| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,439,845 | 0 | T | A | 5.9% | 399.6 / 12.9 | 136 | intergenic (+52/+27) | ytfK/ytfL | DUF1107 domain‑containing protein YtfK/putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (73/53); new base A (5/3); total (79/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
TCTTATCCCAAAAGTGAAGGATAAGCTGCATTTGTCAGTGATGTCCGAAGTTAACCGTCAGGTTATGCGTCTGCAAACAGAGATGGCTTAACCAAAGTGCTATGCAGTAAAAAGTGCTATGCAGTAATAAGACGGCTCCTGAT‑TCAGGAGCCGTTGATGTTTCTGGGGGTTACGCGACGCTTTCTTCTTTATCTTTAGCGTCAGGCAGTTTTGGCGAAAGGGCGGTGGCCTTGCTGTCGATCCGGGTCACCAGCAGCTGGTCGATGCGGTAGTTATCGATAT > NC_000913/4439703‑4439984 | tCTTATCCCAAAAGTGAAGGATAAGCTGCATTTGTCAGTGATGTCCGAAGTTAACCGTCAGGTTATGCGTCTGCAAACAGAGATGGCTTAACCAAAGTGCTATGCAGTAAAAAGTGCTATGCAGTAATAAGACGGCTCCTGAt > 1:662424/1‑143 (MQ=255)tCTTATCCCAAAAGTGAAGGATAAGCTGCATTTGTCAGTGATGTCCGAAGTTAACCGTCAGGTTATGCGTCTGCAAACAGAGATGGCTTAACCAAAGTGCTATGCAGTAAAAAGTGCTATGCAGGAATAAGACGGCTCCTGAt > 2:7564/1‑143 (MQ=255) tATCCCAAAAGTGAAGGATAAGCTGCATTTGTCAGTGATGTCCGAAGTTAACCGTCAGGTTATGCGTCCGCAAACAGAGATGGCTTAACCAAAGTGCTATGCAGTAAAAAGTGCTATGCAGTAATAAGACGGCTCCTGAT‑TCa < 1:670922/143‑1 (MQ=255) aTCCCAAAAGTGAAGGATAAGCTGCATTTGTCAGTGATGTCCGAAGTTAACCGTCAGGTTATGCGTCTGCAAACAGAGATGGCTTAACCAAAGTGCTATGCAGTAAAAAGTGCTATGCAGTAATAAGACGGCTCCTGAT‑TCAg < 2:34004/143‑1 (MQ=255) 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< 1:158991/143‑1 (MQ=255) aagtgctatgcagtaaTAAGACGGCTCCTGAT‑TCAGGAGCCGTTGATGTATCTGGGGGTTACGCGACGCGTTGTTCTTTATCTTTAGCGTCGGGCAGATATGGCGCAAGGGCGGTGGCCTTGCTGTCGATCCGGGGCagcagc > 2:902993/1‑143 (MQ=255) tatgcagtaaTAAGACGGCTCCTGAT‑TCAGGAGCCGTTGATGTTTCTGGGGGTTACGCGACGCTTTCTTCTTTATCTTTAGCGTCAGGCAGTTTTGGCGAAAGGGCGGTGGCCTTGCTGTCGATCCGGGTCACCGGCAGCTgg > 1:263349/1‑143 (MQ=255) atgcagtaaTCCGCCGGCTCCTGAT‑TCAGGAGCCGTTGATGTTTCTGGGGGTTACGCGACGCTTTCTTCTTTATCTTTAGCGTCAGGCAGTTTTGGCGAAAGGGCGGTGGCCTTGCTGTCGATCCGGGTCACCAGCAGCTGGt < 1:1089330/143‑1 (MQ=255) atgcagtaaTAAGACGGCTCCTGAT‑TCAGGAGCCGTTGATGTTTCTGGGGGTTACGCGACGCTTTCTTCTTTATCTTTAGCGTCAGGCAGTTTTGGCGAAAGGGCGGTGGCCTTGCTGTCGATCCGGGTCACCAGCAGCTGGt > 1:684651/1‑143 (MQ=255) tgcagtaaTAAGACGGCTCCTGAT‑TCAGGAGCCGTTGATGTTTCTGGGGGTTACGCGACGCTTTCTTCTTTATCTTTAGCGTCAGGCAGTTTTGGCGAAAGGGCGGTGGCCTTGCTGTCGATCCGGGTCACCAGCAGCTGGTc < 2:111077/143‑1 (MQ=255) 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< 2:314564/142‑1 (MQ=255) tcaaCGGCTCCTGAA‑TCAGGAGCCGTTGATGTTTCTGGGGGTTACGCGACGCTTTCTTCTTTATCTTTAGCGTCAGGAAGTCTTGGCGAAAGGGCGGTGGCCTTGCTGTGGCTCCGGGTCCCCATCAGCTGGTCGATGCggga > 2:1185416/4‑141 (MQ=255) aaGACTGCTCCTGAT‑TCGGGAGCCGTAGATAACGCGGTGGGTTACGCGAGGCTTTCGTCTTTATCTTTAGCGTCAGGCAGTTTTGGCGAAAGGGCGGTGGCCTTGCTGTCGATCCGGGTCACCAGCAGCTGGTCGATGCGGTa < 2:1175926/143‑1 (MQ=255) aaGACGGCTCCTGAT‑TCAGGAGCCGTTGATGTTTCTGGGGGTTACGCGACGCTTTCTTCTTTATCTTTAGCGTCAGGCAGTTTTGGCGAAAGGGCGGTGGCCTTGCTGTCGATCCGGGTCACCAGCAGCTGGTCGATGCGGTa > 1:658495/1‑143 (MQ=255) aGACGGCTCCTGAT‑TCAGGAGCCGTTGATGTTTCTGGGGGTTACGCGACGCTTTCTTCTTTATCTTTAGCGTCAGGCAGTTTTGGCGAAAGGGCGGTGGCCTTGCTGTCGATCCGGGTCACCAGCAGCTGGTCGATGCGGTAg > 2:633032/1‑143 (MQ=255) gACGGCTCCTGAT‑TCAGGAGCCGTTGATGTTTCTGGGGGTTACGCGACGCTTTCTTCTTTATGTTTAGCGTCAGGCGGTTTTGGCGAAAGGGCGGTGGCCTTGGTGTCGGTGCGGGTCACCAGCGGGTGGTCGCGGCGGTAgg > 2:403399/1‑142 (MQ=255) 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1:1170774/143‑1 (MQ=255) cTGAT‑TCAGGAGCCGTTGATGTTTCTGGGGGTTACGCGACGCTTTCTTCTTTATCTTTAGCGTCAGGCAGTTTTGGCGACAGGGCGGTGGCCTTGCTGTCGATCCGGGTCACCAGCAGCTGGTCGCTGCGGTAGTTATCGatc > 1:632967/1‑142 (MQ=255) tGAT‑TCAGGAGCCGTTGATGTTTCTGGGGGTTACGCGACGCTTTCTTCTTTATCTTTAGCGTCAGGCAGTTTTGGCCACAGGCCGGTGGCCTTGCTGTCGATCCGGGTCCCCCGCCGCTCGTCCACGCGGCAGCTCTCCatat > 2:964230/1‑143 (MQ=255) | TCTTATCCCAAAAGTGAAGGATAAGCTGCATTTGTCAGTGATGTCCGAAGTTAACCGTCAGGTTATGCGTCTGCAAACAGAGATGGCTTAACCAAAGTGCTATGCAGTAAAAAGTGCTATGCAGTAATAAGACGGCTCCTGAT‑TCAGGAGCCGTTGATGTTTCTGGGGGTTACGCGACGCTTTCTTCTTTATCTTTAGCGTCAGGCAGTTTTGGCGAAAGGGCGGTGGCCTTGCTGTCGATCCGGGTCACCAGCAGCTGGTCGATGCGGTAGTTATCGATAT > NC_000913/4439703‑4439984 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |