Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_000913	1196245	1211458	15214	27 [25]	[25] 26	[icd]–[icdC]	[icd],ymfD,ymfE,lit,intE,xisE,ymfH,ymfI,ymfJ,ymfK,ymfT,ymfL,ymfM,oweE,ymfN,aaaE,ymfR,beeE,jayE,ymfQ,ycfK,tfaP,tfaE,stfE,pinE,mcrA,[icdC]

TAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAA  >  NC_000913/1211407‑1211601                                                     |                                                                                                                                               gagatgaTGCTGCGCCAGAGGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGGCCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGtt                                                      <  2:369726/137‑1 (MQ=17)     tgaTGCTGCGCCATATGGGTTGGGCTGAAGCGGCTGCCCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGt                                                  <  2:303782/141‑1 (MQ=255)     tgaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGt                                                  >  1:551816/3‑143 (MQ=255)      gaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGCTCAGAGTTTGGTg                                                 >  2:1224496/2‑143 (MQ=255)        tgcggcGCCAGATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGaa                                               <  2:630091/143‑1 (MQ=255)        tgcgccgcCATATGGCTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGaa                                               <  1:88857/138‑1 (MQ=255)           tgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCg                                            >  1:1145359/1‑143 (MQ=255)            gcgcCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGa                                           >  1:712440/1‑143 (MQ=255)             cgcCATATGGTTTGGACTGACGCCGCTGCCCGTGTTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAAGCGATGCCAAGTCCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAACGTTCGGAGTTTGGTGAAGCGat                                          <  2:1089744/143‑1 (MQ=18)                     gggTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATAACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTACTGAAATCATCAGAGCTTGATGAAGCGATCATCGaca                                  >  2:892853/1‑141 (MQ=18)                      ggTTGGACTGAAGCGTCTTACCGGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTCTGCCATCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGaaaa                                 <  1:780767/143‑1 (MQ=18)                          ggACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATg                             >  2:940276/1‑143 (MQ=255)                             cTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTaa                          >  1:922054/1‑143 (MQ=255)                              tGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGTAGCGATCATCGAAAACATGTAAt                         >  1:137760/1‑143 (MQ=255)                              tGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAt                         >  1:135359/1‑143 (MQ=255)                                   cGGCTGACCTGATTGTTAAAGGAATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTAAGAATCCGAACGTCTGATGGAAGGAGATAAGATGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAAAAAAAAAAAAAAACATGTAAtctctc                    <  2:743664/143‑1 (MQ=17)                                    ggCTGACCTGATTGTTGAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCCCTcc                   <  2:1160305/143‑1 (MQ=255)                                      cTGACCTGTTTGTTAAAGGGATGGAAGTCGCAATTGGTGCCAAGACCCTAACTTATGACTTCGAACGTCCGATGGAAGGCTCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAt                 <  2:871429/143‑1 (MQ=18)                                      cTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAt                 <  1:322072/143‑1 (MQ=255)                                      cTGACCTGAGTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAt                 <  1:584204/143‑1 (MQ=255)                                           cTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGtt            >  1:943398/1‑143 (MQ=255)                                           cTGATTGGTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGtt            <  1:349812/143‑1 (MQ=255)                                              aTTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTaaa         <  2:522953/143‑1 (MQ=255)                                              aTTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTaaa         >  2:777811/1‑143 (MQ=255)                                                  ttAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATCTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATAtt     <  2:616624/143‑1 (MQ=255)                                                     aaGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGaa  <  2:56348/143‑1 (MQ=255)                                                     |                                                                                                                                               TAACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAA  >  NC_000913/1211407‑1211601

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑