| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 4332085 = | 127 (1.910) | 6 (0.100) | 5/244 | NT | 5.1% | intergenic (+81/‑31) | proP/pmrR | osmolyte:H(+) symporter ProP/putative bitopic inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 4332113 = | 108 (1.760) | intergenic (+109/‑3) | proP/pmrR | osmolyte:H(+) symporter ProP/putative bitopic inner membrane protein | |||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
GTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGAC‑GCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCG > NC_000913/4331975‑4332252 | gTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCTAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGAC‑GCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGG‑ACGAGAGTGCAAt > 2:86699/1‑143 (MQ=255)gTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGAC‑GCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGG‑AGGAGAGTGCAAt > 2:282074/1‑143 (MQ=255)gTGCAACAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGAC‑GCGAATACTCTCCGCCAGGAGAACGG‑AGGAGAGTGCaag > 2:175827/1‑142 (MQ=255)ctGCCGCAACATCCGGCAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGTTGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTCAACTCTTCAGGTTCACTTAATCTCTGAC‑GCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGG‑AGGAGAGTGCAAt < 2:642754/142‑1 (MQ=255) 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> 1:343948‑M2/30‑143 (MQ=255) TCTCCTCCAGGTTAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGGAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGgcg < 1:652802‑M1/143‑2 (MQ=255) TCTCCTCCAGGTTAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCTGCCCTACccagccc < 2:499011‑M1/143‑4 (MQ=255) TCTCCTCCAGGTTAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGgcg < 1:308707‑M1/143‑2 (MQ=255) TCTCCTCCAGGTTAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGcc < 1:1017594‑M1/143‑1 (MQ=255) TCTCCTCCAGGTTAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTCTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACCTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGcc < 2:513422‑M1/143‑1 (MQ=255) tctcctccgttaacctggaggagagtGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGCGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGcc > 2:298255‑M2/27‑143 (MQ=255) TCCTCCAGGTTAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTAGCTTGAACCCTACTGATCTTTCTTCAGCCGCACCCCGGCCcg < 2:899390‑M1/143‑1 (MQ=255) TCCTCCAGGTTAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCGGGCGCCCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCGCGGCCcg < 2:902994‑M1/143‑1 (MQ=255) CTCCAGGTTAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGcgcgcg < 1:330224‑M1/143‑1 (MQ=255) ctccgttaacctggaggagagtGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGt > 2:411007‑M2/23‑49 (MQ=255) cCCAGGTCAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGt < 1:299069‑M1/142‑1 (MQ=255) CCAGGTTAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTGTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCATCTGTCGCCAGGTCCGCGTg < 1:19245‑M1/143‑1 (MQ=255) CCAGGTTAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCGTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTg < 1:461667‑M1/143‑1 (MQ=255) CAGGTTAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCCTGc < 2:725196‑M1/143‑1 (MQ=255) gTTAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGGCCGCGTGCCgg > 2:799519/1‑143 (MQ=255) gTTAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGGCgg > 1:220869/1‑143 (MQ=255) gaaCGG‑GGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGaa < 1:545122/142‑1 (MQ=255) gaggagagtGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGtctc > 1:738229‑M2/10‑143 (MQ=255) gatagtGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAACGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTCGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTg < 1:535913‑M2/137‑1 (MQ=255) gagagtGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTAATGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGGGCCGGAAGGCCCTTg > 1:929734‑M2/7‑143 (MQ=255) | GTGCAGCAACATCCGCGAATTGATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGAC‑GCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGG‑AGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGCAGCTTTCTTTATATCTGGTTTGCCACGTACTGATCTTTCTTCAGCCGTACCCAGGCCCGCGTGCCGGAAGTCTCTTGCCG > NC_000913/4331975‑4332252 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |