| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,661,821 | C→G | C104S (TGC→TCC) | iscR ← | DNA‑binding transcriptional dual regulator IscR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,661,821 | 0 | C | G | 98.7% | 228.0 / NA | 74 | C104S (TGC→TCC) | iscR | DNA‑binding transcriptional dual regulator IscR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (34/39); minor base T (0/1); total (34/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
GGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGCATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCATCTTTGCCTAACAGATAACCACCGCCTGGTCCACGTAC > NC_000913/2661681‑2661960 | gggTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGAt < 2:1373603/143‑1 (MQ=255) gTGGCGCGTCGTGCGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATcg < 2:841021/143‑1 (MQ=255) cgcgTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATcgccgc > 2:828170/1‑143 (MQ=255) cgtGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTgg < 2:399338/143‑1 (MQ=255) cgtGAGGATGCTGACGACAAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGAGTCAGGGATTTATCGGCGCCCTgg < 2:1051252/143‑1 (MQ=255) cgcgactATGCTCACCACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTgg < 1:871985/137‑1 (MQ=255) tGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGCTGTATCGCCGCCCTGGCa > 1:713560/1‑143 (MQ=255) tGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCa > 1:1399593/1‑143 (MQ=255) caaGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCCTTGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCa < 1:899741/141‑1 (MQ=255) aGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTACAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAgc < 1:143602/143‑1 (MQ=255) aTGCTCACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAACCCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAgccgc < 1:629551/143‑1 (MQ=255) tGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAACCCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGAGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTAGCAgccgcc > 2:786231/1‑143 (MQ=255) tGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTAGTCTGACA‑CACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGCCAgccgcc > 1:674341/1‑143 (MQ=255) gacCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTAccc > 1:760980/1‑143 (MQ=255) gacCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATAAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAGAACCGGGGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGCGGGTCCGGGATGTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCCTTGccc > 2:542845/1‑143 (MQ=255) ccAGACCCATCCCGCACTTCCGGGTTATCACCCAGCTCGCCTAAAGTAATGGTGGTGAGAAAACCGGTAAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCGGCCGCCTTTACCCTg < 1:248359/143‑1 (MQ=255) aGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCCGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGAc > 1:395217/1‑143 (MQ=255) aGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGAc > 1:788870/1‑143 (MQ=255) gACACATCCAGCACTTCCTGGCTATTAACCCGTTCGCCTAAACTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACa < 2:29633/143‑1 (MQ=255) caTCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACgg < 1:779689/143‑1 (MQ=255) aTCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACggg < 1:1267491/143‑1 (MQ=255) aTCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACggg > 2:709445/1‑143 (MQ=255) tCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGt > 2:736555/1‑143 (MQ=255) tCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGt > 1:1414817/1‑143 (MQ=255) ttgcTGGTTATTTACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTa < 2:1292218/140‑1 (MQ=255) ttCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTGCCGTGAAAACGGGTGGCaacac > 2:355169/1‑139 (MQ=255) ttCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTCCCCTGACACGGGGCGGCATCTa > 2:18412/1‑143 (MQ=255) ttCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTa > 1:434387/1‑143 (MQ=255) ttCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGACACCGACTTACGGCCTCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGTGTGGCATCTa < 1:1464256/143‑1 (MQ=255) ccTGTTTACTAAGCAGTTCGACTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGGCG‑CTCCAATCCCAGCTCATCGTTTGGTTCAGGTAGTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACa < 1:840753/143‑1 (MQ=255) ggtattaACCAGTTCGCCTGAAGGAATGTCGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGAtt < 1:321853/141‑1 (MQ=255) ttattaACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTc < 1:1279029/143‑1 (MQ=255) ttattaACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTc < 2:1158778/143‑1 (MQ=255) ttattaACCAGTACGCCTAAAGTAATGTTGTTGAAAAAACCGGGGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTc < 1:1141516/143‑1 (MQ=255) attaACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGt < 2:788870/143‑1 (MQ=255) ttaACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTc > 1:983837/1‑143 (MQ=255) taACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCAAACGCTCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGAGAACAGGTGACATCTACAGAtttgaca > 1:206718/1‑138 (MQ=255) aCCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACACCGGGAGGCATCTACAGACTCGTCAAc > 2:528746/1‑143 (MQ=255) ccAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCCTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGCCAGCCGCCTTTACCCTGACACCGCGTGGCCTCTCCCGCTCCGTCAAcc > 2:1312569/1‑142 (MQ=255) gCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTaa > 2:877173/1‑143 (MQ=255) gCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGAGGCATCCACAGATTCGTCAACGGCGCTaa > 2:187672/1‑143 (MQ=255) cTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTCTCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACCGCTTCGCCCACGGCGCTAAtt > 2:437527/1‑143 (MQ=255) aaaGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTAc < 2:434387/143‑1 (MQ=255) aaaGTAATGTAGTTGAGAAAGCCGGCGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTAc < 1:195934/143‑1 (MQ=255) aGTCATGTTGTTTAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACtt < 2:937496/143‑1 (MQ=255) gTAAGGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTc < 1:1425081/143‑1 (MQ=255) aTGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGcc < 1:514749/143‑1 (MQ=255) gttgttGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTCATTACTCCACCaa > 1:192280/1‑143 (MQ=255) gttgAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACgg > 1:1111455/1‑143 (MQ=255) ttgAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGc > 2:667546/1‑143 (MQ=255) tgAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCg < 2:669556/143‑1 (MQ=255) gagaAAACCGGGGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGTGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGa < 1:269656/143‑1 (MQ=255) gaAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGAtg < 1:887229/143‑1 (MQ=255) acaCCGGTGAGGCGGTCG‑CTCAAATCACGCCGCAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGAtgct < 2:38702/141‑1 (MQ=255) ccGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGATgctgct < 1:383280/143‑1 (MQ=255) gTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGc > 2:1087052/1‑143 (MQ=255) tGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCACCGACGATGCCGCTGGCa > 2:319306/1‑143 (MQ=255) cgagaCGGTCG‑CTCAAATCCCGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCa < 1:888242/142‑1 (MQ=255) cG‑CTCAAATCACGCCACGGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGTGATGCTGCTGGCATCTTTGCCt < 1:1418797/143‑1 (MQ=255) cTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCATCTTTGCCTaa < 1:930878/143‑1 (MQ=255) cTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGCGGCATCTACAGATTCGTCCACGGCGCTAAGTACTTCGCCAGCGGCGATCCTCCTGGCCTCCTCGCCTaa > 2:1035487/1‑143 (MQ=255) aTCACGCCACAGCGCGTGGGTCATGGATTTATCTCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCATCTTTGCCTAACAGAt < 1:570474/143‑1 (MQ=255) tCAGGCCGCAGCGCGTGGGTCAGGGAGTTAGCGCCGCCCTGGCAGCCGCCGTTAGCCGGACGAGGGGTCGCATCTACAGGTTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCATCTTTGCCTAACAGATa < 2:172843/143‑1 (MQ=255) aCGCCACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCATCTTTGCCTAACAGATAac < 2:1414817/143‑1 (MQ=255) ccACAGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACCGCTTCGTCAACGGCGCTCATTCCTGCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCATCTTTGCCTAACAGATAacccc > 2:1273012/1‑141 (MQ=255) cacaGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCATCTTTGCCTAACAGATAaccacc > 1:1149288/1‑143 (MQ=255) gaGCGCGTGGGTCAGGGATGTGTCGCCGCCGTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATGTACGGATTCGTCAACGGCGCTAATGACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCATCTTTGCCTAACAGATAACCACCGc < 2:674341/142‑1 (MQ=255) ccgcggttGGGTCGGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCGTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCATCTTTGCCTAACAGATAACCACCGc < 2:515202/136‑1 (MQ=255) aGCGCGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCATCTTTGCCTAACAGATAACCACCGcc < 1:877173/143‑1 (MQ=255) gcgcGTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCATCTTTGCCTAACAGATAACCACCGCCt > 1:814721/1‑143 (MQ=255) gcgTGGGTCAGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCCTCTTTGCCTAACAGATAACCACCAACTgg > 1:502726/1‑143 (MQ=255) gTCAGGGATTTATCGCCGCCCTAGCAGCCACCTTTACCCTGACAACAGGTGGCATCTACAGATACGTCAACAGCTCTAATTACTTCGCCAACGGCGAAGATGATGGAATATATACCTAACAGATAACAACCAACAGATCCACg > 2:228838/1‑143 (MQ=255) cAGGGATGTATCGGCGCCCTGGCAGCCGCCTTTAGCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTGATTACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCATCTTTGCCTAACAGATAACCACCGCCTGGTCCACGTa < 2:344560/143‑1 (MQ=255) aGGGATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGACATTACCCTGACAACGGGTGGCCTCTACAGCTTCGCCAACGGCGCTACTTACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCATCTTTGCCTAACCGATAACCACCGCCCGGTCcgcgccc > 2:179451/1‑140 (MQ=255) | GGGTGCGTGGCGCGTCGTGAGTATGCTGACGACCAGACACATCCAGCACTTCCTGGTTATTAACCAGTTCGCCTAAAGTAATGTTGTTGAGAAAACCGGTGAGACGGTCG‑CTCAAATCACGCCACAGCGCGTGGGTCAGGCATTTATCGCCGCCCTGGCAGCCGCCTTTACCCTGACAACGGGTGGCATCTACAGATTCGTCAACGGCGCTAATTACTTCGCCAACGGCGATGCTGCTGGCATCTTTGCCTAACAGATAACCACCGCCTGGTCCACGTAC > NC_000913/2661681‑2661960 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |