Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,002,402 | 0 | G | A | 5.7% | 446.1 / 8.1 | 162 | intergenic (+26/+17) | corA/yigF | Ni(2(+))/Co(2(+))/Mg(2(+)) transporter/DUF2628 domain‑containing protein YigF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (64/86); new base A (7/3); total (72/90) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.10e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
TTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAG > NC_000913/4002263‑4002544 | ttGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTaa < 2:89767/143‑1 (MQ=255) ttGAGTGTATGTGAGAACTGGAGTGGAGCTGCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTaa < 1:1105472/143‑1 (MQ=255) ggAGTTTGGGCCAGATCTGAAGTGGAGCTTCGCCTACCCGGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGCCAGACTAAg < 2:38319/142‑1 (MQ=255) gAGGTTATGCCACAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGc < 1:1100069/143‑1 (MQ=255) 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1:216918/143‑1 (MQ=255) caggTGGCTTAGCCAGACTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTa < 1:1161060/141‑1 (MQ=255) cGGTGGCTTAGTCTGGCTACGCCTCCTGTTATTCAAGGGCTCCAGGGATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCAGCGAGCCGGTTGTGCGTGTTAACAGCAACAGAGGCTGCTACGGCTATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAg < 2:150733/143‑1 (MQ=255) aggTGGCTTAGCCAGACTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAg > 1:293623/2‑143 (MQ=255) gTGGCTTAGTCTGGCGAAGCCGCCTGTTATTCAACGGCTCCAGGTATGTAACCCGTGTACCTCTCTCTCATAGAACCATGTGTTCGTGTTCACAGCAACGTAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTg < 2:874423/143‑1 (MQ=255) gTGGCTTAGCCAGACTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACGCTTTTACCTCTTTCTATTAGAAGCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGGAGTTGCGAGAATGTTAGCGTCACTTAGTg > 2:1039346/1‑143 (MQ=255) 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1:907895/1‑143 (MQ=255) gCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATag < 2:755528/143‑1 (MQ=255) gCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATag > 1:1127979/1‑143 (MQ=255) | TTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAG > NC_000913/4002263‑4002544 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |