| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,416,239 | C→T | 100% | T498M (ACG→ATG) | pta → | phosphate acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,416,239 | 0 | C | T | 100.0% | 78.9 / ‑6.7 | 34 | T498M (ACG→ATG) | pta | phosphate acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (20/11); minor base G (1/1); total (21/13) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TGCAGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTACGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTG > NC_000913/2416105‑2416378 | tGCAGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGGGCTCGGTATGCTGATGc > 1:289287/1‑143 (MQ=255) gCAGGGATTGAAATCGTTGAGCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGGAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCt < 1:100806/143‑1 (MQ=255) aaaTCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTCCGCGGTATGCCGAGGCTGGAACAGGag > 2:96932/1‑142 (MQ=255) aaTCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACGAAGGCATGACCGAAACCGTTGCGCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGCATGCTGATGCTGGAACAGGATg > 1:730688/1‑143 (MQ=255) aaTCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATg > 1:794863/1‑143 (MQ=255) gTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGt > 1:633678/1‑143 (MQ=255) gTTGAGCCGGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACACTGGCCGGACCGCAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGCAAGACACCCTGGTGCGCGGTATGCCGCTGCTGGAACAGGACGAAgg > 1:366602/1‑142 (MQ=255) ttGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGtt > 2:35063/1‑143 (MQ=255) gtccgcgAAAGCTATGTTGGGCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTACGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTc < 1:262970/140‑1 (MQ=255) ttCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTGGCCGGCGAACAGCTGGAAGACAACGGGGTGCTCGGTAGGCTGATGCGGGAACAGGAAGAAGGTGATGGGCTGGattac > 2:683454/1‑141 (MQ=255) cgcgAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACATAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACCACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGGACAGGATGAAGTTGATGCGCTGGTTTCCgg > 2:707412/1‑143 (MQ=255) aaaGCTATGTTGGCCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCt < 1:219602/143‑1 (MQ=255) tATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTca > 2:173389/1‑143 (MQ=255) aTGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTcac > 1:435244/1‑143 (MQ=255) tgctGGTCGTCTGGTCGAACCGCTTAAGGACAAAGGCATGCCCGACACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTcaca < 2:181602/140‑1 (MQ=255) tGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACACCGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTcaca > 1:211732/1‑143 (MQ=255) gtcTGGGCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCa < 1:544852/143‑1 (MQ=255) gTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGCAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAacac > 2:807343/1‑143 (MQ=255) tAAGAACAGAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTccgc < 1:142753/143‑1 (MQ=255) aaaGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACCCTACCGCACACACCATCCGTCCGCCGCTGCa > 2:616084/1‑143 (MQ=255) aGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCCAACACCATCCGTCCGCCGCCGCAGc > 2:145659/1‑143 (MQ=255) cGAAACCGTCGCCCGCGAACAGCTGGAAGGCATCGTGGGGCTCGGTAGGCGGATGCTGGAACAGGGGGAAGTGGCTGGTCTGGTGTCCGGGGCTGGTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCaaaa < 1:16045/143‑1 (MQ=255) cGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCAc > 2:450340/1‑143 (MQ=255) cGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCCCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGACGAAGTTGATGGTCTGGTTCCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACAACACCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCAc > 2:450339/1‑143 (MQ=255) cGTTGCCCGCGAACACCTGGCAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCCGGTTTCCGGTGCTGTTCACCCTACCGCAAACCCAATCCGTCCGACGCCGCAGCTGCCCAAACCTCCAc > 2:450347/1‑143 (MQ=255) gTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCAcc < 1:840929/143‑1 (MQ=255) ccGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCa > 1:199884/1‑143 (MQ=255) cAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCGGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCt < 1:771411/143‑1 (MQ=255) aGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGGATGCTGAGGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTg < 1:533093/143‑1 (MQ=255) gAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCGGCCGCTGCAGCCGATCAAAACTGCACCGCGCGGCCCCCTGGGATc > 2:776512/1‑143 (MQ=255) gtggtgCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGtt < 1:431265/143‑1 (MQ=255) tgCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGttcttc < 1:83267/143‑1 (MQ=255) cGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAtgc > 1:122653/1‑143 (MQ=255) gTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAtgctg < 1:660495/143‑1 (MQ=255) | TGCAGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTACGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTG > NC_000913/2416105‑2416378 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |