Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_000913 | 3,815,859 | Δ82 bp | [rph] | [rph] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | NC_000913 | 3815859 | 3815940 | 82 | 88 [0] | [0] 86 | [rph] | [rph] |
New junction evidence | |||||||||||
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accCCTTCTTGCTAAGCGCAAATTTAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGAC‑AAAAAAAAGGCGATTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCC < 1:912530/140‑1 CTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGAC‑AAAAAAAAGGCGCCTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCCGTCC > 1:115482/1‑143 TGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCGGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGAC‑AAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCC < 1:58936/143‑1 TGCGTGCTGAGCGCAGGTTCAACACACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGAC‑AAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCTGCCTTCTGCCGTCCC < 2:966529/143‑1 GCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGAC‑AAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCC > 1:1149771/1‑143 TTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGAC‑AAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAACTCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTG > 2:714515/1‑143 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AATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCGACGTGAGCCAGATCGCTGACCGCTTCGCCGTTCCCAATgc > 2:393174/1‑141 ATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCCTCCACGTATTCCAGCTCGCAAACCGCTCCGCCGTCCACAATTCC > 2:1131836/1‑143 TTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAACCCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAG > 1:997225/1‑143 TTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAG > 1:1019206/1‑143 TTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGGCTTCACCGTCGTCCAGATCGCCACCGGCTTCGCGGTTCGCGCTTCGGACAG > 1:381373/1‑143 CCAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTCCGTTCATGTCGCCCTCTGCGGCAGAGTCTTCACCGTATTACAGATCGCAAACCGCCTCGCCGATCACAATTACGACACAAcc > 2:40879/1‑141 AGCGCCGCCTTCTCCCGTCCGCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTG < 2:518201/143‑1 CGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGGCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCG < 1:816179/143‑1 GCCCCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGCCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGG < 2:667331/143‑1 CGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTGCGACAGAAACTGCGGCT > 1:455828/1‑143 GCCTTCTGCCGTCCCCTCCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTA < 2:207397/143‑1 CCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTGCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTAC > 1:956102/1‑143 TTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCACCGTATTCCCGATCGCACACCGCTTCGCCGTTCGCAATTCCGACAGAAACTCCGTCTACCA > 1:117798/1‑143 TTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCA > 2:1051080/1‑143 TGCCGTCCCCTTCACTTCAATGCTGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCC < 2:115482/143‑1 GCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTCCGGGCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCC < 2:1071659/143‑1 CCAAACTTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGAC‑AAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3815707‑3815858 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCC > NC_000913/3815941‑3816081 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |