Predicted mutation | |||||||
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MC JC | NC_000913 | 3,815,859 | Δ82 bp | 100% | [rph] | [rph] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | NC_000913 | 3815859 | 3815940 | 82 | 83 [0] | [0] 82 | [rph] | [rph] |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 3815858 | 0 (0.000) | 71 (1.770) | 56/244 | NT | 100% | intergenic (‑90/+5) | pyrE/rph | orotate phosphoribosyltransferase/truncated RNase PH |
? | NC_000913 | 3815941 = | 0 (0.000) | coding (609/687 nt) | rph | truncated RNase PH |
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aagCTTTCACAACAGCTTGCCAAGCGCCAATTCACGATGTTGGGGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACGTTTCTACAGAC‑AAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGC < 2:172457/140‑1 AAACTTGAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGAC‑AAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGC < 1:314052/143‑1 AAACTTCGACATCTGCTGGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGAC‑AAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGC < 2:489916/143‑1 AACTTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTTATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGAC‑AAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCC < 1:356085/143‑1 AACTTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCGTACTGTTCTACAGAC‑AAAAAAAAGGCGACTCGTCAGTCGCCTTAAAAATCAGATTGCCAGCGCCGCC > 2:215372/1‑143 TTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCGTCATCTTACTTTTCTACAGAC‑AAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAGAGCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTC > 1:432453/1‑143 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ccgtgTGCCAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGA < 1:211640/138‑1 CAGTTTCCCAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGA < 1:187017/143‑1 cgtcTGCCAGCGCCCCCTTGTGCCGCCCCCTGCACTTCAATGCTGCGCCCGTCTTCGGTCATCCCTACGTTCACGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGAC < 2:545396/139‑1 TTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAG > 1:458939/1‑143 GCCAGCGTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAA < 1:79999/143‑1 GCCAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAA > 1:564593/1‑143 GCCAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGACTCTTCAACGTCTTCCAGATCGCACCCCGCTTCGCCGCCCCCAGCTCCGACAGcac > 2:165683/1‑140 AGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAGTTCCGCCCGAACCTG > 1:817037/1‑143 GCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACGTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGG < 2:566692/143‑1 cccCCTCCTGCCGTCCCGTGCACTTCCGTTGTGCTCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCCGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTTGCTGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGC < 2:470898/140‑1 CCTTCTTCCGTCCCCTGCACTGCAGTGTTGCGCCCGTCTTCGGTCATCACCACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGTTCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCTGCTAC < 2:765539/143‑1 TTCTGCCGTGCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTAGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACGATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCA > 2:788370/1‑143 CTGCCGCCCCCTGCACTGCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAAAGTTTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATC < 2:824554/143‑1 CCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCT < 2:534398/143‑1 CAAACTTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGAC‑AAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3815708‑3815858 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCT > NC_000913/3815941‑3816082 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |