New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 4240189 = | NA (NA) | noncoding (32/37 nt) | other | REP314 |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
AAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGC‑TGGTG‑GCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCT > NC_000913/4240016‑4240300 | aaGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGC‑TGGTG‑GCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGc < 1:442678/143‑1 (MQ=255) gtcatagcagtacctccttcacagtggcgagcttcctgtataacgcaaaaatgtgacggagatctatattttttgtgtatgttttgttcaacctggatttggagcgcgcctccaccaaagccggatatacctacccgtaggcc < 2:612590‑M1/2‑1 (MQ=255) cTTCATTTTTACCCCCGTTGTCGGGGTACGTTTCATTGGTTCCAGAGGAACATGGTCGATTTTTCGCGCATTGC‑TGGTG‑GCTGGGAATCACCTGAGTGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGa < 2:450194/143‑1 (MQ=255) tCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCTAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGC‑TGGTG‑GCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGCTTGTCTTGCCGGTTg > 2:300123/1‑143 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ccaccTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGAGAACTACGCGGTG‑G‑TGGGGATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAg > 1:622162/1‑143 (MQ=255) caccTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGC‑TGGTG‑GCTGGGCATCACCTGAATGGGTGAGTATTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCGAgg > 1:330583/1‑143 (MQ=255) caccTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGC‑TGGTG‑GCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAgg > 2:461929/1‑143 (MQ=255) caccTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGC‑TGGTG‑GCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAgg > 1:793528/1‑143 (MQ=255) accTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGC‑TGGTG‑GCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGgc > 2:599615/1‑143 (MQ=255) 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1:225019/1‑142 (MQ=255) tGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCCGGTTGAACAAAACATcca > 1:23699/1‑143 (MQ=255) tGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCCTTGGTGGAGGCGCGCTCCAACTCCAGGTCGAACAAAACATacc > 1:896832/1‑142 (MQ=255) aaTGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGAGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACCTAcaca > 2:128034/1‑143 (MQ=255) aTGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCGACGGGTAGGTATATCCGGCATTAGTGGAGGCGCGCAGCAAAACCATGTTGAACAAAACATccacga > 1:365226/1‑141 (MQ=255) gagcgcgcctccaccaaagccggatatacctacccgtaggCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTa < 2:597102‑M1/26‑1 (MQ=255) gagcgcgcctccaccaaagccggatatacctacccgtaggCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTa > 1:597102‑M1/41‑66 (MQ=255) tGAATTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCCCATCCAGGTTGGCCAAACCATACACaaaaact > 1:20533/1‑141 (MQ=255) tttttAAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTTTTGCCGTATGTGCCGTCATGTGTGGTTTTTTCGGCTTACTTGTAAGTATGACCAGCTTTGGGGGAGGCGCGCGCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAAtata < 1:722491/143‑1 (MQ=255) tctttGAATACCCGCCTTTGGTGCGGTTTAGCTGGCCGGATGCGCCGCCGGGCGCCGCTTATCCGGCCTCCGGGTACGTATATCCGGCTTGGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAAtata < 2:521232/141‑1 (MQ=255) ttACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCg < 1:6668/143‑1 (MQ=255) ttACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGAGGAGGCCCGCCCCAAATCCCGGTTACACAACACATACACCCAAAACACAGATCTCCg > 2:86197/1‑143 (MQ=255) ttGGTGCGGTTTGTATTGCCGGATGCGCCACCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGCATATCCGGCTTTGGTGGAGGCACGCTGCAAAGTCAGGATGAACAAAGCATACACAACAAATATAGATATCCGACACAgttt > 2:914349/1‑143 (MQ=255) tGGTTCGGACTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACAttttt < 1:18246/143‑1 (MQ=255) ttgtggcttGTCGTGCCGGAGGCGCCGCCAGGGGCGGCCTAGCCGGCCTACGGGTACGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCGCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGc < 2:976044/136‑1 (MQ=255) gggCGGTTGGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGc < 1:68542/141‑1 (MQ=255) gggTTTGTCTTGCCGGAGGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGTCGCGCGCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGtt < 1:802354/142‑1 (MQ=255) gggTTTGTATTCCCGGATGCGCCGCCAGGGGCGGCTTAGCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGtt < 2:633502/142‑1 (MQ=255) cGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGtt < 1:856815/143‑1 (MQ=255) tttGTCTTGCGGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTtata < 2:931369/143‑1 (MQ=255) tttGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGCGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTtata > 2:295312/1‑143 (MQ=255) ggtggcgggCCGGAGGCGCGGCCAGGCGCGGCTGATCCGGCCGAGGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTtata > 2:279871‑M1/10‑143 (MQ=255) ttGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATAc < 1:679743/143‑1 (MQ=255) tGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTCTTGCGTTCTACAGGAAg > 2:580009/1‑143 (MQ=255) CCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCt < 2:850631‑M1/143‑1 (MQ=255) | AAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGC‑TGGTG‑GCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCT > NC_000913/4240016‑4240300 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |