggcttgctgaaggataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAg < 2:288165‑M2/62‑1 (MQ=255) cacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACGGGAACTGTAATCAGAAAAGATAg < 1:655119‑M2/62‑1 (MQ=255) cataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATg < 1:897223‑M2/67‑1 (MQ=255) gaatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCt < 2:213625‑M2/69‑1 (MQ=255) cctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGc > 1:1014621‑M2/71‑143 (MQ=255) ctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGcc > 2:475863‑M2/70‑143 (MQ=255) gcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAAtc > 2:842752‑M2/66‑143 (MQ=255) ttgctgaagaacaacagaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAAtctc < 1:907832‑M2/80‑1 (MQ=255) ctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTAt < 2:445965‑M2/83‑1 (MQ=255) cggaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTAt < 1:472986‑M2/83‑1 (MQ=255) aataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATttgatt < 2:1245740‑M2/89‑1 (MQ=255) taattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTAtttgattgc > 2:292975‑M2/53‑142 (MQ=255) attgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATATCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGattga‑at > 1:734342‑M2/51‑143 (MQ=255) tgaaatgatattattaattctactgcctttggaagaggaaagtgctaaATAGTAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGattga‑attg > 2:767476‑M2/49‑143 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGAttga‑attgaa > 2:53153‑M2/47‑143 (MQ=255) aatgatattattaattacactgcctttgggagaggaaaatgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGaaa < 2:204076‑M2/98‑1 (MQ=255) atgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAg > 1:961064‑M2/45‑143 (MQ=255) tgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGa > 1:1021326‑M2/44‑143 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGAtgttt < 1:146130‑M2/105‑1 (MQ=255) ttattaagtgcactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTGCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGAtgttt < 2:147016‑M2/105‑1 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGCGCATTTCACTACTGGAACTCTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGAtgtttgtt > 1:738659‑M2/36‑143 (MQ=255) attccactgcctttgttagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGGATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAg < 2:461318‑M2/111‑1 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACGGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCACTATTCGATTGA‑ATTGAAAAATGTTTGTTAAg > 2:231000‑M2/33‑143 (MQ=255) cagtgcgtttggtagaggaaagtgctaaATAAGAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCAt < 2:405299‑M2/115‑1 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCAt < 2:673823‑M2/115‑1 (MQ=255) actgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATg > 2:882921‑M2/28‑143 (MQ=255) ctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGCACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGCCCTgg > 1:885102‑M2/27‑143 (MQ=255) ttgtgtggtagaggaacgtgctaaATAATAGTGAATTTTTAAATTATTTTGCATTTCACTACTGGAAGTGTAATCAGAAAACATAGACATGATTAGCTAATCTTTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGAt < 2:1228375‑M2/119‑1 (MQ=255) gcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGAt < 1:201214‑M2/119‑1 (MQ=255) gcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGAt < 1:475863‑M2/119‑1 (MQ=255) tttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCa > 1:259440‑M2/22‑143 (MQ=255) ttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATCTGATTGA‑ATTGAAAGATGCTTGTTAAGGAATGCATGCaa > 1:1210490‑M2/21‑143 (MQ=255) ttgggagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCaa < 2:70506‑M2/123‑1 (MQ=255) ggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGCCATGGATGCAAGc > 2:1320824‑M2/19‑143 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGAAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCACT‑CCTAATTGATAATGAAAGATGTTTGTTACGGAATGGATGCAAGCta > 2:1422176‑M2/17‑143 (MQ=255) aggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTAAGATAAGGCATTAATGCAAGCTATAg > 2:638185‑M2/14‑143 (MQ=255) ggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGa < 1:636082‑M2/131‑1 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGAt > 1:1056555‑M2/12‑143 (MQ=255) aagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTc < 1:293084‑M2/134‑1 (MQ=255) agtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATCGATTCt > 2:1441851‑M2/9‑143 (MQ=255) gtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTg < 2:68746‑M2/136‑1 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGCTTCTGa > 2:563707‑M2/7‑143 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGa < 2:1014621‑M2/137‑1 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTAGTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATATTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGa < 2:785800‑M2/137‑1 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGACAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATa > 2:728179‑M2/5‑143 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATACAAGCTATAGATTCTGATa < 1:223043‑M2/139‑1 (MQ=255) aaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTg < 1:1329480‑M2/136‑1 (MQ=255) aaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTg > 2:1329480‑M2/3‑138 (MQ=255) aaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACg < 1:1240183‑M2/141‑1 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGCTACgg > 1:546422‑M2/2‑143 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGt < 1:76762/143‑1 (MQ=255) | GATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGA‑ATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGT > NC_000913/1300556‑1300840 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |