Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_000913	1196269	1211433	15165	10 [9]	[9] 10	[icd]–[icdC]	[icd],ymfD,ymfE,lit,intE,xisE,ymfH,ymfI,ymfJ,ymfK,ymfT,ymfL,ymfM,oweE,ymfN,aaaE,ymfR,beeE,jayE,ymfQ,ycfK,tfaP,tfaE,stfE,pinE,mcrA,[icdC]

CTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTA  >  NC_000913/1211410‑1211576                         |                                                                                                                                               atgaTGCTGCGCCCTATGGGTTGGACGGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTgg                          <  2:184955/140‑1 (MQ=255)     tgctgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCACGACCGTAACTTATGACTTCGAACGACTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGaa                      >  2:531216/1‑143 (MQ=255)     tgctgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGACGGCGCTAAGCAGAAGAAAGGTCCACAGTTTGGTGaa                      >  2:106379/1‑143 (MQ=18)        tgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTAAGAAATCGAATGTCTGATGGAAGGCACTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGATTGGTGAAggg                   >  2:77993/1‑141 (MQ=18)             cATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGatcat              <  1:210710/143‑1 (MQ=255)             cATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGatcat              <  2:611456/143‑1 (MQ=255)                aggggTAGGACGGAAGGGGGGGACCTGAGTGTTAAAGGTATGGAGGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGACATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGa           <  1:653448/141‑1 (MQ=255)                 tGGGTTGGACTGAATCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATTCCAAGACCGTAACTGATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGaa          <  2:528210/143‑1 (MQ=255)                     ttGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACa      <  1:429818/143‑1 (MQ=255)                         aCTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGCAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAATTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTa  >  1:671721/1‑143 (MQ=255)                         |                                                                                                                                               CTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTA  >  NC_000913/1211410‑1211576

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑