Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,416,239 | C→T | T498M (ACG→ATG) | pta → | phosphate acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,416,239 | 0 | C | T | 93.5% | 79.4 / NA | 31 | T498M (ACG→ATG) | pta | phosphate acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (14/15); minor base G (2/0); total (16/15) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.84e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ACTGGGTGCAGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTACGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTT > NC_000913/2416099‑2416371 | gcggggTGCAGGTAGTGTAGTCGGTGATCTGGAAGTGGTTGTCGAAGGCTATGTTGGTCGTCGGGTGGTACTGCGTAACAACAAGTGCATGTTCGAGACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGc < 2:103900/140‑1 (MQ=255) ggTGCAGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGAt < 1:517098/143‑1 (MQ=255) gCAGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAGGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACACAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGACGACAACGTGGTGCTCCGTATGCTGAGGCt > 2:344313/1‑143 (MQ=255) cAGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGGTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGAGCACGGTAGGCGGATGccg > 2:331236/1‑141 (MQ=255) aGGGATTGAAATCGTTGTTCCAGAAGTGGTTCGGGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTgg < 2:208464/143‑1 (MQ=255) aTTGGAATCGTTGATCCAGAAGCGGTTCGCGAAAGCTATGCTGGTCCTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAGCCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACa < 2:312722/143‑1 (MQ=255) aTTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGGAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTAGCCCGCGAACAGCTGAAAGAAAACGTGGTGCGCGGCATGCGGACACTGGAACa > 2:432315/1‑143 (MQ=255) tCGGTGACCCAGAAGGGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCCGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGaa < 1:302294/143‑1 (MQ=255) gTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGACGACAACGTGGTCCTCGGTCTGCTGATGTCGGAACAGCGTGAAGt > 1:562872/1‑143 (MQ=255) gATCCAGAAGTGGGTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGa < 2:284787/143‑1 (MQ=255) tCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAGCAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTTATGCGGGACCAGGGCGAAGCTgctc > 1:225691/1‑140 (MQ=255) cAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGCAGTTGATGGt > 1:440972/1‑143 (MQ=255) gAAGTGGTGCGCTAAAGCTATGTTGGTCGCCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAGAGGCACGACCGGAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCt < 2:583793/143‑1 (MQ=255) aaGTGGTTCGCGACAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTg < 1:435900/143‑1 (MQ=255) tCGCGCAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGATCAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCg < 1:157180/143‑1 (MQ=255) tCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACCGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCg > 1:273681/1‑143 (MQ=255) cgAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAACTCGAAGACAACGCGGGGCTCCGTATGCTGAGGCCGGAACAGGACGAAGCTGATGGTCTGGCCTCCGGTg > 2:273818/1‑143 (MQ=255) cgAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCCTAAGAACCAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCCCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCGGAAGCCGGAACAGGATGAAGCCGCTGGCCTGGTCTCCGGtc > 2:603385/1‑142 (MQ=255) aGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGAAGCTGAATAAAGAAGAAGGTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGt > 1:591262/1‑143 (MQ=255) ggTCGTGTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTAc < 1:445100/143‑1 (MQ=255) aaGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTGGGTCGGCTGATGCTGGCACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGGTCACACTACCGCAAACACCATCCCTccgcc > 2:356979/1‑143 (MQ=255) aaGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTccgcc > 2:1873/1‑143 (MQ=255) gAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAAc < 1:542816/143‑1 (MQ=255) ccGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCa > 2:428910/1‑143 (MQ=255) cGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCCAAGCTGCAc > 1:580947/1‑143 (MQ=255) cgcgAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTAATCAGACCTGCCCCGGGCAg > 2:572995/1‑143 (MQ=255) aGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTg < 1:114225/143‑1 (MQ=255) gACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTc > 2:17045/1‑143 (MQ=255) tggtgCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGttc < 1:544967/143‑1 (MQ=255) tggtgCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGttc < 2:564966/143‑1 (MQ=255) gtgCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGttctt < 2:326893/143‑1 (MQ=255) | ACTGGGTGCAGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTACGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTT > NC_000913/2416099‑2416371 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |