| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,570,669 | T→C | 8.8% | Q459Q (CAA→CAG) | gadB ← | glutamate decarboxylase B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,570,669 | 0 | T | C | 8.8% | 145.8 / 4.9 | 64 | Q459Q (CAA→CAG) | gadB | glutamate decarboxylase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (25/31); new base C (3/3); total (29/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
CCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGC > NC_000913/1570527‑1570811 | ccTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGctgttctgt > 2:464358/1‑143 (MQ=255) cTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGctgttctgtt < 1:941691/143‑1 (MQ=255) tGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTg > 1:43570/1‑143 (MQ=255) tGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTg > 1:1123168/1‑143 (MQ=255) gTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACGCCGCTACCGTTCAACGTTCTCAGGCAGGTGTAAAGCTGGTCCCTTgg > 2:331094/1‑143 (MQ=255) ttttGTTCTGAAGCTTATTCAGAACATTATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTTAACATTCTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACAGCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTggg < 1:12527/143‑1 (MQ=255) ttttGTTCGGAACCTTATTGAGAACTATCTTTGCCGTTCCCAATGCGAGTGAACAGACTTTGGAGGTTTGCCCGAAACGGGTTCGTTTCGTGACACCGTTATCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTggg < 2:343691/143‑1 (MQ=255) tGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGGACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACGGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGGTGACAGCGGTTCTGTTGGGCaa > 2:923021/1‑143 (MQ=255) ttCTGAAGCGTATTCCGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATa < 1:743509/143‑1 (MQ=255) tGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATAccc > 1:501470/1‑143 (MQ=255) gAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTACCAGGTATGTTTAACGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCt > 2:1003520/1‑143 (MQ=255) aggCGTACTCAGAAGCAGAGTTTCGGTTGCTCGCGCCACTGAGCGGGCGTTGGAAATTGTCCCGAAGCGGGTGCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTg < 2:959308/141‑1 (MQ=255) aaGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGCAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGCGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGGATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTg > 1:174901/1‑143 (MQ=255) gCGTATTCAGAACAAGGTTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCa < 2:517062/143‑1 (MQ=255) cGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATAACCTGCAg > 1:851952/1‑143 (MQ=255) ttCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACATAGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACCCTGTTACCGTTCAACGCTATAAGGTATGTTTAACGCCGTTCCGCTGGGCAATAGCATGCGGTGTc > 2:896966/1‑143 (MQ=255) tCAGAACAATATTTTCCGTTGCGAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCg < 1:1279899/143‑1 (MQ=255) cAGAAAAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCgg < 2:1124334/143‑1 (MQ=255) aGAACGATATTTTGCGTGGCTAGGGGCCGTGGACAGAGTCGGGGCATTGTCCCGAAACGGGTGCGTTTCGGGACACCGGGACCGTTATACGTTTTCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCGGCAGTTTCggg < 2:1243377/143‑1 (MQ=255) cagtagtttCCGTTGCGAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGAt < 2:1050912/137‑1 (MQ=255) cAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGAt > 2:526114/1‑143 (MQ=255) cAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGAt > 2:1201540/1‑143 (MQ=255) ttttCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAATCAAATTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTg < 1:238060/143‑1 (MQ=255) tgtCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTga < 1:267388/141‑1 (MQ=255) ttCCGTTGCTAACGCCAGTGAACAGACTGTGGCAATTGTCCCCAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTgag < 1:329735/143‑1 (MQ=255) tCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTgaga < 1:464358/143‑1 (MQ=255) aacataacgttgtaaaaaccgaatgcccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggtttttacaacgttatGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTc < 2:169504‑M1/71‑1 (MQ=255) aacataacgttgtaaaaaccgaatgcccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggtttttacaacgttatGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTc < 2:796724‑M1/71‑1 (MQ=255) tAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACGGGTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTGCAg > 1:734324/1‑143 (MQ=255) gTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTGAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGGAATACCCTGCAGTTTCGAGTCATCGCTGAGATATTTCACGGAGGcct > 2:149977/1‑141 (MQ=255) tGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTCAGCTCTTTCCGGGCGGCttt > 1:372828/1‑143 (MQ=37) aCAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTa < 2:919465/143‑1 (MQ=255) aGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTCTGTTTAAAGCTGTTCTGTTAGGCACTACCCTGCAGTTCCGGGTGATGACTGACATAATTCAGGGAGGCtgggaagc > 2:328610/1‑136 (MQ=255) gACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTc < 1:847141/143‑1 (MQ=255) acgttGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCt < 1:528658/140‑1 (MQ=255) ggAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAg > 1:332780/1‑143 (MQ=255) gAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGc < 2:100133/143‑1 (MQ=255) cccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggtttttacaacgttatGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGGTATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCa < 1:647089‑M1/96‑1 (MQ=255) aTTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTGTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAAc < 1:29151/143‑1 (MQ=255) ttGTCCGGAAGGGGGTCCGTGTCGGGAGCGCGTTACCGTTAAACCGGATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCGGGTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGGTCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACa < 2:1261838/143‑1 (MQ=14) tGTCCCGAAACGAACCCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTGATCATGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGTGCAATACCCCGCAGTTTCGGCCGATCGCTGAGACATTTGAGGGAGGCTTGGTAGTCTTCCCGCacctg > 2:547097/1‑139 (MQ=255) ttaaaaaaacagctgggcattcggtttttacaacgttatGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCa > 1:796724‑M1/40‑143 (MQ=255) ttaaaaaaacagctgggcattcggtttttacaacgttatGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCa > 1:169504‑M1/40‑143 (MQ=255) gccgatcGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCa < 2:255757/137‑1 (MQ=255) ccGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCACTACCCTGCAGTGTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCGTTGTAGTCTTCCAGCAACAGGTCa > 2:1166810/1‑143 (MQ=255) ccGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCa < 1:1108882/143‑1 (MQ=255) ccGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGATGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCCACAGTTCa > 1:30114/1‑143 (MQ=255) ggaaggggTGCGCTGCGGGGCACCGTGACCGTTAAACGTGAGCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGc < 1:1188337/138‑1 (MQ=14) gTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAGAGTCCAgtt > 1:1035854/1‑143 (MQ=255) tttCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGCTCGCTGAGATCTGTGAGGGGGGAGCCCGCGCCGTCCAGCACCAGATCAGCAAAGTCCATTTc > 2:1240135/1‑143 (MQ=17) tCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGa < 1:997866/143‑1 (MQ=255) ctgtacacCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGaa < 2:548497/139‑1 (MQ=255) gggACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTCCTGTTGGGCAATACTCTTCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAg < 1:174338/143‑1 (MQ=255) ccggtacccttaAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGTGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTGCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGcga < 2:1281205/143‑1 (MQ=255) gttaccgttaAACGTTATCAGATATGTTTAAAACTGATCTGTTGTGCAATACACTGCAGTATCAAGAGATCGATGAGATATTTCAACAAAGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGATCAGCAAAGTACAATTCGAATCAGcgaag > 2:238863/1‑141 (MQ=9) ttaccgttaAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGcgacga < 1:713635/143‑1 (MQ=255) cgttaAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTTTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGCcaca > 1:972357/1‑143 (MQ=255) gTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGCAGCCGCGACGCCACCTAATgcgg > 1:128837/1‑142 (MQ=255) gTTATCAGGTATGTTTAAAGCGGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCGTTTCGAAGCCGCGACGACGCCTTATgcgc > 1:759929/1‑143 (MQ=11) ttttgggTATGTTTAAGGGTGTTCTGTTGGGCAATACGCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGCAt < 2:1097910/138‑1 (MQ=255) tATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGCAt < 1:1201540/143‑1 (MQ=35) tATCAGGGATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGCAt < 1:526114/143‑1 (MQ=21) aTCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTAGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGCATc < 1:358839/143‑1 (MQ=25) cAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGTCAATCCCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGTGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGCATcac < 2:789745/143‑1 (MQ=255) tAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGAGCATCACCACGATGTCg > 2:161662/1‑143 (MQ=17) aGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGAGATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGCATCACCACGCTGTCGGTg > 2:123864/1‑143 (MQ=17) gttctgttGGGGAATACGCTGCAGTTTCGGGTGAGCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCtt < 2:377746/143‑1 (MQ=12) ggtctgttGGGCACTCCCCTGCAGTTGCGGGTGATCGCTGAGATATTGCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCtt < 1:547097/141‑1 (MQ=255) ttctgttGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTGCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGCGACAGAATGCGCAGCACCACGATATAGGTGGCGTc > 2:125127/1‑143 (MQ=11) ttGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCAccgc > 1:824536/1‑143 (MQ=11) | CCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGC > NC_000913/1570527‑1570811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |