| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,959,515 | T→A | 6.8% | intergenic (+70/+17) | ilvC → / ← ppiC | ketol‑acid reductoisomerase (NADP(+))/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,959,515 | 0 | T | A | 6.8% | 211.1 / 6.5 | 78 | intergenic (+70/+17) | ilvC/ppiC | ketol‑acid reductoisomerase (NADP(+))/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/31); new base A (3/2); total (45/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.88e-01 | |||||||||||
TGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATCTGACCCTGGCG > NC_000913/3959373‑3959654 | tcttctcgAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGATAATTGCGAGCTGATGACCACAACCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAAGGCGAACACACCCAAGGCCTCCCCCt > 2:203186/8‑143 (MQ=255) gCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTg < 1:295964/143‑1 (MQ=255) cGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGGTGCGGGTTAAGGGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCGCTCCCACCGGGGGCGGGGGAAAACACGCAGGGCCTTCTCCTgg > 1:161512/1‑143 (MQ=255) tGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACCCTCAAGGCCTTCTCCTGtagac > 1:349754/1‑142 (MQ=255) gAGCAGCTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGGTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAg < 1:618673/143‑1 (MQ=255) aGCAGGTAGGTAAGATACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCGGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAgg < 2:256534/143‑1 (MQ=255) gCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAACCACGCAAGGCCTTCACCGGGAGAAGGc > 2:64213/1‑143 (MQ=255) gCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCCCCCGGCGAAGGc > 2:429652/1‑143 (MQ=255) cAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACGCAAGGCCTTCTCCAGGAGAAGGcc < 2:427937/143‑1 (MQ=255) agaggcggtaAGAAGCTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTGAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGcc < 2:71479/137‑1 (MQ=255) gtaggtaAGAAACTGCGTGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTg < 2:453092/143‑1 (MQ=255) gtaggtaAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGCGCGGGAGAAAACCCTCAAGGCCTTCTCCCGGCCACGGCCTTg > 2:313181/1‑143 (MQ=38) aggtaAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCt > 1:375174/1‑143 (MQ=255) gtaAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCCCACCCCGACCCCCTCCCACAGGGAGAGGGAGAGAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCATGCtgt > 1:519792/1‑141 (MQ=255) taAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCAGGAGAAGGCCTTgagtgt < 1:435327/143‑6 (MQ=255) aaGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTa < 1:406989/143‑1 (MQ=255) aaaCTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGGTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGTGCAGGCCTACCTATTGGtt > 1:537798/1‑143 (MQ=37) cgGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGCAACACCTGACAATGTCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACa < 1:464470/143‑1 (MQ=37) cgGCTATATGACAGAGATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCGCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTGCGCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACa < 1:678407/143‑1 (MQ=255) ggCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAg < 1:116962/143‑1 (MQ=255) cTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGATGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTCCTATTAGTTGCGGTACAGCa > 1:648043/1‑143 (MQ=255) tataTGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCAc < 1:666204/143‑1 (MQ=255) tGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAGGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTCGTTGCGGTACCGCCCCttc > 1:513992/1‑142 (MQ=255) tGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTa > 1:147627/1‑143 (MQ=255) gACAGCTATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACACGGAGAGAGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTaa < 2:270359/143‑1 (MQ=255) gACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCACGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTATCCTGGCGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTCCAGCActtcaa > 1:192523/1‑138 (MQ=38) gACAGAGATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTaa < 2:201905/143‑1 (MQ=255) ccAGATATGACACTTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAat < 2:577208/142‑1 (MQ=255) aCAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGCGGGCGAAAACACTCAAGGCCCAGAAGTGATCGATGCCCTGCTGTTAGTTGCGGTGCAGCACCTTAat > 2:139849/1‑143 (MQ=21) aCAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCGTTGCTATTAGTTGCGGTCCAGCAccctgat > 2:598183/1‑138 (MQ=255) aCAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAat < 1:540431/143‑1 (MQ=255) aCAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGAGCGCTGATGACCTCACCCCGACCCTCTCCCAGAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTAGTAGTTGCGGTACCGCAGCTTaag > 1:78979/1‑142 (MQ=255) aggtatGAAACGTCTTTCTTTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAatga < 2:582921/140‑1 (MQ=255) atatGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAatgatg > 1:344161/1‑143 (MQ=255) tatGACACGTATTGCTGCTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCGTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCACGGCCCTCCCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTACTTGCGGTCCAGCACCTTAATGAtgt < 2:521831/143‑1 (MQ=37) tatGAAGCGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGAtgt < 1:460671/143‑1 (MQ=255) aaaCGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGGAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTtata > 1:359534/1‑143 (MQ=255) aaaCGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGata > 1:474642/1‑143 (MQ=255) aaaCGTAGTGCTGTGGCGGGTGAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGata < 1:560750/143‑1 (MQ=255) tcttATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCTCGCTGATGCCCTCACCCCTCCCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATc < 2:512866/140‑1 (MQ=255) tATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCACGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCGTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGACGTGATATCCgc > 2:326397/1‑142 (MQ=255) tGCTCTTGCTGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACt < 1:336265/143‑1 (MQ=255) cTGTCGCGCGTTAAGGGCGCGCTGATGCCCTCGCCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACGCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTgg < 2:95986/143‑1 (MQ=38) gTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgt < 1:104496/143‑1 (MQ=255) tAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTCAATGAAGTGATATCCGAAATGGGGGTGCAGCgg > 1:638029/1‑143 (MQ=255) agggcgcgcTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACGGGGAGAGGGAGACAACCCTCCACGCCGTCTCTTGGAGAGGGCCTTGCTATTAGTGGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGc < 1:311873/140‑1 (MQ=37) gcgcgcTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCgg > 1:80106/1‑143 (MQ=255) gcTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCGGCGGGCCGGTCgg > 1:333688/1‑143 (MQ=255) tGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCCCCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGCGCAGCGGCCcggccggcg > 2:376453/1‑142 (MQ=255) tGCCCTCACGCCGACCCTCTCCCACAGGGCGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCGGGAGAGGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGccccc > 2:334333/1‑142 (MQ=255) cTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGATGGAGAAAACACTCAAGGCCTTATCCTGGAGACGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTAGAGCACCTTAATGCTGTGATATCCCAACTCGGTGTGCAGCGGGCCGGTCCGCTCCacaac > 2:598169/1‑139 (MQ=255) cTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCCCCAGTAc > 2:155624/1‑143 (MQ=255) tCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTAcc > 1:113448/1‑143 (MQ=255) ccccGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCACTACCGGa > 2:522976/1‑143 (MQ=255) cccGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGAc > 1:548376/1‑143 (MQ=255) gtcccTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAACACTCTCAAGGCCTTCTCCTGGAGACGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAag < 2:349754/141‑1 (MQ=255) tcccccACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGaaa > 1:471277/4‑143 (MQ=255) ctcCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGaaaa < 1:45057/143‑1 (MQ=255) ccACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCCGTAGAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCCCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCa > 2:433391/1‑143 (MQ=255) agggagagggagAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTGCCGCCCCAGAGAAAGCCACttt > 2:582635/1‑143 (MQ=255) ggagagggagaAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTAt > 1:348350/1‑143 (MQ=255) ggagagggagaAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTACTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTAt < 1:93214/143‑1 (MQ=255) ggagagggagaAAACACTCAACGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTAt < 1:513441/143‑1 (MQ=255) gagagggagaGAACGCTCACGGCCTGCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTCGTTGCGGGACAGCACCTTAATGACGTGATATCCGAGCTGGGTCTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATc < 1:530406/143‑1 (MQ=255) agggagaAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAGACCACTTTATCGaa > 1:275819/1‑143 (MQ=255) agaAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCGCCAGTACCGGACAAGAGCAAACCACTTTATCGAACGcc > 2:555123/1‑143 (MQ=255) aaaaCACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCgg > 1:651746/1‑143 (MQ=255) aaaCACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAAGAATTCACTGTATCGAACGCCGGa > 2:439339/1‑143 (MQ=255) aaCACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGCTGCGGTACAGCACCTTAATGACGGGATAGCCGAACTGGGTGTGCAGCGCGCCGGGCGGCTCCAGTACCGGACGAGAGAAAACGACGTTATCGAACGCCgcca > 2:198814/1‑140 (MQ=255) acacTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACAGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAAc > 1:164979/1‑143 (MQ=255) cAAGGCCTTCTCCAGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTACTGATGTGATATCCGAACTGGGGGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCGGTACCGGAAAAGAGAAAACCGCTCTGTCGAACGCCGGAACCAGCt > 2:434383/1‑143 (MQ=255) cAAGGCCTTCTCCAGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATCt > 1:551708/1‑143 (MQ=255) cAAGGCCGTCTCCAGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTCATGATGGGCTATCCGAACGGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGCAAACCACTTTCTCGAACGCCGGAAACctct > 2:274929/1‑143 (MQ=255) aaGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATCTCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCTGTACCGGACGAGAGAAAACCACGTTATCGAACGCCGGACACATCTg > 2:507687/1‑143 (MQ=255) ggtcgggctcCTGGAGAAGGCCTTGCTAGTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATCTGa < 1:244429/136‑1 (MQ=255) ttCTCCTGGGTGACGCGTTGCTGTCAGCTGCGGTTCAGCCCCTTACTGATACGATATAAGATTTGGTTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATCTGACCCTg < 2:587988/143‑1 (MQ=255) tctcCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATCTGACCCTgg < 1:563337/143‑1 (MQ=255) tcCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTCTCGACCGCCGGGACCATCTGACGCTGGCg > 1:137090/1‑143 (MQ=255) tcCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATCTGACCCTGGCg > 1:113709/1‑143 (MQ=255) | TGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGAACGCCGGAACCATCTGACCCTGGCG > NC_000913/3959373‑3959654 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |