Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 95,730 | A→G | 32.4% | M361V (ATG→GTG) | murF → | D‑alanyl‑D‑alanine‑adding enzyme |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 95,730 | 0 | A | G | 32.4% | 38.6 / 29.3 | 46 | M361V (ATG→GTG) | murF | D‑alanyl‑D‑alanine‑adding enzyme |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (18/13); new base G (8/7); total (26/20) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.03e-01 |
CCAGGCCGTCTGTTCCCCATCCAACTGGCAGAAAACCAGTTGCTGCTCGACGACTCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTAAGCGTGGGTAAACAAAGCCATGCTATCAGCACCGCCAGCGGCGTTGGC > NC_000913/95589‑95861 | gcAGGCCGGTTGTTCCTCCGCCAACTGGCAGAAAACCAGTTGCTGCTCGACGACTCCTACAACGCCAATGCCGGTTCAATGCCTGTAGCAGTCCAGGTACTGTCTTAAATGCCGTGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGatat < 2:128999/142‑1 (MQ=255) gCCGTCTGTCCCCCATCCAACTGGCAGAAAACCAGTTGCTGCTCGACGACGCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACGGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCg < 1:391562/143‑1 (MQ=255) ccGTCTGTTCCCCATCCAACTGGCAGAAAACCAGTTGCTGCTCGACGACTCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCgg > 1:394857/1‑143 (MQ=255) ccGTCTGTTCCCCATCCAACTGGCAGAAAACCAGTTGCTGCTCGACGACTCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGAGGTGGCgg > 1:818126/1‑143 (MQ=255) tGTTCCCCATCCAACTGGCAGAAAACCAGTTGCTGCTCGACGACTCCTACACCGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGGTGTAGCGGAACta > 2:306308/1‑142 (MQ=255) ttCCCCATCCAACTGGCAGAAAACCAGTTGCTGCTCGACGACTCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATGACGGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACAGCGTCCGGGGGGTAGGCGCTAGGGCgggcccggg > 2:765259/1‑136 (MQ=255) cccATCCAACTGGCAGAAAACCAGTTGCTGCTCGACGACTCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGgcgc < 1:187806/143‑1 (MQ=255) ccATCCAACTGGCAGAAAACCAGTTGCTGCTCGACGACTCCTATAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGGGGTGGGCGATGTGGCGGAGCTGGGCGCt > 1:688279/1‑143 (MQ=255) accaaaCTGGCAGAAAACCAGTTGCTGCTCGACGACTCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATAACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGa > 2:170638/5‑143 (MQ=255) tCCAACTGGCAGAAAACCAGTTGCTGCTCGACGACTCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGTAGCTGGGCGCTGaa > 1:874685/1‑143 (MQ=255) ccAACTGGCAGAAAACCAGTTGCTGCTCGACGACTCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCCGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTCCCGCGGGCGGGTGGTGGGCGAGAGGGCGGAGATGGGCGCTGaaa > 1:78683/1‑143 (MQ=255) acAGAAAAGCCGTTGCTGCTCGACGACTCCTACAGCGCCAATGTCGGTTCAATGGCTGCAGCAGTCCAGGGACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATGTGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGc < 2:715188/142‑1 (MQ=255) aGAAAACCAGTTGCTGCTCGACGACTCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGGTATGGCGGAACCGGGCGCTGAAGGCGAAGACt > 2:452587/1‑143 (MQ=255) aaCCAGTTGCTGCTCGACGACTCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGGTGGTGGTGTTCGATATGGCGGAACAGGGCGCTGAACGAGAAGCGTGccg > 1:324841/1‑142 (MQ=255) gaGTGGCTGAGCGACGACTGCGACAGCGCCAGGGTCGGTTCAAGGNCTGCGGCGGTCCAGGTAGTGGCTGAAGTGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGAGATGGCGGAACGGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGccccgc < 2:229400/142‑5 (MQ=255) ctgctCGACGACTCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTAAAATGCAGAGCAACCGAGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGt > 1:770717/1‑143 (MQ=255) tctCGACGGCTCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATGTGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTgg < 1:127473/142‑1 (MQ=255) ctCGACGACTCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACTGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCAGGTGCAGGAggg > 1:93331/1‑143 (MQ=255) gacgacTCCTACAACGCCAATGTCGGTACAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGAGGTGGGCGATGTGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGAGGGCGa > 2:785094/1‑143 (MQ=255) tCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCGGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGGGGGCGAggcggc > 1:227288/1‑143 (MQ=255) ggtccaCGCAAATGTCGAGTCAGTGATGGCAGCAAGCCATGTACTGGCTGAAAGGCCGGGCTAGCGCGTGGGGGGGGTGGGCGATATGGCGGGAGTGGGGGCTGAAAGCGAAGCCGGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCaa < 2:940064/138‑1 (MQ=255) tccaccGCCTATCTCGGTTCACTGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCTCGTGCTGGTGGTGGTCGATGTGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCaaa < 2:22619/138‑1 (MQ=255) caCAACGCCACTGCCGGTGCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTCGCTGAAATGCCGCGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATGTGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCaaa < 1:279458/142‑1 (MQ=255) caCAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCACTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATGTGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCaaa < 1:806822/142‑1 (MQ=255) gccaCGCCAAGGTCGCTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGTCTGAAATGCCAGGGGACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCaaaa < 2:345634/140‑1 (MQ=255) aaCGCCAAGGTCGGTTCAGTGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATGTGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAgc < 1:578046/143‑1 (MQ=255) cGCCAATGTCGGTTCAAGGACGGCAGCAGAGCAGGGACGGGCTGAAAGGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAgctg < 1:72269/143‑1 (MQ=255) aaTGCCGGTCCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACGGGCTGAAATGCCGGGCGACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTgg < 1:58501/143‑1 (MQ=255) tCGGTTGAATGCCTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTAtt < 1:479253/143‑1 (MQ=255) aCTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGGGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGtt > 1:296456/1‑143 (MQ=255) tGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTaa > 1:597173/1‑143 (MQ=255) ggcagcaGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTaa < 1:732684/142‑1 (MQ=255) cagTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCGGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTAAGCGTg < 1:849400/143‑1 (MQ=255) cagTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGCGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATGTGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTAAGCGTg < 1:627688/143‑1 (MQ=255) tCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATGTGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGCATTGACCGCGTGTTAAGCGTGGGt > 2:548237/1‑143 (MQ=255) aGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACAGCGGGTTAAGCGTGGGTaga > 2:192326/1‑141 (MQ=255) tGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATGTGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTAAGCGTGGGTAAACAAAGc > 2:277280/1‑143 (MQ=255) 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1:214938/1‑143 (MQ=255) ggCCACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTAAGCGTGGGTAAACAAAGCCATGCTATCAGCAc < 1:729771/143‑1 (MQ=255) gCTGCCGCGTTGTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCGGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTAAGCGTGGGTAAACAAAGCCATGCTATCAGCAcc < 2:770717/143‑1 (MQ=255) tACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTAAGCGTGGGTAAACAAAGCCAAGCTATCAGCACCGc > 2:347507/1‑143 (MQ=255) tggtggGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTAGAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTAAGCGTGGGTAAACAAAGCCATGCTCTCACCACCGCGACCGGCGTTCGc > 1:987926/1‑143 (MQ=255) | CCAGGCCGTCTGTTCCCCATCCAACTGGCAGAAAACCAGTTGCTGCTCGACGACTCCTACAACGCCAATGTCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTAAGCGTGGGTAAACAAAGCCATGCTATCAGCACCGCCAGCGGCGTTGGC > NC_000913/95589‑95861 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |