Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NC_000913 1196270 1211439 15170 15 [14] [14] 16 [icd]–[icdC] [icd],ymfD,ymfE,lit,intE,xisE,ymfH,ymfI,ymfJ,ymfK,ymfT,ymfL,ymfM,oweE,ymfN,aaaE,ymfR,beeE,jayE,ymfQ,ycfK,tfaP,tfaE,stfE,pinE,mcrA,[icdC]

ACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCT  >  NC_000913/1211409‑1211582
                               |                                                                                                                                              
gatgaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAGTCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTAGAACGTCTGATGGAAGGCGCTTAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTg                                 >  2:142593/5‑143 (MQ=255)
   gaTGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGAACGTCAGCTTCGTCCTTAAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTg                              >  1:885044/2‑143 (MQ=17)
       ctgcGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGATTGGTGAAGc                          >  2:272419/1‑143 (MQ=255)
             cATAGGGGTTCGCCGAAAGCGGCTTACCTGATTGTTAAACGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGatcat                    <  2:387415/143‑1 (MQ=18)
              atatGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGatcatc                   >  2:193590/1‑143 (MQ=255)
              atagGGGTTGGACTGAAGCGGCTGAGCTGGTTGTTGAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGatcatc                   <  2:29588/143‑1 (MQ=255)
                atGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGa                 >  1:308369/1‑143 (MQ=255)
                 ggggTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGaa                <  1:262029/142‑1 (MQ=255)
                   ggTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTCTGGTGAAGCGATCATCGaaaa              >  2:31573/1‑143 (MQ=255)
                      tGGACTGCAGCCGCTGACCTGATTGTTAAACGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACTTCTGATTGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACAt           <  1:59329/143‑1 (MQ=18)
                        gACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGACGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGt         <  2:239275/143‑1 (MQ=255)
                          cTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTaa       >  2:303812/1‑143 (MQ=255)
                           tGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGGTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAACGATCAGCGAAAACATGTAAt      >  2:257456/1‑143 (MQ=255)
                             aaGCGGCTGACCGGATTGTTAAAGGGATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTGCTGACGTCGAACGTAGGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCCGAGTTTGGTGGAGCGCTCATCGACAACATGTAAcct    >  1:344984/1‑143 (MQ=255)
                               gCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtctct  <  1:523022/143‑1 (MQ=255)
                               gCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTAGGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGCTGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTCAtctct  >  2:65849/1‑143 (MQ=255)
                               |                                                                                                                                              
ACTAATGCTGCGCCATATGGGTTGGACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCT  >  NC_000913/1211409‑1211582

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: