Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_000913	1196262	1211449	15188	23 [21]	[22] 23	[icd]–[icdC]	[icd],ymfD,ymfE,lit,intE,xisE,ymfH,ymfI,ymfJ,ymfK,ymfT,ymfL,ymfM,oweE,ymfN,aaaE,ymfR,beeE,jayE,ymfQ,ycfK,tfaP,tfaE,stfE,pinE,mcrA,[icdC]

TAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTA  >  NC_000913/1211407‑1211592                                            |                                                                                                                                               gagatgaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGCCCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGtt                                             <  1:38057/137‑1 (MQ=255)   gatgaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTg                                           <  2:101786/139‑1 (MQ=255)    tggaTGCTGCGCCGTATGGGGTGGACTCGAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTgg                                          <  2:583192/140‑1 (MQ=18)     tgaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGt                                         >  2:903711/3‑143 (MQ=255)      gaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTg                                        >  1:139066/2‑143 (MQ=255)        tgctgcGGCTGAGGGGTGGGACTGAAGTGGCTGACGTGAGTGTTAAAGGTGTGGAAGTCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATTACGTCGAACTTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGaa                                      <  2:627764/143‑1 (MQ=17)         gctgcGCCTGATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAg                                     <  2:321713/143‑1 (MQ=255)         gctgcCCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGCCCTGATTGTCAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAg                                     <  1:571240/143‑1 (MQ=255)           tgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTAAGGAAGGAGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGATAAGATGCTGAAAAGTTCAGAGATTGGAGAAGCg                                   >  2:226814/1‑143 (MQ=255)            gcgtgctatGGGTTGGACTGAGGCGGCTGACCTGATTGTGAAAGGTATGGAAGGCGCCATCAATGCGAAGTCCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGa                                  <  2:873774/137‑1 (MQ=17)                  tatGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCg                            >  2:826882/1‑143 (MQ=255)                     gggTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGaaa                         <  2:473294/143‑1 (MQ=255)                      ggTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGaaaa                        <  1:826882/143‑1 (MQ=255)                       gTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAAc                       <  2:860992/143‑1 (MQ=255)                       gTTGCACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACCTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAAc                       <  2:253334/143‑1 (MQ=255)                             cTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTaa                 >  2:724676/1‑143 (MQ=255)                              tGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAt                >  1:356938/1‑143 (MQ=255)                                 aGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAACTGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtatc             >  2:757382/1‑143 (MQ=255)                                     gCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGTCCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCa         >  1:956459/1‑143 (MQ=255)                                      cTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAt        <  2:24818/143‑1 (MQ=255)                                         aCCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTCACTTATGACTTCGGACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGACCTGACAAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAtgtg     >  2:185472/1‑143 (MQ=18)                                           cTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGtt   >  2:905367/1‑143 (MQ=255)                                            tGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTa  >  1:1057456/1‑143 (MQ=255)                                            |                                                                                                                                               TAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTA  >  NC_000913/1211407‑1211592

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑