| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,416,239 | C→T | 100% | T498M (ACG→ATG) | pta → | phosphate acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,416,239 | 0 | C | T | 100.0% | 41.5 / NA | 18 | T498M (ACG→ATG) | pta | phosphate acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (11/7); total (11/7) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
GGGTGCAGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTACGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTAT > NC_000913/2416102‑2416358 | gggTGCAGGGATTGAAATCGTTGCTCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTAGGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGACCAGCTGGAAGCCAACGTGGTGCTCGGTATGCTgc > 1:78012/1‑142 (MQ=255) aGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCGGATGCTgg > 1:170224/1‑143 (MQ=255) ggATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGATGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGCACAGCTGGAAGACACCGTGGTGCCCCGCATGCTGCTGCTGGaa > 2:163155/1‑143 (MQ=255) gAAACCGTTGAGCCAGAAGTGGTCCCAGAAAGCCGGTTTTCTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGa < 1:329339/143‑1 (MQ=255) aaaTCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGGGCTCGGTATGCTGCGGCTGGGACAGGAt > 1:420283/1‑143 (MQ=255) gaggTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACGAAGGCATGACCGAAACCGGTGCCCGGGGAGAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCt < 1:209044/140‑1 (MQ=255) gcgAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAGAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGATGCCCGCTATGCTGATGCTGGCACAGGATGGAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGt > 2:156500/1‑143 (MQ=255) gAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGCTGCTGAAACAGGATGAAGTTGATGGACTAGTTTCCGGTGc > 1:311109/1‑143 (MQ=255) aggtATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAATAAAGGCATGACCGAAACCGTTGACCGTGGTTGGTGTCGATACAGTATAGTACTGGTGATTCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGt < 1:112150/140‑1 (MQ=255) aTGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATCGGGGCACAGGATGATGTTGATGGACTGGTTTCCGGTGCTGTTcac > 1:434939/1‑143 (MQ=255) cttgTCCAACTGACTAATGACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCaaa < 1:13756/140‑1 (MQ=255) tGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAac < 1:422825/143‑1 (MQ=255) gAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGTATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCAt < 1:32774/143‑1 (MQ=255) aaCTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTCCCGCAAACACCAtc > 1:468288/1‑143 (MQ=255) tAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCGGGAAGACCACGTGCTGCTCGCTCTGCTAATGCTGGACCAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTCGACGGCGCTGTGCCCGCTACTGCACAGACCCCCCGTccgc > 2:3014/1‑143 (MQ=255) cGAGACCGTGGCCCGCGAACAGCTGGAAGACGACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCaaaa < 1:19639/143‑1 (MQ=255) ccGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCACGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGGCTGGGTTCCGGTGCTGTTCACACTTCAGCAAACACCATCCGCCCGCCGCTGCCGCAGATCAGTGCGGCACCGGGcg > 2:210700/1‑142 (MQ=255) ggAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCACCTGATCAAAACTGCAACGAGAAGCCCCCAGGGAt > 2:286632/1‑143 (MQ=255) | GGGTGCAGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTACGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTAT > NC_000913/2416102‑2416358 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |