| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2727891 = | NA (NA) | 9 (0.140) | 7/252 | NT | NA | noncoding (1294/2904 nt) | rrlG | 23S ribosomal RNA |
| ? | NC_000913 | 2727910 = | NA (NA) | noncoding (1275/2904 nt) | rrlG | 23S ribosomal RNA | |||||
ATGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2728038‑2727891‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccgctTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGT > NC_000913/2727910‑2728051 agGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCGTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGC < 1:1174645/141‑1ATGCACCGAAGCTTCGGCAGCGACGCTGATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGGAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGC < 1:447792/143‑1ATGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGCAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGGAGTGCGAATGCTGACATAAGCAACGATAAAGCGGGTGAACAGC > 2:370310/1‑143ATGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAGAAGC > 1:213172/1‑143ATGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGC < 2:467066/143‑1 tacaaCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTACTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGAGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGGGAAACGCC > 2:522548/6‑143 TGCATCGAAGCTGCGGCTGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTGGGTGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGCGACCTGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCC < 2:967998/143‑1 TGCACCGACGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGCGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCC < 1:10888/143‑1 TGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCC > 1:92261/1‑143 TGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCC < 1:699465/143‑1 GCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCC > 2:499412/1‑143 GCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGCGAAAAGCCC > 2:1000858/1‑143 GCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCCTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCC < 2:720749/143‑1 cgCCGAAGCGGCGGCAGCGACGCTTCTGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGACGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCG < 2:286434/141‑1 CACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTAGGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCG < 1:277318/143‑1 ACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGTGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGC > 1:1045260/1‑143 ACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGGTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATACGTAACGATAAAGCGGGTCAAAAGCCCGC > 1:883460/1‑143 ACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGC > 2:429135/1‑143 ACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGC > 1:300701/1‑143 ACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGC > 2:256458/1‑143 ACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGGGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAGGCCCGC > 1:480789/1‑143 ACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGCGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATACGTAACGATAAAGCGGGGGAAGAGCCCGa > 2:148654/1‑142 CCGAAGCTGCGGCAGCGACGGGTTTGCGGTGGGGGGTAGGGCAGCGGCCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGCGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCT < 2:75463/143‑1 CCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCT > 1:102708/1‑143 GAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACTTCCAGCATGCCTCCCAGCGCACCTTCGCGGGCTTTCAAAACGCTCCCCTACTCAAGAACtta > 1:849991/1‑140 TGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATACGCG > 1:396437/1‑143 GATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCCGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACACCGCATACGCGTCGCTGCCGCAGC > 1:201341/1‑143 GATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGC > 1:820263/1‑143 ATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCT > 2:323036/1‑143 TAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTTCAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTT > 2:999156/1‑143 AGCGGGTGAAAAGCCCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACACCGCATGAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGG > 1:768967/1‑143 AGCGGGTGAAAAGCCCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGG > 1:832058/1‑143 GGGTGAAAAGCCCGCTTTATCGATACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGAATCACACCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGAGCCGCAACCGCAGCTTCGGTGC > 2:527980/1‑143 tccCCCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTT < 1:921889/140‑1 cCCCGCTTTATCGTTACTCATGTCAGCATTCGCACTTCGGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAG < 2:381434/142‑1 CCCGCTTTATCTTGACTTATGTCAGCATTCGCCCTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTGCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGC < 2:1251959/143‑1 CCCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCCGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATCAGCGTCGCTGCCGCAGCTGCGGCGCAGGGTTTAGC > 2:91496/1‑143 CCCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGC > 1:328615/1‑143 CCCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGATCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCAGCGTTTAGC > 2:294428/1‑143 CCCGCTTTATCGGGACTCAGGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGC < 1:168043/143‑1 CCCGCTTCATCGCTACTTATGTCAGCCGGCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTAGAGAACGCTCCACTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGCTTAGC < 1:365501/143‑1 CCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGCTACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACACCGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCGTGGTTTAGCC > 1:750661/1‑143 CCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACTTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCTCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCAAACAACGCATAAGCATAGCTGCAGCAGCTTCTGTGCATAGTTTAtca > 2:149869/1‑140 CCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTCCGGTGCATGGTTTAGCC > 2:1057873/1‑143 CCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCATACAGAACGCTCCCCTACCCACCAACGCATAAGAGTCCCTGCCGCAGCTTCGCTCCATGGCTTAGCC > 2:789430/1‑143 CCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGACGGCTTACAGATCGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCGGCTTCGGTGCCTGGTTTtggc > 1:116319/1‑139 CCGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTGCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCC < 2:922292/143‑1 CGCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCGTCGGTGCATGGTCTCGCCC > 1:177462/1‑143 GCTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCC > 1:512715/1‑143 GCTTTATCGTTACTTATGGCAGCATGCGCACTGCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCC < 1:484725/143‑1 CTTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCG > 1:976941/1‑143 TTTCTCGTTACTTATGGCAGCAACAGCGCTACTGATACCTCCAGCACGCCTCACAGCACACCTTCCCAGGCTTACAGACCGTGCCCCTATCCTACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGT < 2:350287/143‑1 TTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGT < 1:297347/143‑1 TTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGT < 1:64769/143‑1 TTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCCCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTGCGGTGCAGGGTTTAGCCCCct > 2:5835/1‑141 TTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTGCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGT < 1:342474/143‑1 ATGCACCGAAGCTGCGGCAGCGACGCTTATGCGTTGTTGGGTAGGGGAGCGTTCTGTAAGCCTGCGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2728038‑2727891‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccgctTTATCGTTACTTATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCGCAGGCTTACAGAACGCTCCCCTACCCAACAACGCATAAGCGTCGCTGCCGCAGCTTCGGTGCATGGTTTAGCCCCGT > NC_000913/2727910‑2728051 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |