Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_000913 | 3,959,515 | T→A | 5.9% | intergenic (+70/+17) | ilvC → / ← ppiC | ketol‑acid reductoisomerase (NADP(+))/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,959,515 | 0 | T | A | 5.9% | 281.7 / 7.1 | 99 | intergenic (+70/+17) | ilvC/ppiC | ketol‑acid reductoisomerase (NADP(+))/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (48/44); new base A (3/3); total (51/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.55e-01 |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
TGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATCTGACCCTGGCGGAA > NC_000913/3959373‑3959657 | tGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCt < 1:90229/143‑1 (MQ=255) tGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCt < 1:227789/143‑1 (MQ=255) tGCGATTAAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCATAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCt < 2:382088/143‑1 (MQ=255) gATTGAGCGGGTAGGGAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAGCGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGga < 2:111447/143‑1 (MQ=255) taGCAGGCAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAg < 1:498156/142‑1 (MQ=255) gtgcgggtaggtaAGAAATTGCGCGGCTACATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAg < 2:217017/138‑1 (MQ=255) gAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCGCTATGACAGATAGGAAACGTATTGCTGTGGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACGCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAg < 2:218485/143‑1 (MQ=38) aGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAgg < 2:673881/143‑1 (MQ=255) gaggtagggCAGAAACGGCGCGGCTATATGACAGAGAGGAAACGTAGGGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACGCAAGGCCTTCTCCAGGAGAAGGcc < 1:709126/142‑1 (MQ=25) aggtaggtAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCt < 1:829377/143‑1 (MQ=255) taggtaCGAAACGGCGCGGCTATAGTACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGCGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGc < 2:436957/143‑1 (MQ=38) gtaAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGGTAt > 1:2246/1‑143 (MQ=255) gtaAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGGTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCCCCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTAt < 2:351638/143‑1 (MQ=255) cgaaGAAACTGCGCGGCTATGTGACAGATATGGAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTAt < 2:106626/141‑1 (MQ=255) aaGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTAGTGCTGTTGAGGGTTAAGTGAGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACGCTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAGGGCCTTGCTATTa > 1:760580/1‑143 (MQ=38) aaGAAACGGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCACACAGGGAGAGGGAGAAAGCACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTa < 2:601183/143‑1 (MQ=255) aGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATGGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAg < 1:501763/143‑1 (MQ=255) aaaCTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGGCCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGtt > 1:497894/1‑143 (MQ=255) aaaCTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGGTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCGCGACCCACTCCCACAGGGAGAGGGAGACAACACACAAGGCCTTCTCCTGGCAAAGCCCTTGCTATTAggg > 2:452055/1‑141 (MQ=37) aCTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGc > 1:733404/1‑143 (MQ=255) cTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCg < 1:836734/143‑1 (MQ=255) tGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCATTGCTATTAGTTGCgg > 1:22242/1‑143 (MQ=255) tGCGCGGATAGATGACAGATATGATACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGGGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCGCACAGGGAGAGGTATAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCgg < 2:384136/143‑1 (MQ=38) cgcgGCTGTATGGCTGATATGATACGTATTGCTGTGGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTa < 2:657763/143‑1 (MQ=38) tggCTATATGACAGTTATGAAACGTATGGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTACCCAACACGAAGAGGGAGTAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACa < 1:230045/142‑1 (MQ=255) cgGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGGGGGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTAGTAGTTGGGGTACa > 1:499499/1‑143 (MQ=255) ggCTATATGACAGATATGCAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAg < 1:55139/143‑1 (MQ=255) gCTATATCACAGATATGCAACGTATTGCTGTGGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGc < 1:777059/143‑1 (MQ=255) cTATATGACAGATATGAGACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCGCACCCCGACCCTCGCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCa < 2:233723/143‑1 (MQ=255) tataTGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCAc > 1:480391/1‑143 (MQ=255) tataTGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCCTCCCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGccc > 2:508546/1‑141 (MQ=255) atatGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGATAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACGCTCTCCCCCAGGGAGAGGGCGAAAACACTCAAGGCCTTCTGCTGGAGAAGGGCTCGCTCGTAGTTGCGATAGAGctga > 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tatGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCCCCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGAtgt < 1:72188/143‑1 (MQ=255) atGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGAtgtg < 1:583620/143‑1 (MQ=255) aaaCGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGata > 1:117376/1‑143 (MQ=255) aaaCGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACCCAAGGCCTTCTCCTGGCGCAGCCCCCGCTCTCAGCTGCGGTACAGCGCCTTGATGATGCGaga > 2:52222/1‑141 (MQ=25) aaaCGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACACCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACGCTCAAGGCCTTCTCCTGGAGCAGGCCTTGCTATTAGTTGAGGTACAGGAACTGAATGCTGTAata > 1:773637/1‑143 (MQ=37) gacgttgtGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCACACCCCCACCCACTCCTACAGGGAGAGGGAGACAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGGTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGatat < 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cTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTgg < 1:564897/143‑1 (MQ=255) ggtGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgt < 1:337363/141‑1 (MQ=255) ttGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCGCAGGGAGAGGGAGCAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGGACAGCACCTTACTGATGTGCTACCCGAACAggggg > 2:724905/1‑141 (MQ=37) tGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgtgt < 1:21928/143‑1 (MQ=255) ttAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTGATGAGGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCg > 1:755472/1‑143 (MQ=255) tgaaGTGCGGGCTGATGCCCTGCCGCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCg < 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2:532733/1‑141 (MQ=255) caGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACtt > 1:486396/1‑143 (MQ=255) ggagaAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACg > 1:300177/1‑143 (MQ=255) ggagaAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATAGAACg > 1:734367/1‑143 (MQ=255) gaAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCg < 2:42476/143‑1 (MQ=255) aaaaCACTCAAGGCCGTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCgg < 1:740353/143‑1 (MQ=255) aaaCACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTGGTCGCAATAAAGACCCTTCATTAGGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGa < 1:191660/143‑1 (MQ=255) taatagcAAGGCCTTCTCCAGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGaa > 1:684238/7‑143 (MQ=255) cTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGCTATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTACCGAACGCCGGAACCAt > 1:412581/1‑143 (MQ=255) tCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGCGAAAACGACCTTATCGAACGCCGGCACCATc > 2:289337/1‑143 (MQ=255) tCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATc > 1:553453/1‑143 (MQ=255) tCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTAACGGACAAAAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAAGCATc > 2:679836/1‑143 (MQ=255) cacggCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCAGATCCAGTACCGTACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATCt < 1:356284/140‑1 (MQ=255) cAAGGCCTTCTCCAGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATCt > 1:640582/1‑143 (MQ=255) aaGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGCTATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACTCCGGAACCATCTg > 1:112148/1‑143 (MQ=255) aaGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGACCCATCTg > 1:303560/1‑143 (MQ=255) aaGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATCTg > 1:794494/1‑143 (MQ=255) ggCCTTCTCCAGAAGAAGACTTTGCGATTAATTGCGGGACAGCACCTTAATGATGTGATATCCCAGCTGGGGGTGCAGCGGGCCGGTCAGCTCCCGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCAtacggc > 2:465747/1‑138 (MQ=255) ctcCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTCCAGCACCTTAAGGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATCTGACCCTGGc < 1:154101/143‑1 (MQ=255) tcCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGCTAACCGAACTGGGTGTGCAGCGCGCCGCTCGGCCCCACTACCGGACAAGCGAAAACCACATCATCGAACGCCGGGACCCTCTGACCCTgccc > 2:351201/1‑140 (MQ=255) tcCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGCGCCGGTCGGCGCGGCGACGTTACTAGAGAAAACCAATTTATCGAACGCCGGAACCATCTGACCCTGGCg > 1:387266/1‑143 (MQ=255) ccTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCACCTGACCCTGGCgg > 2:545137/1‑143 (MQ=255) cTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGACCGCCGGAACCATCTGACCCTGGCggt > 1:217766/1‑142 (MQ=255) tGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATCTGACCCTGGCGGaa > 1:407322/1‑143 (MQ=255) tGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGAGGTGATATCCGCACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGCACCGGACAAGAGGAAACCACTTTGTCGTACGCCGGGACCATCTGACCCTGGCGGag > 1:155250/1‑142 (MQ=255) | TGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATCTGACCCTGGCGGAA > NC_000913/3959373‑3959657 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |