| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,184,543 | C→A | P1100Q (CCG→CAG) | rpoB → | RNA polymerase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,184,543 | 0 | C | A | 96.2% | 224.6 / NA | 82 | P1100Q (CCG→CAG) | rpoB | RNA polymerase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base A (38/39); total (40/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGC > NC_000913/4184405‑4184683 | tGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGGGCACAACAGGGC‑GGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAGGGTAAGAGCGATCGAGGAGGTGTCGTTCGAGGAGGACGGTGCGTCGTTAGACAGCGTACTGAACCAGCTg > 2:434438/1‑143 (MQ=255) gTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGt > 2:134339/1‑143 (MQ=255) gTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGt > 1:322424/1‑143 (MQ=255) gTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTAGGCGt > 2:610420/1‑143 (MQ=255) ttAAACGCCGTATCCAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTAGGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGtg > 1:496044/1‑142 (MQ=255) ttAAACGCCGTATCCAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTa > 2:568618/1‑143 (MQ=255) caaaCGCCGTATCCAGCGTGGGG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGGAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATACCCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTAc < 2:872568/142‑1 (MQ=255) aCGCCGTATCCAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGCTATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGt > 1:444742/1‑143 (MQ=255) aCGCCGTATCCAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTCCGATGAAAACGGTACGCCGGTCGACATCGTACTGACCCCGCTGGGCGTACCGt > 1:815011/1‑143 (MQ=255) aCGCCGTATCCAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGt > 2:353974/1‑143 (MQ=255) cGCCGTGTGCAGCCGGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGGCGCGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACTCGATCGAAGATAGGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGtc < 2:303466/143‑1 (MQ=255) gCCGTATCCAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTTCGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGACGTACCGtct > 1:524900/1‑143 (MQ=255) ccgtcaccAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGCCGTCACGGTAACAAGGGTGTCATTTCTAAGATCAACCCGATCGACGATCTGCCCTCCGCTGCAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGACCCAGCTGGGCGTACCGtctc < 1:858501/137‑1 (MQ=255) ccGTATCCAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACGAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGAGGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGtctc < 1:80744/143‑1 (MQ=255) cGTATCCAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGCGTAGTTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGAGATGCCTTACGATGAAACCGGTACGCCGGTAGACACCGTACTCAGCCAGCGGGGGGTACCGTCCCg > 2:881870/1‑143 (MQ=255) tATCCAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTCGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGGACCGTCACGTa > 2:50314/1‑143 (MQ=255) gaTCCAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGCCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTa < 1:539847/142‑1 (MQ=255) gCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGCTATGCCTTACGATGACAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTCGCCCAGCTGGCCTTCCCGTCCCGTATGaaag > 1:254496/1‑141 (MQ=255) tGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCCCGTATGAACATCg > 2:448822/1‑143 (MQ=255) tG‑ACAAGCTGGGAGGTCGTCACGGTTCAACGGGTGTCCTTTCTAAGTTAGAACCGCTGGCGGTTATGCCTTTAGATGCAAACGGTACGCCGGTAGACGCAGTGTACACGGTGTTGAGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTc < 2:16698/143‑1 (MQ=255) g‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTATCGTCTCGTATGACCATCGGTCa > 1:748048/1‑143 (MQ=255) g‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGACCATCGGTCa > 2:142559/1‑143 (MQ=255) gagaaGAGGGGAGGTCGTCAGGGTAAGAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGGGGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACAGTCTCGTATGAACATCGGTCa < 2:283186/140‑1 (MQ=255) aCAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACAACGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCCCGTAGGAACAACGGTccg > 1:63441/1‑141 (MQ=255) aaGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATAGAAGATATGCCTTGCGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGGACTGAGCCAGCTGGGCGAAACATCTCGTAAGAACAACggcaagac > 2:446326/1‑137 (MQ=255) gATGGCAGGTCGTCACGGGAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAGCCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATcc < 2:484889/143‑1 (MQ=255) gATGACATGTCGTCGCGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATcc < 2:484998/143‑1 (MQ=255) tGGCAGGTCGTCACGGGAACAAGGGTGTAATTTCTCAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTc < 1:303022/143‑1 (MQ=255) ggCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAGCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCg < 2:644530/143‑1 (MQ=255) tggTTGTCACGGGAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCGACCCGATCGAAGCTATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 2:501569/142‑1 (MQ=255) aGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 1:378691/143‑1 (MQ=255) tcgtcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAAccc > 2:623903/1‑143 (MQ=255) tcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGCAACCCAcc > 2:75715/1‑143 (MQ=255) tcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGCCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCAcc < 1:459129/143‑1 (MQ=255) cGGTAATGAGGGTGTATTTTCTAGGACCGACCCGGTCGAAGATATGCCTTACGATGGAAGGGGTACGCTGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGTGCGTCTCGTCTCCTATCAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTgg < 2:106415/143‑1 (MQ=255) aCAAGGGTGTAATCTCTAAGCTCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGTCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATg < 2:556743/143‑1 (MQ=255) aaGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCACGAAACCCACCTGGGTATGGc > 2:504327/1‑143 (MQ=255) tgtAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGa > 1:708722/1‑143 (MQ=255) tAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGaaa < 1:623903/143‑1 (MQ=255) tAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGaaa < 1:470498/143‑1 (MQ=255) tAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAACGGTATCg > 1:867449/1‑143 (MQ=255) tAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCg < 1:37285/143‑1 (MQ=255) tAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCGTACGATGAAAACGGTACGACGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCGAGTATGAACATCGGACAGAAACGCGAAACCCCACGGGGGATGGCGGGGAAAGGTacag > 2:681412/1‑140 (MQ=255) tacaTCAACCCGATCGAATATATGCCTTACGATCAAAGCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCgg < 2:790979/140‑1 (MQ=255) gagcAAACCGATCGAAGATATGCCTTACGAGGAAAACGGTACGTCGGTGCACATCCTATTGTCCCAGCTTGGCCGACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCg < 2:393136/140‑1 (MQ=255) aCCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAACCCCACCTGGCTATGGCTGCGCGTGGTCTCGGAGCCAAg > 1:802270/1‑143 (MQ=255) cccGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTACCGGCGACAAgc > 2:646904/1‑142 (MQ=255) ccGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGAcgtgat > 1:174552/1‑138 (MQ=255) ccGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGAt > 1:605301/1‑143 (MQ=255) cGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGGTCGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGCCTCGTATGAGCATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGACTGTGAAAGGTATCGGCGACAAGATc < 2:541325/143‑1 (MQ=255) aTCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCaa > 1:347913/1‑143 (MQ=255) tCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAAc < 1:434438/143‑1 (MQ=255) ccacgATATGCCTTACGATGACAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACg < 2:98950/139‑1 (MQ=255) aaGATTTGCCTTGCGGTGGAAGCGGTACGCCGGTAGACATCGTACGGACCCAGCTGGTCGTACCGTCTCGTCCGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGcc < 2:430296/143‑1 (MQ=255) atatGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGCCCAACGCCCTg > 1:151775/1‑143 (MQ=255) tGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCGGGGCGTACCGTCACGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTg < 1:453551/143‑1 (MQ=255) ttACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAc > 2:803854/1‑143 (MQ=255) cGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAcagc < 1:822154/143‑1 (MQ=255) gATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGCATGAACATCCGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAcagca < 1:453288/143‑1 (MQ=255) gtgagaccGGTACGTCGGTAGATATCGTACTGAACCAGCTCGGCGTACCGTCTCGTATGAAGATCGGTCAGATCCTCGAAACTCACCTGGGTATGGCTGCGAACGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAcagcag < 2:754495/136‑1 (MQ=255) aTGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAcagcag < 1:674409/143‑1 (MQ=255) tgaacgcGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAGCCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACagcagc < 2:785222/137‑1 (MQ=255) tGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAcagccga > 2:623097/1‑140 (MQ=255) gAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAGAgcggca > 1:305508/1‑143 (MQ=255) gAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGCATGGCTGCGGAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAgcagca > 1:304357/1‑143 (MQ=255) cGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGGCGCaagaag > 2:251657/1‑143 (MQ=255) tACGCCGGTAGACGTCGTACTGAACCAGCTGGGCGTAGCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCCCCTTGGTATTGCTGCGCAATGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTcg < 1:799579/143‑1 (MQ=255) caCGCAGGGAGAGGTCGTACTGAGGCGGGCGGGCCTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCGCCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTcg < 2:658218/142‑1 (MQ=255) aCGCCGGTAGACAGCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTcgc < 1:767292/143‑1 (MQ=255) gCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGa < 1:134339/143‑1 (MQ=255) ctgTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGaaa < 1:765056/141‑1 (MQ=255) tAGACATCGTACGGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTg < 2:739561/143‑1 (MQ=255) aggcATCGTACTGAACGAGCTGGGCGTACCGTGTCGTAGGAACATCGGTCAGATCCTGGAGACCCACCTGGGTATGGCTGGGAAAGGTATAGGGGACAAGAGCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTgc < 2:502166/140‑1 (MQ=255) gcttCGTACTGATCCAGCTGGGCGTACGGTCGCGTAGGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTgcgc < 1:72960/140‑1 (MQ=255) gTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTATCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGGATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGGCAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGACGCGAAACTGAGCGaact > 2:340902/1‑141 (MQ=255) gTACTGAACCAGCTGGGCGTACCATCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCCCGAAGCTGCGCGGAtt > 1:301019/1‑143 (MQ=255) tACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTc < 1:140914/143‑1 (MQ=255) aCTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCa < 1:3003/143‑1 (MQ=255) cTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCAt > 1:743258/1‑143 (MQ=255) aaCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTCTGGCTGCGCAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAACAGCAAGAAGGCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCa > 1:105312/1‑143 (MQ=255) aaCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTCTCGGAGACACAACCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCa > 1:409351/1‑143 (MQ=255) aCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAg < 1:213761/143‑1 (MQ=255) cccGCTGGTCGTACCGTCTCCGATGGACTTCGGTCAGGTCCACCAAACCCTCCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAgc < 2:254496/143‑1 (MQ=255) | TGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTG‑ACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGC > NC_000913/4184405‑4184683 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |