Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,416,239 | C→T | T498M (ACG→ATG) | pta → | phosphate acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,416,239 | 0 | C | T | 97.0% | 203.2 / NA | 67 | T498M (ACG→ATG) | pta | phosphate acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (28/37); minor base G (0/2); total (28/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.06e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTGCAGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTACGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATG > NC_000913/2416104‑2416375 | gTGCAGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATg > 1:270469/1‑143 (MQ=255) gTGCAGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCATTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATg < 1:1011831/143‑1 (MQ=255) cAGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTatgctgatgctg > 2:704086/1‑143 (MQ=255) aGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTgg < 2:151724/143‑1 (MQ=255) aTTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCCGATGCTGGAACa > 1:179395/1‑143 (MQ=255) ttGAAAGCGTTGCTCCAGTAGTGCTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGCAAGAACAAAGGCATAAGCGAAATCGTTGCCCGCGAACCGAAGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAg < 2:406201/143‑1 (MQ=255) cGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGGTGGAg > 2:898633/1‑143 (MQ=255) gTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGGATGCTGATGCTGGAACAGGATGCAGt > 1:664923/1‑143 (MQ=255) tCCAAAAGCGGTCCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATg < 1:783755/143‑1 (MQ=255) cAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTGAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTCCTCGGTATGCTGATGCTGGACCTGGCTGCAGtcgttcgt > 1:170574/1‑136 (MQ=255) cAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGt > 1:201529/1‑143 (MQ=255) aaGTGGGTCGCGAAAGCTACGTGGGTCGTCCGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGTGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTg < 1:127455/143‑1 (MQ=255) gTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTc < 2:1092471/143‑1 (MQ=255) cgcgAACGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGCTGCTGCAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCgg < 1:789110/143‑1 (MQ=255) cgcgAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGATCAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCgg < 1:587035/143‑1 (MQ=255) cgcgAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCgg > 1:772702/1‑143 (MQ=255) gcgAATGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGt < 2:1088088/143‑1 (MQ=255) gcgAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGt < 2:476327/143‑1 (MQ=255) ggAAGGCTATGGTGGTCGGCTGGGCGAAGTGCGGAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGGACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTg < 2:794007/142‑1 (MQ=255) aagggtATGTCGGTCGTCGGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGCCCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCt < 1:876770/138‑1 (MQ=255) aGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGt > 1:901872/1‑143 (MQ=255) aGCTATGCTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGGAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGt < 2:831851/143‑1 (MQ=255) cTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGCACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTTTAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTc < 1:657321/143‑1 (MQ=255) tctGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGTGTAAGGACAAAGCCCTGACCGAAACGGTTGCCCGCGATCAGCTGGAAGATAACGTGGTGCTTCGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGTTTTCCGGTGCTGTTca < 2:611058/141‑1 (MQ=255) aTGTTGGTCGGCTGGGCGGACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTcac < 1:354402/143‑1 (MQ=255) gTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGACGCTGGAACAGGATGACGTTGCTGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTACgcac > 2:1104243/1‑143 (MQ=255) ttGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACt < 2:700609/143‑1 (MQ=255) tGGTCGTCTGGTGGATCTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGGTGGAAGACGACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTa < 2:133942/143‑1 (MQ=255) tcTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCCCACTACCGcga > 1:202946/1‑141 (MQ=255) tcTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCaa < 1:976663/143‑1 (MQ=255) cgggTCGGACTGCGTAAGTACAAACGGATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAAGGGGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCaaa < 2:1100881/141‑1 (MQ=255) cTGGTCGGGCTGCGTAGGGACAAAGGCATGACCGAAACCGAAGCGTGCTGTCAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCaaa < 2:808150/143‑1 (MQ=255) cTGGTCGACCTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGCAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCaaa < 1:289854/143‑1 (MQ=255) gTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGc > 1:67301/1‑122 (MQ=255) gTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGc < 2:67301/122‑1 (MQ=255) cGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCa < 2:724740/143‑1 (MQ=255) gagcTGCGTAAGAGCAAAGGCATGGCCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCAt < 2:1126477/140‑1 (MQ=255) gAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGCAAGTCAACGTGGTGCTCGGCATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCAt < 1:692510/143‑1 (MQ=255) tGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCCGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTGCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAAAACCAtccgt > 2:54911/1‑143 (MQ=255) tAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACGACCTAAAGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGCAGTTGCTGGTCTTGACGTCGGTGCTGTTCAGACTACCGCAAACCCCATCCGTccgc > 2:748693/1‑143 (MQ=255) tAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGGTGCTGGAACAGGATGGAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTTACACTACCGCAAACACCATCCGTccgc > 2:17800/1‑143 (MQ=255) tAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTccgc > 1:468886/1‑143 (MQ=255) tAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGAGGCTGGGACAGGATGAAGGTGATGGTCTGGTGTCCGGTGCTGTGCACGCGACCGCACACACCATCCGTccgc > 2:316611/1‑143 (MQ=255) atgAACAAAGGCACGACCGAACCCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTccgcc < 2:201529/141‑1 (MQ=255) aCAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGGATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCTCACTACCGCAAACAACATCCGTGCGCCGCTg > 1:501599/1‑143 (MQ=255) cAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCCCCGCTGc > 2:165040/1‑143 (MQ=255) ggCATGACCGAATCCGTGGCGCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCt < 2:855799/143‑1 (MQ=255) gCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACGACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTg < 1:497709/143‑1 (MQ=255) gCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCGGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCAACCGCCCGCCGCCGCAGcgg > 2:932949/1‑141 (MQ=255) cagccGTTGCCCGCGGACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGAGGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACt < 1:1024932/140‑1 (MQ=255) tcccGCGAACAGGTGGAAGACAACGAGGAGCCGGGGATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCggg < 1:152437/142‑1 (MQ=255) ccGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGcc > 2:971226/1‑142 (MQ=255) ccGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACGGCACCGGGCa > 2:1113750/1‑143 (MQ=255) ccGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGCTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCACACCTGCACCGGGCa > 2:700747/1‑143 (MQ=255) gcgGACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCGCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGc < 2:112614/143‑1 (MQ=255) gcgAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGCTCACAACCGCACCGGGCCGc > 2:93014/1‑143 (MQ=255) cgAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCt > 1:943337/1‑143 (MQ=255) gAACAGCTGGAAGACAACGTGATGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGCTTTCCGATGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTCCAGCTGATCACAACTGCACAGGGCAGCTc > 2:594477/1‑143 (MQ=255) aaCCGCTGGAGGACAACGGGGTGCCTGGTATGCTGATGCTGGGACAGGATGAAGTGGATGGTCTGGTTTCCGGGGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTcc < 2:832105/143‑1 (MQ=255) aaCAGCTGGAAGGCAACGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTcc < 2:172876/143‑1 (MQ=255) aggcAACGTGGTGCTCGTGAGGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGGTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCtt < 2:986498/140‑1 (MQ=255) aaCGCGCTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCgt < 1:383280/143‑1 (MQ=255) aCGTGGTGCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCgtg > 1:1145434/1‑143 (MQ=255) gtggtgCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACAGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGCTCAAAGCTGCACCGGGCAGCTCCCTGGGATCTTCCctgct > 2:899464/1‑141 (MQ=255) tggtgCGCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGttc < 2:301633/143‑1 (MQ=255) gtgCTCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGttctt > 1:763827/1‑143 (MQ=255) gCTCGGTAGGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCa < 1:704086/143‑1 (MQ=255) tCGGTATGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCAtg < 1:1036183/143‑1 (MQ=255) | GTGCAGGGATTGAAATCGTTGATCCAGAAGTGGTTCGCGAAAGCTATGTTGGTCGTCTGGTCGAACTGCGTAAGAACAAAGGCATGACCGAAACCGTTGCCCGCGAACAGCTGGAAGACAACGTGGTGCTCGGTACGCTGATGCTGGAACAGGATGAAGTTGATGGTCTGGTTTCCGGTGCTGTTCACACTACCGCAAACACCATCCGTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATG > NC_000913/2416104‑2416375 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |