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| MC JC | NC_000913 | 3,815,859 | Δ82 bp | [rph] | [rph] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
AACTTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGC‑CAGCGCCGCCTTCTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3815710‑3815858‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATC > NC_000913/3815941‑3816079 AACATTAACACCGGCTTGCTAAGCGCCAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGC‑CAGCGCCGCC < 2:871229/143‑1 CTTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCCTGGGATCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGC‑CAGCGCCGCCTT < 1:714746/143‑1 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ATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGC‑CAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTATGGTCGTGTCGGTCTCTGCGGCCGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCCCCACCCGCTT > 1:819784/1‑143 ATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGC‑CAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGCTCTCACACCGCTT > 1:53522/1‑143 ATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGC‑CAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAAAGTCTTAAACGTATT‑ACAGATCACAAAaagcat > 1:76428/1‑137 TCGCCTTAAAAATCAGTTCGC‑CTGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTCGCCG < 2:826258/143‑1 GCCTTAAAAATCAGTTTGC‑CAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCCTGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCACAAAACGCTTCGCCGTT > 1:914146/1‑143 CCTTAAAAATCAGTTTGC‑CAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTTCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTAGCCGTTC > 1:12313/1‑143 TAAAAATCAGTTTGC‑CAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTCTT‑CCACACCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACA > 1:710534/1‑143 AAAAATCAGTTTGC‑CAGTGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCGGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAA < 2:902685/143‑1 AAATCAGTTTGC‑CAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATT > 1:788733/1‑143 AATCAGTTTGC‑CAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTC > 1:55571/1‑143 CAGTTTGC‑CAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGA < 1:571130/143‑1 CAGGTTGC‑CAGCGCCGCCTCCTGCCGTCCCCTGCACTGCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTCCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGA < 1:467583/143‑1 TTTGC‑CAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTGCCTGTCGGCCTCTGCGGCAGAGACTTCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAG > 2:526397/1‑143 TTGC‑CAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTGGCGGATGGGCGGCC‑CGTCGCCGTTCACAATTCCGACAGA < 2:804596/143‑1 TTGC‑CAGCGCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGA < 2:816844/143‑1 GCCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGG < 1:235876/143‑1 CCGCTTTCGGCCGGCCCCTGCACTTCACTGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGC < 2:645173/143‑1 GCCTTCTTCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTA < 2:82776/143‑1 cCTGCCGTCCCCTGCACTTCTCTGCTGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCAT < 2:554145/142‑1 CTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATC < 1:199042/143‑1 AACTTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGC‑CAGCGCCGCCTTCTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3815710‑3815858‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATT‑CCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATC > NC_000913/3815941‑3816079 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |