| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,323,426 | T→C | 15.9% | K309K (AAA→AAG) | phnD ← | phosphonate ABC transporter periplasmic binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,323,426 | 0 | T | C | 15.9% | 135.4 / 3.0 | 69 | K309K (AAA→AAG) | phnD | phosphonate ABC transporter periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (24/32); new base C (11/2); total (35/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.18e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGCCTGCACATTGTCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCGCCCAGCCCAGGCGTTCCAGCACC > NC_000913/4323285‑4323567 | cGCCTGCACATTGTCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGACTCTCGGTGGttt > 2:600773/1‑143 (MQ=255) tcggcccaTTGGCGGCTGCGACGCCGGGGCGTCGTGGGCGGCGTGCGCGGTGCGGCACCGCTGTGCTCAGCGAACTCCTCGCGCTTAGCGCGTCGTTCAGGCGGTCCAGGTCGTGCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGttttt < 2:450089/137‑1 (MQ=255) ccggCACATTGCCGGAATCGACGCCGGGACGTCGTATGAGGCCTAGGCGTTACGGCACCGCCTTACTCATCGAGCTCACCGCGCTTAGCGCACCGATCAGGTGGTGCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGttttt < 2:642262/140‑1 (MQ=255) cTGCACATTGTCGGATGCGACGCCGGTGCGTCTTATCCGGCCTACGATGTACTGCACCGCTTTGCTCACCGAGCTCCTCCCTCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTg < 1:607933/143‑1 (MQ=255) cacaTTGTCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCGCGGTGGTTTTTGCCa > 2:498817/1‑143 (MQ=255) tCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGCCCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTc < 1:468958/143‑1 (MQ=255) ccGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTc < 1:303458/142‑1 (MQ=255) gATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTg < 2:24496/143‑1 (MQ=255) aTGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGc > 1:55203/1‑143 (MQ=255) gACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCAt > 2:107716/1‑143 (MQ=255) aCGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCAtt < 1:564936/143‑1 (MQ=255) ttctCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTg < 1:71084/140‑1 (MQ=255) gtATCCGACCTACGACTTACTGCACCGCTTTAGCCAGGTAACTCTTCGCGCTTATCTCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTg < 2:486215/142‑1 (MQ=255) tCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCTTTGCCAGCTTGTCGTCCTCATTCAGTCGTTTCTTGCtt > 2:170326/1‑143 (MQ=255) tCCGACCTAAGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCCTTCAGTCCTTTGTTGCtt > 1:413496/1‑143 (MQ=255) ccGCCCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCttt < 1:370002/143‑1 (MQ=255) cGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCtttt > 2:332299/1‑143 (MQ=255) gACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCATTTATTGCCTTTc > 2:217370/1‑143 (MQ=255) tACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGc < 1:655095/143‑1 (MQ=255) tACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTCGCCACCTTAACCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCgcgc > 2:28223/1‑143 (MQ=255) tACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCGCCGCAAGCTTATCATGCTCATTCAGTCCTTTCTAGCTTTTCACGc > 2:63500/1‑143 (MQ=255) aCGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGcc < 1:170629/143‑1 (MQ=255) aTTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTg < 1:175929/143‑1 (MQ=255) tttACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTCTTGAATGATGCGTCGCCTCCTTCAATCCCTGGTTGCTTTTCACGCCCTGc > 1:490934/1‑143 (MQ=255) ttccgCACCACTTTACACACCGTACTGAACGCGTGTAGATCGTTGTCCAGGCGGTCTAGGTCATCCAGCTGCTCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCAt < 2:193236/139‑1 (MQ=255) cTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCGCCGTCTGATTGTCCTGCACAGTCAGTCCTTTATTGCTTTCAACTCCCTGCctct > 2:103951/1‑143 (MQ=255) aCCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCttt < 1:429860/143‑1 (MQ=255) aCCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCttt < 1:173240/143‑1 (MQ=255) aCCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTAACGCCCTGCATCTCttt > 1:109082/1‑143 (MQ=255) cGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTGAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTaa < 1:163007/143‑1 (MQ=255) aCCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCTGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTTAACAGCTCGAg > 1:135182/1‑143 (MQ=255) aCCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAg > 1:454030/1‑143 (MQ=255) aaCTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTgg < 1:612326/143‑1 (MQ=255) aaCTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGGCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTgg < 1:457990/143‑1 (MQ=255) aTCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAAt > 1:109737/1‑143 (MQ=255) aTCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAAt > 1:434745/1‑143 (MQ=255) aTCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAAt > 1:224576/1‑143 (MQ=255) aTCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCTTTGTCAGCTTGTCATGCTCATTCCGTCCTTTGTTGCGTTTCCCGCCCTGCATCACTTTAAAAAGCGCGAGCTgggcgaa > 2:338779/1‑138 (MQ=255) gcTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCa < 1:196908/143‑1 (MQ=255) cTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCAc < 1:72240/143‑1 (MQ=255) cTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCAc < 1:258774/143‑1 (MQ=255) ttAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTAATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTACAGATCATTCAGTGCTTTATTGCTTTTCTCGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCAAATCGGccac > 2:536711/1‑140 (MQ=255) cgcgTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCGCTGCCTCCTTGTCCAGCTAATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCCAGCGGTCGACTAGGCAGCAGtc > 2:24753/1‑142 (MQ=255) cgcgTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAAGCGCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCGTGCTCAATGAGTCATTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTAGCGGATCGGCACCAGtg > 1:482701/1‑142 (MQ=255) tctttgtgCAGGCGGTGCAGGTCATCCAGCTGCGCCGGCATCTCGGTGGGTTTTGCCAGCTTGTCGAGATGATTCAGGCCTTTCTTGCTTCTCACGCCCTGCATCTCTTTGAGCAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTg < 2:80890/140‑1 (MQ=255) gcgTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCTTCGTCAGCTTGAACTACACATTCAATCCTCTCTTGCTTTTCACTCCCTGCATCTCTTCAACCACCCCCACCAGGCTACTCGccaccacatg > 2:521008/1‑139 (MQ=255) ttgttCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAg < 1:599750/143‑1 (MQ=255) ttgttCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTGTCGCCAGCTTATACTGCTCATGCAGTCCTTTATTGCTGTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAAGCGGCGCCAGTTGCAg > 2:150989/1‑143 (MQ=255) tCAGGCGGTCCAGGTCACCCAGCTGCCCCTTAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCGTTATTGCGTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCg < 1:21101/143‑1 (MQ=255) cAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGc > 1:589325/1‑143 (MQ=255) cggCGGTGCAGGTCATCCCGCCGCGCCGGAATCTCGGTGGTTGTTGCCGGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCGGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCt < 2:166182/142‑1 (MQ=255) ggCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTg < 1:416569/143‑1 (MQ=255) gTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCGCTGCCACCTTCAACGACTCATTCAGTCATTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCGGGCGAATCCGCACCAGTACCAGGCCGCTGGAAg > 2:533276/1‑143 (MQ=255) tCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCTTTGCCTGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGACTCGGCACCAGTTGCCACTCGATGGAAgc > 2:358192/1‑143 (MQ=255) tCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCGCCGCCACCTTGACCTGCACATTCAGTCCTTCATTGCTTTTCACGCCCGGCATCTCTCTAAACAGCGCGAGCTGGCAACTCGGCACCAGTTGCACGCCGCTgcacgc > 2:191003/1‑138 (MQ=255) aGGTCCTGCAGCCGTGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTCGTCCTGCTCACTCGGTCCTTTCTTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTCCACAGCGCGCGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGcgcg < 2:111609/143‑1 (MQ=255) aGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTGTTGCAAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAACTGGCGAATCGGCACCACTTGCAGTGCGCTGGAcgcgcg > 2:541034/1‑143 (MQ=255) aGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCGTTGCCAGCTTGTCCTGCACATTCAGTCCTGTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCCCCAGTTGCAGGTCGCTGGAcgcgcg > 2:73413/1‑143 (MQ=255) gTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGa < 1:547003/143‑1 (MQ=255) tCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTCGCCGCCACCTTGACCTGCACATTCCGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGaa > 2:57924/1‑143 (MQ=255) aTCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTATTGTCACCTTGTCCACAACATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCCACCTAGCTAATTGGCACCAGTTGCAGGACACCGGAACCGCGGAAta > 2:373093/1‑142 (MQ=255) cAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCCGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGgcg > 1:571454/1‑143 (MQ=255) aGCTGCGCCTGAATCCCGGTGGTTCTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGGCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGgcgc < 2:134080/143‑1 (MQ=255) cTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCgccc > 1:75078/1‑143 (MQ=255) tggcccTGATTCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCgccca < 2:577053/139‑1 (MQ=255) tGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCgccca < 1:498817/143‑1 (MQ=255) cTGAATCTCGGTGGTTTTCGCAACCTTAACCAGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCgcacagcaca > 2:541350/1‑143 (MQ=255) gctcGGTGGTCTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCGCCCAGCCCAGGCGt < 1:68652/142‑1 (MQ=255) ttcgtggtCTTCCCCAGCTTGTCCTCCTCCTTCCTCCCTTGATTCCTTGTCACGCCCTGCCTCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCCGGTCTCTGGAAGCGCGGAATGGCGCCCAGCCCAGGCGTTc < 2:85740/140‑1 (MQ=255) tcGGTGGTTGTTGCCTGCTTGAACTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCTTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGACTCGGCCCCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCGCCCCGCCCTGGCgcgc > 2:351715/1‑140 (MQ=255) gtggtTTTCTCCAGCTTGGCCTGCTCATTCAGTCCTGTATTGCTCTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCGCCCAGCCCAGGCGTTCCAg < 2:398167/143‑1 (MQ=255) ggtTCTTGCCAGCTTGTCCTGCCCCGGCAGGCCGTTATCGCCGTTCACGCCCTGCCTCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAAGGGCGCCCAGCCCAGGCGTTCCAGCa < 2:177950/143‑1 (MQ=255) tttttGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAACGGCGCCCCGGCCAGCCGTTCCAGcccc > 2:52076/1‑143 (MQ=255) | CGCCTGCACATTGTCGGATGCGACGCCGGGGCGTCTTATCCGACCTACGATTTACTGCACCGCTTTACTCACCGAACTCATCGCGCTTAGCGCGTTGTTCAGGCGGTCCAGGTCATCCAGCTGCGCCTGAATCTCGGTGGTTTTTGCCAGCTTGTCCTGCTCATTCAGTCCTTTATTGCTTTTCACGCCCTGCATCTCTTTAAACAGCGCGAGCTGGCGAATCGGCACCAGTTGCAGGTCGCTGGAAGCGCGGAATGGCGCCCAGCCCAGGCGTTCCAGCACC > NC_000913/4323285‑4323567 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |