| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,978,503 | Δ776 bp | insB‑5–insA‑5 | insB‑5, insA‑5 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1978503 | 1979278 | 776 | 70 [0] | [0] 70 | insB‑5–insA‑5 | insB‑5,insA‑5 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1978502 | 0 (0.000) | 65 (1.080) | 51/268 | 0.1 | 100% | intergenic (‑305/+16) | flhD/insB‑5 | DNA‑binding transcriptional dual regulator FlhD/IS1 protein InsB |
| ? | NC_000913 | 1979279 = | 0 (0.000) | intergenic (‑64/‑474) | insA‑5/uspC | IS1 protein InsA/universal stress protein C | |||||
ATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1978353‑1978502‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cat‑aaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGC > NC_000913/1979279‑1979418 ATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAAC > 1:688012/1‑143 AGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT < 1:1125606/143‑1 tATGGGTCTTTGCACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAA < 1:193345/142‑1 TGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGAAGCGGGGATGCGATTTTCAATGATGCGAGATGCAGAG‑CACACAAAACACGCAATTACTTAACAT‑AAAcg > 2:400923/1‑141 GGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAGCAT‑AAATtg > 2:312792/1‑141 GTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTCCACGCACACACAACGGAGTGGTGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTAT < 2:623773/143‑1 TCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATA > 1:902053/1‑143 TCTAACATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTGTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTT < 2:75813/143‑1 AAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTT > 1:766329/1‑143 AAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTT > 2:751881/1‑143 AGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTCCTTAACGT‑AAATGTATAAGTGATACTTTatctt > 2:67146/1‑138 GATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGATGCGATTTTCAATAATGCGAGATGCAGAT‑CACGCAAACAACTCAATTACTTAACAT‑AAACGTATAATCCATACTTTCGCTTT > 2:499275/1‑143 TTTTTCGTAGAGGGACGCAACGGTGCTCGTCACTACACGCACATACAGCGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGG < 2:1101386/143‑1 TTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGG < 1:418445/143‑1 TTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGG < 1:1127928/143‑1 TTTTCCTTAACTGGACGCGACTGTACTCGTCACAACACGCACATACGACGGAGGGGGGCTGCGATGTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACCCTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATCCTTTTGTTTTGt < 1:378718/143‑2 TTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGG < 1:372376/143‑1 TTTCCTAAATCGACACAACTGTTTTCGTCACTATACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGT > 2:1065073/1‑143 TAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATT > 1:935519/1‑143 AATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTC > 1:40474/1‑143 ATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCc > 1:282433/1‑142 ATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCA > 1:625131/1‑143 ATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTGTTGTTTTGGGTGTATTTCA > 2:1140946/1‑143 CGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAAT < 1:483645/143‑1 GACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTCATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTCTTTGGGGTGTATATAAATC > 2:519820/1‑143 agGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACACCGGAGGCGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCT < 2:1041775/141‑1 AACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCTTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTA > 1:965271/1‑143 ACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTCTTTCAATCTGTGAA > 1:462367/1‑143 CTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCTAGATGCAGAT‑AAGTTGATTTTCGCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAA > 1:1143344/1‑143 ggACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATATTCAATAGTGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAA < 1:526056/141‑1 GTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCCGTTAAAAA < 1:912775/143‑1 TCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGCTTTTCAATAATGCGCGATGCGGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTCTGGCTGCATTTCAATCTGTTAAAACGTTT > 2:254987/1‑143 TCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACAGAAAACAAACAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATAATTTTGGTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAATTT > 2:273298/1‑143 TCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTT > 1:773185/1‑143 GTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTGTCAATAGTGCGTG‑GCCGGATCCACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTT < 1:260468/143‑1 CACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCG > 1:144108/1‑143 CACCACACGCAGATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCG < 1:290469/143‑1 atgCGCACATACAACGGAGGGGGGCGGCGAATGGCAATAAAGCGTGATGCAGGT‑CACACAAAACACTCTATTACTTAACAT‑AAATCTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTAC < 1:211830/140‑1 GCACATACAACGGAGGGGGGTTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCACTCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCca > 1:371819/1‑141 GCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAGCGT‑AACTGCATAAGTCATACTTTTGTTCTGGGCTTATTTCAATACGTTTAAACGTTTTTCGCTcccctt > 2:864408/1‑137 CGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAA > 1:10403/1‑143 GGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACCCTAACAAGCAAAAA > 2:170226/1‑143 GGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTAGCTACGCTAGCAAGCAAAAA > 1:749324/1‑143 GGGTGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCTTTATATTTAGATAACTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGA < 1:312792/143‑1 TGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACCCAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAACAAAAATGAAACAGGA > 2:173028/1‑143 TTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAAATGTATAAGTCTTACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAGGTTTTTCGTTACGCTGCCAACCAAAATGGAAACAGGATTAA > 1:367432/1‑143 TTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAGTCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAAT < 2:941846/143‑1 TTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATC < 1:759849/143‑1 TCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGA < 1:1065073/143‑1 AATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAA < 1:1140946/143‑1 CGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATG > 1:861852/1‑143 ATGCAGAT‑CACATAAAACACTCAATTACTTGACGG‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGC < 2:11095/143‑1 GCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGC > 2:1127321/1‑143 CAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCA < 1:716673/143‑1 CAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTAATACTTTTGTATTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGaa > 1:590058/1‑141 GAT‑CACACAAAACACTCAAGTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACA < 1:701456/143‑1 AT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATCAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGATTTTCGCTACTCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAACTAAGATATTGCGAACAG > 2:20691/1‑143 AT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAG > 1:335922/1‑143 CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAAGAATAATCGAAATGGGAAGTTACGCACAGca > 2:791738/1‑141 ACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAA < 2:444826/143‑1 ACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATATCAAAGCGTTATTACGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGAGCACAGTCAAA > 1:44210/1‑143 CAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAA < 2:935519/143‑1 CTCAATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCA < 2:383170/143‑1 AATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACtc > 1:398516/1‑141 AATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGGTTCGCAAAGTCAACATACATCACCG > 2:373355/1‑143 ATTACTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGT > 1:754683/1‑143 ACTTAACAT‑AAATGTACAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAA < 1:28097/143‑1 ACTTAACAG‑AAGTGTATAAGTGATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAGAATAACTCACCGTAAA < 2:255277/143‑1 CTTAACAT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAAT > 1:27308/1‑143 ACAT‑AAATGGATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAAACTGTTAAAAAGTGTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATC < 1:400923/143‑1 AT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCAT > 2:894722/1‑143 AT‑AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCAT > 2:425240/1‑143 AAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCT > 2:435048/1‑143 tATGTATAGGTGATACTTTTGCTTTGGGTGTATTTCAAGGTGTGAATAAGTTTTGCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAATCATGAATTATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTG < 2:366211/142‑1 ATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGC > 1:188069/1‑143 ATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAT‑CACACAAAACACTCAATTACTTAACAT‑AAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1978353‑1978502‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cat‑aaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGC > NC_000913/1979279‑1979418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |